52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1270 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1270  proteinase inhibitor I4 serpin  100 
 
 		 351 aa  668    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.694438  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13780  serine protease inhibitor  48.65 
 
 		 375 aa  282  8.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.216143  normal  0.0648597 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2877  proteinase inhibitor I4 serpin  39.78 
 
 		 367 aa  188  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.129029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1933  proteinase inhibitor I4, serpin  39.61 
 
 		 366 aa  162  7e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192792  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0883  proteinase inhibitor I4 serpin  31.03 
 
 		 448 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15772  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0222  serine protease inhibitor family protein  30.59 
 
 		 426 aa  152  8.999999999999999e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_198  serine protease inhibitor protein  30.31 
 
 		 426 aa  151  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1296  proteinase inhibitor I4 serpin  28.81 
 
 		 427 aa  145  1e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00386806  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1230  proteinase inhibitor I4, serpin  31.55 
 
 		 415 aa  145  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0460  proteinase inhibitor I4, serpin  31.2 
 
 		 434 aa  145  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0999563  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1417  proteinase inhibitor I4 serpin  25.61 
 
 		 401 aa  139  7e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000100118  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1826  proteinase inhibitor I4 serpin  28.69 
 
 		 429 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0107  proteinase inhibitor I4 serpin  28.29 
 
 		 413 aa  137  4e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0732636  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4673  proteinase inhibitor I4, serpin  26.98 
 
 		 442 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0104  proteinase inhibitor I4 serpin  34.47 
 
 		 424 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414663  normal  0.0601662 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1669  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.49 
 
 		 400 aa  130  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1725  proteinase inhibitor I4 serpin  29.03 
 
 		 431 aa  130  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4176  proteinase inhibitor I4 serpin  34.57 
 
 		 430 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0132  proteinase inhibitor I4, serpin  28.65 
 
 		 426 aa  125  1e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1363  proteinase inhibitor I4 serpin  28.77 
 
 		 424 aa  123  6e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.525887  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3664  proteinase inhibitor I4 serpin  27.22 
 
 		 393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000611226  normal  0.325376 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0702  proteinase inhibitor I4, serpin  23.24 
 
 		 420 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1742  proteinase inhibitor I4, serpin  22.46 
 
 		 450 aa  114  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2010  proteinase inhibitor I4 serpin  26.03 
 
 		 432 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.855565 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0529  proteinase inhibitor I4, serpin  21.74 
 
 		 422 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0717  proteinase inhibitor I4 serpin  25.72 
 
 		 344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2110  proteinase inhibitor I4 serpin  31.83 
 
 		 500 aa  106  6e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5492  proteinase inhibitor I4 serpin  25.85 
 
 		 412 aa  106  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1900  proteinase inhibitor I4 serpin  25.43 
 
 		 413 aa  103  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2014  proteinase inhibitor I4 serpin  24.64 
 
 		 420 aa  99.8  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0190  proteinase inhibitor I4, serpin  21.28 
 
 		 600 aa  99.4  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.927493  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1270  proteinase inhibitor I4, serpin  21.83 
 
 		 407 aa  97.8  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2013  proteinase inhibitor I4 serpin  23.77 
 
 		 420 aa  97.1  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04150  serine protease inhibitor  29.11 
 
 		 418 aa  96.3  7e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.393298  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0296  proteinase inhibitor I4 serpin  25.81 
 
 		 423 aa  95.5  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0395  proteinase inhibitor I4 serpin  29.3 
 
 		 475 aa  94.7  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0038  proteinase inhibitor I4 serpin  33.33 
 
 		 403 aa  91.3  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0592  proteinase inhibitor I4, serpin  27.59 
 
 		 431 aa  87  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7222  serine (or cysteine) proteinase inhibitor, clade B (ovalbumin), member  32.28 
 
 		 415 aa  87  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.946745  normal  0.324248 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4299  proteinase inhibitor I4 serpin  24.22 
 
 		 429 aa  82.8  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0655436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0126  serine proteinase inhibitor  25 
 
 		 465 aa  82  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.423164  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0130  proteinase inhibitor I4 serpin  25.3 
 
 		 445 aa  80.5  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0191  proteinase inhibitor I4, serpin  22.22 
 
 		 599 aa  79  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1947  proteinase inhibitor I4 serpin  31.67 
 
 		 426 aa  77.4  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0171189 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1921  proteinase inhibitor I4 serpin  28.18 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.705743 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0744  proteinase inhibitor I4, serpin  26.87 
 
 		 380 aa  73.9  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0682  proteinase inhibitor I4, serpin  26.84 
 
 		 560 aa  62.8  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0455  proteinase inhibitor I4, serpin  26.67 
 
 		 385 aa  53.5  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7212  proteinase inhibitor I4 serpin  28.17 
 
 		 394 aa  52.8  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.743883  normal  0.0513448 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0689  Serine protease inhibitor-like protein  31.82 
 
 		 88 aa  47.8  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.165227  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0925  proteinase inhibitor I4 serpin  35.53 
 
 		 421 aa  47.8  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0801  proteinase inhibitor I4, serpin  24.7 
 
 		 408 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>