More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1440 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1440  secretion protein HlyD  100 
 
 		 376 aa  729    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0176  RND family efflux transporter MFP subunit  46.73 
 
 		 353 aa  281  1e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371241 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01736  HlyD family secretion protein  40.18 
 
 		 349 aa  243  3e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2179  RND family efflux transporter MFP subunit  38.86 
 
 		 361 aa  229  7e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000248395  normal  0.140593 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1036  RND family efflux transporter MFP subunit  37.62 
 
 		 354 aa  226  6e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0703  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.69 
 
 		 355 aa  225  8e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1906  HlyD family-like protein  40.39 
 
 		 361 aa  224  1e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000977353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2338  RND family efflux transporter MFP subunit  39.8 
 
 		 360 aa  224  3e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00136978  hitchhiker  0.0000141161 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2410  RND family efflux transporter MFP subunit  39.8 
 
 		 360 aa  224  3e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000315716  hitchhiker  0.00636413 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1658  RND family efflux transporter MFP subunit  39.8 
 
 		 360 aa  223  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000232607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  40.48 
 
 		 361 aa  223  4e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000249801  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2665  RND family efflux transporter MFP subunit  40.48 
 
 		 360 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000267288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2550  RND family efflux transporter MFP subunit  39.41 
 
 		 360 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000229958  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1796  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.41 
 
 		 360 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000436323  hitchhiker  0.00000011193 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2588  RND family efflux transporter MFP subunit  40.14 
 
 		 360 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000707575  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3204  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.64 
 
 		 368 aa  220  3e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1982  RND family efflux transporter MFP subunit  35.59 
 
 		 360 aa  220  3e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000542821  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1881  HlyD family-like protein  38.31 
 
 		 360 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2428  RND family efflux transporter MFP subunit  37.54 
 
 		 361 aa  216  4e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00201655  decreased coverage  0.00000151053 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0266  RND family efflux transporter MFP subunit  40.32 
 
 		 375 aa  215  9.999999999999999e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.987776 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1866  RND family efflux transporter MFP subunit  35.42 
 
 		 385 aa  208  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000232808  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01922  RND efflux membrane fusion protein  39.87 
 
 		 318 aa  206  4e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1737  secretion protein HlyD  35.22 
 
 		 360 aa  206  5e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000190652  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  39.76 
 
 		 374 aa  199  6e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004022  membrane-fusion protein  36.01 
 
 		 369 aa  198  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000160707  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1851  RND family efflux transporter MFP subunit  37.22 
 
 		 361 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000181813  hitchhiker  0.00565244 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  37.16 
 
 		 340 aa  189  8e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3927  RND family efflux transporter MFP subunit  33.44 
 
 		 392 aa  188  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0200  secretion protein HlyD  33.89 
 
 		 365 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2322  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.94 
 
 		 371 aa  183  3e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0437768 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3700  secretion protein HlyD  35.12 
 
 		 381 aa  181  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01444  hypothetical protein  34.42 
 
 		 350 aa  178  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2095  secretion protein HlyD  37.16 
 
 		 354 aa  178  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3889  RND family efflux transporter MFP subunit  35.21 
 
 		 364 aa  176  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1963  putative secretion protein, HlyD family  32.22 
 
 		 390 aa  177  4e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000072673  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3803  RND family efflux transporter MFP subunit  33.14 
 
 		 376 aa  176  5e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2132  HlyD family secretion protein  38.98 
 
 		 360 aa  176  6e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.732379  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  36.76 
 
 		 366 aa  176  6e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2001  secretion protein HlyD  34.7 
 
 		 375 aa  176  8e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.167131  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3081  RND family efflux transporter MFP subunit  35.49 
 
 		 371 aa  176  9e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.153012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3313  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 369 aa  176  9e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000984298  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0472  secretion protein HlyD  32.48 
 
 		 359 aa  175  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000402153  normal  0.138011 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1201  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.69 
 
 		 369 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000118856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3169  RND family efflux transporter MFP subunit  32.69 
 
 		 369 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000222351  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3170  RND family efflux transporter MFP subunit  32.69 
 
 		 369 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0438  hypothetical protein  33.56 
 
 		 352 aa  171  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000466929  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  32.93 
 
 		 381 aa  168  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.421019  normal  0.31825 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1177  RND family efflux transporter MFP subunit  32.9 
 
 		 417 aa  167  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4492  secretion protein HlyD  33.13 
 
 		 382 aa  166  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226833 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2237  secretion protein HlyD  32.91 
 
 		 377 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.88 
 
 		 388 aa  166  5e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  33.04 
 
 		 370 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1156  RND family efflux transporter MFP subunit  33.54 
 
 		 370 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000311518  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  33.23 
 
 		 370 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1150  RND family efflux transporter MFP subunit  33.04 
 
 		 373 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000335121  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1194  acriflavin resistance periplasmic protein  31.76 
 
 		 380 aa  162  9e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3483  HlyD family secretion protein  30.92 
 
 		 369 aa  162  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2786  RND family efflux transporter MFP subunit  31.34 
 
 		 372 aa  161  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000125206  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4943  RND efflux membrane fusion protein precursor  33.13 
 
 		 375 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56880  putative membrane fusion protein  33.04 
 
 		 376 aa  160  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.06 
 
 		 363 aa  159  6e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1554  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.06 
 
 		 363 aa  159  6e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0484603  hitchhiker  0.00000015248 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0930  RND family efflux transporter MFP subunit  31.16 
 
 		 366 aa  157  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0856  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.71 
 
 		 370 aa  158  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.38 
 
 		 380 aa  157  4e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0465471  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2781  RND family efflux transporter MFP subunit  32.14 
 
 		 372 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00032103  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3650  secretion protein HlyD  35.43 
 
 		 397 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1999  RND family efflux transporter MFP subunit  32.14 
 
 		 390 aa  156  7e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00132105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4297  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.93 
 
 		 397 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.430357  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0975  RND family efflux transporter MFP subunit  32.52 
 
 		 382 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0109715 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3495  RND family efflux transporter MFP subunit  30.3 
 
 		 365 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0946  RND family efflux transporter MFP subunit  31.61 
 
 		 382 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0907  RND efflux membrane fusion protein-related protein  31.31 
 
 		 406 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0944  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.52 
 
 		 387 aa  152  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00241764 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0364  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.67 
 
 		 362 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.405995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1809  secretion protein HlyD  34.44 
 
 		 397 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3475  secretion protein HlyD-like protein  28.03 
 
 		 373 aa  151  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.555415 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1057  RND family efflux transporter MFP subunit  29.34 
 
 		 373 aa  150  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1710  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.23 
 
 		 377 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1023  RND family efflux transporter MFP subunit  31.64 
 
 		 378 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.866452  normal  0.121232 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1637  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.23 
 
 		 377 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4327  HlyD family secretion protein  26.63 
 
 		 372 aa  149  8e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0767  RND family efflux transporter MFP subunit  30.57 
 
 		 372 aa  149  9e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00075698  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0383  RND family efflux transporter MFP subunit  35.87 
 
 		 365 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1044  RND family efflux transporter MFP subunit  35.87 
 
 		 365 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0078  RND family efflux transporter MFP subunit  35.87 
 
 		 365 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2174  RND family efflux transporter MFP subunit  28.85 
 
 		 394 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.290725  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1266  RND family efflux transporter MFP subunit  31.67 
 
 		 371 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000032302  hitchhiker  0.00027333 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0031  RND family efflux transporter MFP subunit  35.87 
 
 		 365 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1201  RND family efflux transporter MFP subunit  35.87 
 
 		 365 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0341767  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1030  RND family efflux transporter MFP subunit  29.74 
 
 		 365 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000101532  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0372  RND family efflux transporter MFP subunit  26.35 
 
 		 372 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2619  RND family efflux transporter MFP subunit  33.43 
 
 		 405 aa  147  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.43 
 
 		 362 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1580  RND family efflux transporter MFP subunit  33.77 
 
 		 365 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610408  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1496  RND family efflux transporter MFP subunit  33.77 
 
 		 365 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1288  RND family efflux transporter MFP subunit  34.1 
 
 		 365 aa  146  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1089  hypothetical protein  29.3 
 
 		 382 aa  145  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1650  secretion protein HlyD  31.72 
 
 		 397 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0870  acriflavin resistance periplasmic protein  29.47 
 
 		 351 aa  145  1e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>