More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3934 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 450 aa  936    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  54.63 
 
 		 448 aa  512  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  50.9 
 
 		 478 aa  476  1e-133  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  50.34 
 
 		 466 aa  461  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  48.84 
 
 		 432 aa  452  1.0000000000000001e-126  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  48.83 
 
 		 448 aa  420  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000057004 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3168  ATPase central domain-containing protein  50.79 
 
 		 434 aa  412  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0578626  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  44.73 
 
 		 442 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  47.76 
 
 		 450 aa  389  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  43.69 
 
 		 450 aa  387  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5237  AAA ATPase central domain protein  43.45 
 
 		 459 aa  372  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.368199  hitchhiker  0.00000000902621 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3136  AAA ATPase, central region  40.75 
 
 		 478 aa  335  1e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  43.22 
 
 		 441 aa  333  3e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  41.4 
 
 		 787 aa  226  4e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  43.24 
 
 		 744 aa  210  4e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2258  AAA ATPase central domain protein  43.58 
 
 		 680 aa  209  7e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226213  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2559  AAA ATPase  39.17 
 
 		 444 aa  205  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000494228 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  40.47 
 
 		 743 aa  204  4e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1734  AAA ATPase central domain protein  42.86 
 
 		 697 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.168086 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  43.24 
 
 		 656 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2933  AAA ATPase central domain protein  42.64 
 
 		 689 aa  195  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1943  AAA ATPase central domain protein  43.51 
 
 		 619 aa  194  3e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00697304  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  38.82 
 
 		 652 aa  194  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  44.59 
 
 		 1085 aa  192  8e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  41.31 
 
 		 656 aa  192  8e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  39.8 
 
 		 657 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  42.97 
 
 		 639 aa  190  5.999999999999999e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3811  ATPase central domain-containing protein  41.11 
 
 		 788 aa  189  7e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  41.92 
 
 		 653 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  40.65 
 
 		 662 aa  183  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  39.92 
 
 		 725 aa  183  5.0000000000000004e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1753  ATPase central domain-containing protein  40.65 
 
 		 450 aa  183  5.0000000000000004e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0859  AAA ATPase  43.75 
 
 		 634 aa  181  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5393  AAA ATPase central domain protein  36.17 
 
 		 682 aa  178  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4397  AAA ATPase central domain protein  39.62 
 
 		 687 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  40.15 
 
 		 665 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0938  ATPase central domain-containing protein  42.73 
 
 		 671 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  42.11 
 
 		 749 aa  175  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1133  AAA ATPase, central region  39.18 
 
 		 445 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1893  AAA ATPase central domain protein  41.36 
 
 		 698 aa  172  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103439  normal  0.0680609 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1020  AAA ATPase central domain protein  38.98 
 
 		 646 aa  171  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3054  ATPase central domain-containing protein  41.23 
 
 		 725 aa  166  6.9999999999999995e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821112 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2009  AAA ATPase central domain protein  37.67 
 
 		 1193 aa  166  9e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1864  AAA ATPase central domain protein  39.53 
 
 		 678 aa  149  9e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0827  AAA ATPase, central region  39.71 
 
 		 697 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934037  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3668  AAA ATPase central domain protein  56.35 
 
 		 134 aa  147  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1822  ATPase central domain-containing protein  33.22 
 
 		 622 aa  146  9e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  34.25 
 
 		 570 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  34.51 
 
 		 577 aa  137  4e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  30.8 
 
 		 569 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  32.14 
 
 		 578 aa  129  8.000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  29.8 
 
 		 570 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  29.8 
 
 		 570 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  29.41 
 
 		 570 aa  127  3e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4054  AAA ATPase, central region  34.62 
 
 		 299 aa  124  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0357172 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  29.55 
 
 		 580 aa  123  7e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0869  AAA ATPase family protein  31.72 
 
 		 352 aa  121  3e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000165138  normal  0.784704 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1890  AAA ATPase central domain protein  37.02 
 
 		 367 aa  114  5e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.439906  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  35.68 
 
 		 305 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1882  ATPase central domain-containing protein  32.39 
 
 		 617 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0172  ATPase central domain-containing protein  30.58 
 
 		 387 aa  107  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0025  AAA ATPase central domain protein  33.86 
 
 		 443 aa  102  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2297  AAA ATPase, central region  33.33 
 
 		 228 aa  100  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.754524 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1672  ATPase central domain-containing protein  34.5 
 
 		 369 aa  99.4  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00463679  normal  0.710335 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  30.49 
 
 		 370 aa  97.4  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4244  AAA ATPase, central region  38.85 
 
 		 686 aa  94.4  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000108013 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  30.58 
 
 		 428 aa  94  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  32.12 
 
 		 776 aa  94  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  31.4 
 
 		 425 aa  94  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2640  ATPase central domain-containing protein  26.13 
 
 		 332 aa  93.2  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288063  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  31.03 
 
 		 493 aa  93.6  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  30.27 
 
 		 419 aa  93.2  7e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3822  ATPase central domain-containing protein  32 
 
 		 322 aa  93.2  8e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0247422 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  31.25 
 
 		 424 aa  93.2  9e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  34.59 
 
 		 391 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4417  ATPase central domain-containing protein  29.26 
 
 		 327 aa  91.3  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  34.48 
 
 		 335 aa  91.3  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0165  putative ATPase protein  40.44 
 
 		 772 aa  91.3  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4276  ATPase central domain-containing protein  29.26 
 
 		 327 aa  91.3  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1017  hypothetical protein  29.92 
 
 		 427 aa  90.9  4e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2234  AAA ATPase, central region  33.5 
 
 		 766 aa  90.9  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218503  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2275  AAA ATPase, central region  37.04 
 
 		 771 aa  90.9  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0746104  hitchhiker  0.00641076 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  32.16 
 
 		 369 aa  90.9  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3559  ATPase central domain-containing protein  36.43 
 
 		 677 aa  90.5  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1791  AAA ATPase central domain protein  38.52 
 
 		 773 aa  90.1  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2115  AAA ATPase central domain protein  38.52 
 
 		 773 aa  90.1  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00930684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  30.09 
 
 		 348 aa  89.7  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.36 
 
 		 718 aa  89.7  9e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1088  ATPase central domain-containing protein  35.54 
 
 		 397 aa  89.4  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0150  AAA ATPase central domain protein  38.1 
 
 		 775 aa  89  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  30.19 
 
 		 468 aa  89  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  38.3 
 
 		 308 aa  88.6  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1073  AAA ATPase central domain protein  29.34 
 
 		 328 aa  89  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1765  ATPase central domain-containing protein  37.14 
 
 		 655 aa  88.6  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.835623  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  32.58 
 
 		 336 aa  89  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  34.9 
 
 		 703 aa  88.6  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  29.41 
 
 		 393 aa  88.2  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0166  AAA ATPase, central region  36.3 
 
 		 789 aa  88.2  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  34.18 
 
 		 699 aa  87.8  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.98 
 
 		 739 aa  87.8  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>