More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1599 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1599  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 862 aa  1740    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2052  MscS Mechanosensitive ion channel  27.9 
 
 		 810 aa  337  5.999999999999999e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2162  periplasmic binding protein; mechanosensitive ion channel component  29 
 
 		 794 aa  336  1e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3392  MscS Mechanosensitive ion channel  28.05 
 
 		 833 aa  320  5e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3343  mechanosensitive ion channel protein  27.38 
 
 		 813 aa  301  4e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.183155 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6057  MscS Mechanosensitive ion channel  26.28 
 
 		 779 aa  276  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2049  MscS mechanosensitive ion channel  27.89 
 
 		 783 aa  239  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  24.3 
 
 		 842 aa  199  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  35.87 
 
 		 806 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3012  MscS mechanosensitive ion channel  39.6 
 
 		 297 aa  156  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3407  MscS mechanosensitive ion channel  35.5 
 
 		 832 aa  155  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1587  MscS mechanosensitive ion channel  36.49 
 
 		 807 aa  155  4e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.370206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  33.94 
 
 		 843 aa  155  4e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2646  MscS mechanosensitive ion channel  34.96 
 
 		 322 aa  154  5.9999999999999996e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  36.9 
 
 		 291 aa  154  7e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1712  MscS mechanosensitive ion channel  37.44 
 
 		 291 aa  153  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  35.85 
 
 		 981 aa  154  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  38.24 
 
 		 685 aa  152  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  37.78 
 
 		 636 aa  151  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0935  MscS mechanosensitive ion channel  33.96 
 
 		 845 aa  150  7e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  40 
 
 		 636 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  31.62 
 
 		 825 aa  146  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  35.97 
 
 		 830 aa  146  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  35.35 
 
 		 299 aa  146  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  34.63 
 
 		 840 aa  146  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1606  MscS mechanosensitive ion channel  40.32 
 
 		 307 aa  144  5e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.696801  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  31.99 
 
 		 1144 aa  144  5e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0168  potassium efflux protein KefA  37.72 
 
 		 1110 aa  144  6e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0533  MscS Mechanosensitive ion channel  34.12 
 
 		 472 aa  144  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1465  hypothetical protein  29.35 
 
 		 753 aa  144  8e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3304  MscS Mechanosensitive ion channel  33.88 
 
 		 1235 aa  144  9e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2257  MscS mechanosensitive ion channel  36.36 
 
 		 1110 aa  144  9e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371999  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0522  potassium efflux protein KefA  35.71 
 
 		 1118 aa  143  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0528  potassium efflux protein KefA  35.71 
 
 		 1120 aa  143  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3064  potassium efflux protein KefA  37.24 
 
 		 1120 aa  142  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3204  potassium efflux protein KefA  37.24 
 
 		 1120 aa  142  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0581  potassium efflux protein KefA  35.71 
 
 		 1118 aa  143  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.467495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0501  potassium efflux protein KefA  32.03 
 
 		 1134 aa  143  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  35.42 
 
 		 864 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5759  potassium efflux protein KefA  33.33 
 
 		 1118 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738971  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  41.18 
 
 		 435 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2883  potassium efflux protein KefA  37.24 
 
 		 1120 aa  142  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0991479 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0519  potassium efflux protein KefA  35.71 
 
 		 1120 aa  143  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0538  potassium efflux protein KefA  35.71 
 
 		 1118 aa  143  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0500  potassium efflux protein KefA  36.73 
 
 		 1120 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527944  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00416  fused conserved protein  36.73 
 
 		 1120 aa  142  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  36.73 
 
 		 1120 aa  142  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.178032  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0541  potassium efflux protein KefA  36.73 
 
 		 1120 aa  142  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5024  potassium efflux system protein KefA, putative  32 
 
 		 1134 aa  142  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0397  potassium efflux protein KefA  36.73 
 
 		 1120 aa  142  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0555  potassium efflux protein KefA  36.73 
 
 		 1118 aa  142  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.364262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00421  hypothetical protein  36.73 
 
 		 1120 aa  142  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0508  potassium efflux protein KefA  36.73 
 
 		 1120 aa  142  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000540502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3151  potassium efflux protein KefA  36.73 
 
 		 1120 aa  142  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.800258  normal  0.703774 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0945  potassium efflux protein KefA  32.48 
 
 		 1115 aa  142  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  40.45 
 
 		 847 aa  142  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45100  potassium efflux protein KefA  35.74 
 
 		 1117 aa  141  6e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.534635  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3447  mechanosensitive ion channel family protein  33.02 
 
 		 816 aa  140  7e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.597927  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66400  potassium efflux protein KefA  32.94 
 
 		 1118 aa  140  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0399  potassium efflux protein KefA  32.92 
 
 		 1102 aa  140  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2148  small conductance mechanosensitive Ion channel  41.71 
 
 		 847 aa  140  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.667496  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  35.96 
 
 		 796 aa  139  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3036  transporter, putative  36.32 
 
 		 1080 aa  139  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0415629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  35.61 
 
 		 1111 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1130  potassium efflux protein KefA  36.45 
 
 		 1130 aa  138  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000811569 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3172  MscS Mechanosensitive ion channel  28.62 
 
 		 784 aa  139  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1453  MscS mechanosensitive ion channel  37.32 
 
 		 1105 aa  139  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0057  MscS mechanosensitive ion channel  30.99 
 
 		 437 aa  138  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0145  MscS Mechanosensitive ion channel  32.52 
 
 		 795 aa  138  4e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0820  MscS mechanosensitive ion channel  40.82 
 
 		 849 aa  138  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0343003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  37.75 
 
 		 298 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0579  MscS mechanosensitive ion channel  32.63 
 
 		 440 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0872803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0156  MscS mechanosensitive ion channel  30.99 
 
 		 437 aa  137  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0421972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7380  mechanosensitive ion channel protein  35.64 
 
 		 439 aa  137  8e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4343  MscS mechanosensitive ion channel  36.82 
 
 		 910 aa  137  8e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5117  potassium efflux protein KefA  32.78 
 
 		 1102 aa  137  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3045  potassium efflux protein KefA  33.33 
 
 		 1133 aa  137  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3390  MscS mechanosensitive ion channel  35.47 
 
 		 861 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0445  potassium efflux protein KefA  33.2 
 
 		 1117 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.953711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1862  MscS mechanosensitive ion channel  35.03 
 
 		 867 aa  135  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6436  MscS Mechanosensitive ion channel  33.47 
 
 		 432 aa  135  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.227593 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1013  potassium efflux protein KefA  36.84 
 
 		 1128 aa  135  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1934  mechanosensitive ion channel family protein  31.58 
 
 		 287 aa  134  6e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117079  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2151  MscS mechanosensitive ion channel  37.93 
 
 		 1158 aa  134  6e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  36.51 
 
 		 860 aa  133  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1447  MscS mechanosensitive ion channel  31.45 
 
 		 1166 aa  134  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0857  MscS mechanosensitive ion channel  32.09 
 
 		 840 aa  132  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3551  MscS mechanosensitive ion channel  34.83 
 
 		 1062 aa  132  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  36.84 
 
 		 874 aa  132  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.362584 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0786  MscS Mechanosensitive ion channel  32.09 
 
 		 840 aa  132  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1608  MscS mechanosensitive ion channel  32.77 
 
 		 868 aa  131  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3059  MscS mechanosensitive ion channel  33.07 
 
 		 879 aa  131  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0365719  normal  0.0542576 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1632  mechanosensitive ion channel family protein  30.22 
 
 		 782 aa  130  8.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274059  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3721  MscS Mechanosensitive ion channel  33.18 
 
 		 1072 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3904  MscS mechanosensitive ion channel  33.18 
 
 		 1072 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3778  MscS mechanosensitive ion channel  33.18 
 
 		 1072 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1206  potassium efflux protein KefA  35.64 
 
 		 1098 aa  130  8.000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0786  MscS mechanosensitive ion channel  34.83 
 
 		 1066 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.213544  hitchhiker  0.000495101 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0547  MscS mechanosensitive ion channel  33.18 
 
 		 1067 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3144  MscS mechanosensitive ion channel  29.59 
 
 		 444 aa  130  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0287681 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>