More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2590 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  100 
 
 		 234 aa  478  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2178  ABC transporter related  68.53 
 
 		 233 aa  334  7e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1363  ABC transporter related  64.96 
 
 		 234 aa  325  4.0000000000000003e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01920  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  65.52 
 
 		 233 aa  324  6e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0745  ABC transporter, ATP-binding protein  66.38 
 
 		 233 aa  322  3e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.913109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0728  ABC transporter, ATP-binding protein  66.38 
 
 		 233 aa  322  3e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2453  ABC transporter related  64.1 
 
 		 234 aa  321  6e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000726379  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1114  ABC transporter related  63.79 
 
 		 233 aa  318  3e-86  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  62.5 
 
 		 233 aa  311  3.9999999999999997e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1205  peptide ABC transporter ATPase  62.34 
 
 		 233 aa  309  2e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2356  ABC transporter related  64.66 
 
 		 233 aa  302  2.0000000000000002e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0836286  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  62.07 
 
 		 233 aa  303  2.0000000000000002e-81  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  59.48 
 
 		 236 aa  303  2.0000000000000002e-81  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0132  ABC transporter, ATP-binding protein  61.64 
 
 		 233 aa  301  4.0000000000000003e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1515  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  62.07 
 
 		 233 aa  300  2e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1004  ABC transporter, ATP-binding protein  59.05 
 
 		 233 aa  298  7e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00659829  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  58.62 
 
 		 233 aa  293  2e-78  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2084  ABC transporter related  53.1 
 
 		 239 aa  270  2e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1715  ATPase  53.48 
 
 		 236 aa  266  2e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2874  ABC transporter related  52.61 
 
 		 236 aa  263  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.675054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1693  ABC transporter related  53.04 
 
 		 232 aa  256  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  50.66 
 
 		 244 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  50.66 
 
 		 244 aa  252  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1576  ABC transporter related  49.78 
 
 		 236 aa  251  6e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  50.22 
 
 		 248 aa  251  7e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1479  ABC transporter related  50.67 
 
 		 240 aa  250  1e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2961  ABC transporter related  48.89 
 
 		 238 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1942  ABC transporter related  49.56 
 
 		 254 aa  249  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1212  ABC transporter related  50 
 
 		 251 aa  249  2e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777209 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2064  ABC transporter related protein  49.33 
 
 		 244 aa  249  3e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.325549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1125  ATPase  51.32 
 
 		 245 aa  248  4e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.237557 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1421  ABC transporter related  51.79 
 
 		 244 aa  246  2e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2067  peptide ABC transporter ATP-binding protein  48.23 
 
 		 240 aa  245  3e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1479  ABC transporter-related protein  48.89 
 
 		 244 aa  245  4e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1509  ABC transporter related  50.67 
 
 		 248 aa  244  6e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4676  Sigma 54 interacting domain protein  49.57 
 
 		 234 aa  244  8e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0216  hypothetical protein  51.77 
 
 		 236 aa  243  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1279  ABC transporter related  51.4 
 
 		 253 aa  242  5e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1918  ABC transporter related  47.35 
 
 		 236 aa  241  6e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1583  ABC transporter related  47.19 
 
 		 232 aa  241  9e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5173  ABC transporter related  49.78 
 
 		 238 aa  240  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2281  ABC transporter related  48.23 
 
 		 235 aa  240  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341913  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1145  ABC transporter related  47.83 
 
 		 236 aa  240  2e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1013  ABC transporter related  49.33 
 
 		 245 aa  238  5e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  49.36 
 
 		 235 aa  236  2e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0390  ABC transporter related  47.62 
 
 		 232 aa  236  2e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5377  putative ABC transporter, ATP-binding protein  50.22 
 
 		 253 aa  236  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409003 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0076  ABC transporter ATP-binding protein  48.89 
 
 		 235 aa  235  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.514919 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3436  putative ABC transporter, ATP-binding protein  49.33 
 
 		 245 aa  235  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4268  ABC transporter-related protein  49.56 
 
 		 238 aa  235  5.0000000000000005e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0324  ABC transporter related protein  48.28 
 
 		 235 aa  234  8e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4369  ABC transporter related  46.67 
 
 		 234 aa  234  8e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4501  ABC transporter related  46.67 
 
 		 234 aa  234  8e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.293779 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4213  ABC transporter related  47.53 
 
 		 245 aa  233  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1583  ABC transporter ATPase  51.17 
 
 		 241 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.929196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2206  ABC transporter related  47.56 
 
 		 251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2302  ABC transporter related  48.88 
 
 		 243 aa  233  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704098  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl019  glutamine ABC transporter  45.15 
 
 		 604 aa  232  4.0000000000000004e-60  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0062  ABC transporter, ATP-binding protein  45.3 
 
 		 234 aa  231  9e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.857763  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3583  ABC transporter related  47.56 
 
 		 241 aa  230  1e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0109  ABC transporter related  51.35 
 
 		 243 aa  229  2e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.112558  normal  0.0826339 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1056  ABC transporter related  48.02 
 
 		 240 aa  229  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0021  ABC transporter, ATP-binding protein  46.55 
 
 		 345 aa  228  5e-59  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6252  ABC transporter related  48.1 
 
 		 234 aa  222  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.946819  normal  0.438945 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01810  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  44.21 
 
 		 236 aa  221  9.999999999999999e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  43.97 
 
 		 239 aa  219  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  43.26 
 
 		 233 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.684387  normal  0.338705 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0302  ABC transporter related  48.68 
 
 		 250 aa  218  5e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  48.25 
 
 		 246 aa  211  7e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0872  ABC transporter-like protein  48.17 
 
 		 248 aa  209  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175759  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03342  ABC transporter ATP-binding protein  44.64 
 
 		 229 aa  209  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  48.17 
 
 		 228 aa  208  5e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  43.87 
 
 		 226 aa  208  5e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  45.37 
 
 		 234 aa  208  6e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  45.37 
 
 		 234 aa  208  6e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  45.93 
 
 		 256 aa  206  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  43.75 
 
 		 229 aa  206  3e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  45 
 
 		 230 aa  206  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  46.85 
 
 		 235 aa  206  3e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  47.75 
 
 		 234 aa  206  3e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  46.43 
 
 		 225 aa  205  5e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  47.3 
 
 		 234 aa  205  6e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  44.14 
 
 		 293 aa  204  7e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  47.25 
 
 		 252 aa  204  7e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  47.3 
 
 		 234 aa  204  9e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1628  ABC transporter related protein  44.5 
 
 		 250 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  46.33 
 
 		 220 aa  204  1e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  44.13 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1004  ABC transporter-related protein  44.5 
 
 		 230 aa  202  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  47.73 
 
 		 225 aa  202  5e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  47.73 
 
 		 225 aa  202  5e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  47.09 
 
 		 230 aa  201  6e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  42.19 
 
 		 648 aa  201  7e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  41.63 
 
 		 259 aa  201  9e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  41.77 
 
 		 648 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1893  ABC transporter related  47.39 
 
 		 225 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  45.61 
 
 		 230 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  45 
 
 		 228 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  47.22 
 
 		 235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  46.7 
 
 		 221 aa  199  3e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>