More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0893 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0893  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 357 aa  737    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.417756  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  44.29 
 
 		 331 aa  266  4e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  39.17 
 
 		 441 aa  249  6e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  47.95 
 
 		 264 aa  113  6e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3130  pentapeptide repeat protein  32.62 
 
 		 356 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0246  pentapeptide repeat protein  44.37 
 
 		 260 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161553 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2990  pentapeptide repeat protein  32.62 
 
 		 356 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3456  pentapeptide repeat protein  41.72 
 
 		 243 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651627 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0521  hypothetical protein  39.51 
 
 		 195 aa  107  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0289  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 279 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0289  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 279 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3764  pentapeptide repeat protein  39.74 
 
 		 218 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  39.77 
 
 		 268 aa  98.2  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3095  pentapeptide repeat protein  38.76 
 
 		 210 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  40.37 
 
 		 285 aa  95.9  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  47.33 
 
 		 184 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  39.78 
 
 		 225 aa  93.2  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0870  pentapeptide repeat protein  42.45 
 
 		 362 aa  90.9  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  43.22 
 
 		 381 aa  90.5  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1777  pentapeptide repeat protein  41.1 
 
 		 432 aa  88.6  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7498  pentapeptide repeat protein  45.11 
 
 		 391 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  39.08 
 
 		 343 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  45.74 
 
 		 449 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  39.08 
 
 		 343 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  36.36 
 
 		 336 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  36.36 
 
 		 336 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  38.75 
 
 		 295 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  46.03 
 
 		 234 aa  86.7  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  47.37 
 
 		 1033 aa  86.7  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  42.57 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  38.46 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  43.31 
 
 		 576 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  35.79 
 
 		 300 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  42.03 
 
 		 340 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  42.19 
 
 		 567 aa  82.4  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  34.86 
 
 		 493 aa  82  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2987  pentapeptide repeat protein  41.01 
 
 		 130 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2409  pentapeptide repeat-containing protein  37.4 
 
 		 123 aa  81.6  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  34.64 
 
 		 447 aa  82  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1048  pentapeptide repeat-containing protein  35.67 
 
 		 420 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0897049  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  34.97 
 
 		 450 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0562  pentapeptide repeat protein  38.41 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  47.83 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  55.43 
 
 		 386 aa  80.1  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  38.85 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  44.07 
 
 		 517 aa  80.1  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  45.22 
 
 		 900 aa  79.3  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  47.71 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  44.26 
 
 		 320 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  41.5 
 
 		 182 aa  79  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4336  pentapeptide repeat-containing protein  41.86 
 
 		 187 aa  78.6  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.789922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3446  pentapeptide repeat protein  37.86 
 
 		 206 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  41.41 
 
 		 286 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0545  pentapeptide repeat protein  39.33 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  42.19 
 
 		 521 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4964  pentapeptide repeat-containing protein  47.41 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  44.86 
 
 		 384 aa  78.2  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  41.53 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  42.5 
 
 		 179 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0580  pentapeptide repeat-containing protein  41.89 
 
 		 194 aa  77.8  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  42.06 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  33.94 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  45.05 
 
 		 416 aa  77  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  35.98 
 
 		 332 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  33.94 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  33.95 
 
 		 515 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2302  pentapeptide repeat protein  36.31 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000172848 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  45.95 
 
 		 168 aa  76.3  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  32.2 
 
 		 412 aa  76.3  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  46.94 
 
 		 267 aa  76.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  50.55 
 
 		 260 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  35.56 
 
 		 319 aa  75.5  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  42.42 
 
 		 227 aa  75.5  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  43.51 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  50.52 
 
 		 525 aa  75.1  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  42.97 
 
 		 277 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  42.02 
 
 		 180 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1101  pentapeptide repeat-containing protein  51.38 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.233606  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1237  pentapeptide repeat-containing protein  38.78 
 
 		 438 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1853  pentapeptide repeat protein  49.46 
 
 		 369 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.150883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  38.24 
 
 		 903 aa  73.6  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  43.64 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  36.99 
 
 		 493 aa  73.6  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0823  pentapeptide repeat-containing protein  41.86 
 
 		 356 aa  73.6  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000611936  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  41.3 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  38.46 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0250  hypothetical protein  47.62 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  51.04 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  40.5 
 
 		 446 aa  73.2  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3670  pentapeptide repeat protein  45.83 
 
 		 830 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.414516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5010  pentapeptide repeat protein  44.04 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  43.1 
 
 		 176 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  39.66 
 
 		 333 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  38.28 
 
 		 734 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0205  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  40.37 
 
 		 537 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.47043 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  39.22 
 
 		 489 aa  72.8  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  33.85 
 
 		 447 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  43.1 
 
 		 176 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  45.08 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4550  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  41.18 
 
 		 526 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154716  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>