89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_2066 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_2066  N-acylglucosamine 2-epimerase  100 
 
 		 389 aa  809    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000010406  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2630  N-acylglucosamine 2-epimerase  64.84 
 
 		 417 aa  538  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.680867  normal  0.436823 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5333  N-acylglucosamine 2-epimerase  62.47 
 
 		 401 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0669473  normal  0.749841 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2987  N-acylglucosamine 2-epimerase  57.94 
 
 		 400 aa  486  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.700011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3567  N-acylglucosamine 2-epimerase  55.04 
 
 		 392 aa  462  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0592245 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3251  N-acylglucosamine 2-epimerase  37.47 
 
 		 403 aa  276  6e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.947715  decreased coverage  0.0046378 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3784  N-acylglucosamine 2-epimerase  39.14 
 
 		 392 aa  267  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.039561  normal  0.0465307 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1977  N-acylglucosamine 2-epimerase  39.84 
 
 		 391 aa  266  5e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0057308  normal  0.460832 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5917  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase-like protein  33.42 
 
 		 415 aa  235  8e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1366  N-acylglucosamine 2-epimerase  36.27 
 
 		 393 aa  234  3e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1947  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.08 
 
 		 393 aa  233  6e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.904714  normal  0.0967574 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3354  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.87 
 
 		 419 aa  124  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4659  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.82 
 
 		 419 aa  100  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0887  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.95 
 
 		 416 aa  97.8  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5652  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.7 
 
 		 423 aa  97.1  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3002  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.41 
 
 		 402 aa  83.2  0.000000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1975  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.97 
 
 		 392 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4956  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.84 
 
 		 396 aa  80.1  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.117097  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2557  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.95 
 
 		 390 aa  79.7  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000338325  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6381  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.67 
 
 		 427 aa  79.7  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4285  putative N-acylglucosamine 2-epimerase  24.38 
 
 		 427 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2439  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.28 
 
 		 412 aa  79  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.560128  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0424  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.57 
 
 		 427 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.441616 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0502  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.86 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0652  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.31 
 
 		 389 aa  77  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0271  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.36 
 
 		 402 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.386108  normal  0.0632878 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.1 
 
 		 397 aa  74.3  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0149  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.22 
 
 		 420 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0332  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.4 
 
 		 406 aa  73.2  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0370198  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2309  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.8 
 
 		 403 aa  71.2  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0674246  normal  0.869629 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3020  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.06 
 
 		 426 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343521  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2883  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.06 
 
 		 426 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1778  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.75 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212898  normal  0.77071 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6322  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.55 
 
 		 426 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2647  hypothetical protein  27.15 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2968  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.8 
 
 		 426 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.636763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2432  mannose-6-phosphate isomerase  20.67 
 
 		 374 aa  63.5  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2993  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.3 
 
 		 426 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4916  mannose-6-phosphate isomerase  25.51 
 
 		 386 aa  62.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2973  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.3 
 
 		 426 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0527  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  25.82 
 
 		 485 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491705  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2742  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.3 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00284359 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0118  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.2 
 
 		 395 aa  61.2  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.969015  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3387  hypothetical protein  21.55 
 
 		 483 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0835382  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3061  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  21.55 
 
 		 483 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2252  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  21.55 
 
 		 483 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0335  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  21.55 
 
 		 500 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.448131  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2032  hypothetical protein  21.55 
 
 		 483 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0348  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  25.27 
 
 		 489 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0299  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  20.3 
 
 		 470 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0290  N-acylglucosamine 2-epimerase  19.85 
 
 		 395 aa  59.7  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0560  hypothetical protein  27.41 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01636  N-acylglucosamine 2-epimerase  24 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137096  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2359  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.68 
 
 		 343 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6904  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.44 
 
 		 369 aa  57  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01231  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.73 
 
 		 401 aa  57  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0305  isomerase  24.46 
 
 		 367 aa  57  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.882389  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0395  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.46 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0508  hypothetical protein  20.34 
 
 		 410 aa  57  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0801762  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1857  hypothetical protein  24.46 
 
 		 367 aa  57  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0333762  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1756  N-acylglucosamine 2-epimerase  19.95 
 
 		 394 aa  56.6  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1151  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.46 
 
 		 400 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2128  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.46 
 
 		 400 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.309196  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0864  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.46 
 
 		 400 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3388  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.17 
 
 		 389 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.2674 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2262  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.66 
 
 		 393 aa  53.9  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1747  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  24.1 
 
 		 403 aa  53.5  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2177  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) superfamily protein  23.79 
 
 		 399 aa  53.5  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.242352  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4816  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase-like protein  22.2 
 
 		 429 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2732  N-acylglucosamine 2-epimerase  19.67 
 
 		 403 aa  52.8  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3488  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.75 
 
 		 411 aa  52  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5399  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.91 
 
 		 403 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0761169 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4306  N-acylglucosamine 2-epimerase  19.11 
 
 		 365 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5844  N-acylglucosamine 2-epimerase  19.44 
 
 		 398 aa  50.8  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.742486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0453  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.19 
 
 		 412 aa  50.1  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3713  putative isomerase  21.5 
 
 		 344 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3294  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.12 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0462942 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2871  mannose-6-phosphate isomerase  22.66 
 
 		 382 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2936  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.66 
 
 		 418 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1277  hypothetical protein  24.66 
 
 		 435 aa  47.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4222  glucose-6-phosphate isomerase  33.33 
 
 		 944 aa  46.6  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3113  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.89 
 
 		 414 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2949  putative isomerase  22.28 
 
 		 369 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0909  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.43 
 
 		 377 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1239  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.3 
 
 		 401 aa  45.1  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1271  hypothetical protein  22.3 
 
 		 401 aa  45.4  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0199  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  23.45 
 
 		 411 aa  43.9  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552163  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2861  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  27.44 
 
 		 620 aa  43.5  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3278  hypothetical protein  27.89 
 
 		 414 aa  43.5  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.198731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>