More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_10940 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_10940  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  100 
 
 
539 aa  1070    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000345024  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2476  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  54.55 
 
 
486 aa  417  9.999999999999999e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23630  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  50.79 
 
 
577 aa  328  1.0000000000000001e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0433  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.44 
 
 
471 aa  263  8e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000434978  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3273  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  49.83 
 
 
485 aa  236  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  41.49 
 
 
513 aa  230  4e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  40.36 
 
 
393 aa  224  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.93 
 
 
417 aa  225  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.63894  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3006  periplasmic serine protease  39.02 
 
 
472 aa  221  3e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.337572  normal  0.40182 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  37.14 
 
 
467 aa  221  3e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  39.71 
 
 
387 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  38.94 
 
 
398 aa  219  7.999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  41.61 
 
 
477 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  41.61 
 
 
477 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  41.53 
 
 
404 aa  219  8.999999999999998e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  41.53 
 
 
404 aa  219  8.999999999999998e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0977  protease do  41.82 
 
 
471 aa  219  1e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  39.71 
 
 
388 aa  219  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0069  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.95 
 
 
579 aa  219  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.27 
 
 
398 aa  219  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  40.53 
 
 
504 aa  218  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  39.71 
 
 
402 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  39.71 
 
 
402 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  39.71 
 
 
402 aa  217  5e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  40.72 
 
 
505 aa  217  5e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7239  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.34 
 
 
569 aa  217  5e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108633  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  39.71 
 
 
402 aa  217  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  39.71 
 
 
402 aa  217  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.1 
 
 
408 aa  216  5.9999999999999996e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5152  protease Do  40.6 
 
 
506 aa  216  7e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000102653  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  41.2 
 
 
403 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  41.98 
 
 
484 aa  216  9.999999999999999e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  34.99 
 
 
396 aa  215  9.999999999999999e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12778  serine protease precursor  41.39 
 
 
467 aa  216  9.999999999999999e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  36.36 
 
 
506 aa  215  9.999999999999999e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  40.41 
 
 
478 aa  215  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1904  HtrA2 peptidase  42.6 
 
 
423 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  0.334422 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  38.98 
 
 
474 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  38.44 
 
 
481 aa  214  2.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2700  serine protease  39.41 
 
 
388 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  38.05 
 
 
407 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  42.76 
 
 
402 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  37.34 
 
 
482 aa  213  7e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06450  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  44.37 
 
 
517 aa  213  7.999999999999999e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1363  protease DO  41.33 
 
 
472 aa  213  7.999999999999999e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3676  peptidase S1C, Do  39.29 
 
 
503 aa  213  9e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.769411  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  40.68 
 
 
469 aa  212  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.41 
 
 
401 aa  212  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0675  serine protease  40.97 
 
 
495 aa  212  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  42.76 
 
 
401 aa  213  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  37.94 
 
 
407 aa  212  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0209  protease Do  39.25 
 
 
517 aa  212  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0976741 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.76 
 
 
401 aa  213  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.76 
 
 
401 aa  213  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  38.64 
 
 
474 aa  213  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0806  putative cryptic C4-dicarboxylate transporter DcuD  43.45 
 
 
468 aa  211  2e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00374438  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  37 
 
 
491 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  43.04 
 
 
511 aa  212  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0731  peptidase S1C, Do  41.84 
 
 
467 aa  212  2e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553018  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3271  protease Do  42.01 
 
 
476 aa  212  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.168434 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3830  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.14 
 
 
515 aa  211  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778945  normal  0.0341938 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  42.07 
 
 
401 aa  211  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1398  protease Do  40.89 
 
 
496 aa  211  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1242  protease DO  41 
 
 
472 aa  211  3e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000225025  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2624  protease Do  41.67 
 
 
490 aa  211  3e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.07 
 
 
401 aa  211  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  38.72 
 
 
479 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1594  protease Do  37.31 
 
 
520 aa  210  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1580  2-alkenal reductase  43.15 
 
 
443 aa  211  4e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0204264 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  36.9 
 
 
476 aa  210  5e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1782  protease Do  40.83 
 
 
498 aa  210  5e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0807  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.07 
 
 
398 aa  210  5e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  41.03 
 
 
511 aa  210  5e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2745  2-alkenal reductase  41.38 
 
 
403 aa  210  6e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  41.84 
 
 
385 aa  210  6e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1398  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.36 
 
 
349 aa  210  6e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0037  protease Do  38.64 
 
 
489 aa  209  7e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  40.32 
 
 
464 aa  209  8e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0497  protease DO  41 
 
 
472 aa  209  8e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0231688  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4679  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.48 
 
 
440 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0383364 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2259  protease Do  36.96 
 
 
492 aa  209  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.661037  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4385  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.48 
 
 
440 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3918  protease Do  37.69 
 
 
508 aa  209  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4299  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.48 
 
 
440 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143756  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.95 
 
 
379 aa  208  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3284  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.27 
 
 
420 aa  208  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.71487  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1183  HtrA2 peptidase  41.08 
 
 
386 aa  208  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0747  2-alkenal reductase  42.28 
 
 
379 aa  208  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0052  serine protease  39.07 
 
 
483 aa  208  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292411 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1070  2-alkenal reductase  39.43 
 
 
393 aa  208  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016371  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0853  serine protease  40 
 
 
495 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0310  serine protease  40 
 
 
495 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.636573  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1192  protease Do  41.73 
 
 
493 aa  207  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0123913  normal  0.0156708 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0848  serine protease  40 
 
 
495 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580249  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1012  serine protease  40 
 
 
495 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2462  peptidase S1C, Do  37.71 
 
 
471 aa  207  3e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1593  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.29 
 
 
512 aa  207  3e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421913  normal  0.822638 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0053  serine protease  40 
 
 
483 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0875  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.35 
 
 
385 aa  207  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2317  protease Do  40.69 
 
 
487 aa  207  4e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>