More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0992 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0992  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
190 aa  388  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1848  NAD-dependent DNA ligase  43.4 
 
 
195 aa  94.4  9e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.449373  normal  0.815473 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  37.14 
 
 
376 aa  84.3  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  41.07 
 
 
219 aa  84.3  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  38.26 
 
 
231 aa  83.6  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  41.75 
 
 
219 aa  82.4  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  41.75 
 
 
218 aa  82.8  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  41.75 
 
 
218 aa  82.8  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  35.77 
 
 
224 aa  82.4  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 
243 aa  81.6  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  39.45 
 
 
294 aa  80.9  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 
219 aa  79.3  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  35.96 
 
 
239 aa  79.7  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  35.11 
 
 
226 aa  79  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  35.04 
 
 
464 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  41.96 
 
 
244 aa  77.8  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  35.77 
 
 
228 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1621  OmpA/MotB domain protein  42.71 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  38.94 
 
 
236 aa  76.3  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  39.64 
 
 
266 aa  77  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2974  peptidoglycan-associated lipoprotein  40 
 
 
190 aa  77  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.113547  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  44.87 
 
 
525 aa  77  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4144  OmpA/MotB  40.74 
 
 
165 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 
242 aa  76.6  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  37.27 
 
 
641 aa  77  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  39.05 
 
 
222 aa  76.3  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  36.19 
 
 
220 aa  75.9  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  38.61 
 
 
375 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  46.48 
 
 
243 aa  75.9  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  34.82 
 
 
207 aa  75.5  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  37.17 
 
 
464 aa  75.9  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  40.38 
 
 
216 aa  75.5  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  39.25 
 
 
333 aa  75.5  0.0000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  38.83 
 
 
212 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  37.86 
 
 
214 aa  75.5  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  40.38 
 
 
216 aa  75.5  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  37.74 
 
 
890 aa  75.9  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  33.55 
 
 
260 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  34.76 
 
 
200 aa  75.1  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  45.21 
 
 
218 aa  74.7  0.0000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  34.31 
 
 
228 aa  74.7  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4333  porin  36.19 
 
 
221 aa  74.7  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  33.55 
 
 
260 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3509  OmpA/MotB  40.74 
 
 
164 aa  74.7  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.140214  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  35.09 
 
 
316 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  36.61 
 
 
223 aa  74.3  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3216  OmpA/MotB domain-containing protein  41.38 
 
 
176 aa  74.3  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3406  OmpA/MotB domain-containing protein  34.51 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.786122  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  36.28 
 
 
231 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  36.89 
 
 
210 aa  73.9  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5767  OmpA/MotB family protein  38.46 
 
 
214 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00312455  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3541  OmpA/MotB  32.2 
 
 
193 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.09094e-16  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  38.83 
 
 
352 aa  74.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  48.61 
 
 
222 aa  73.9  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  39.42 
 
 
214 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02060  hypothetical protein  48.61 
 
 
219 aa  73.6  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  36.11 
 
 
225 aa  73.6  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1803  OmpA/MotB domain protein  30.89 
 
 
195 aa  73.6  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.188621  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  37.14 
 
 
237 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  37.14 
 
 
237 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  34.21 
 
 
316 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2209  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.31 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000116436  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  37.04 
 
 
217 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1815  OmpA/MotB  38.89 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.336374  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4748  OmpA/MotB  38.89 
 
 
166 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  37.84 
 
 
228 aa  72.8  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  36.19 
 
 
221 aa  72.8  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0687  OmpA domain-containing protein  37.74 
 
 
173 aa  72.4  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.182199  normal  0.103402 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  48.05 
 
 
229 aa  72.4  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  35.58 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  35.58 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  35.24 
 
 
240 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  34.21 
 
 
316 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  35.58 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  35.58 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2560  OmpA/MotB domain protein  38.18 
 
 
355 aa  72.4  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.293745  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  35.58 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  35.58 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  41.59 
 
 
296 aa  72  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  35.24 
 
 
247 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  36.13 
 
 
215 aa  72  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.2 
 
 
407 aa  72  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  35.24 
 
 
236 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  35.19 
 
 
316 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  33.33 
 
 
463 aa  71.6  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  35.24 
 
 
240 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2593  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.62 
 
 
176 aa  71.6  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000155055  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1397  OmpA/MotB  27.03 
 
 
176 aa  71.6  0.000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  35.71 
 
 
187 aa  71.6  0.000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  37.14 
 
 
334 aa  71.2  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1695  Pal family lipoprotein  39.81 
 
 
168 aa  71.2  0.000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  35.45 
 
 
319 aa  71.2  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_011138  MADE_02741  sodium-type flagellar protein MotY  37.37 
 
 
290 aa  71.2  0.000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1638  outer membrane lipoprotein Omp16 (minor outer membraneprotein omp16) (16 kDa OMP) (16.5 kDa minor OMP)  39.81 
 
 
168 aa  71.2  0.000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0908  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.39 
 
 
172 aa  71.2  0.000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.975322  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06186  hypothetical protein  38.1 
 
 
216 aa  71.2  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1509  OmpA/MotB  39.39 
 
 
172 aa  71.2  0.000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.152591  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0457  OmpA/MotB domain-containing protein  34.55 
 
 
316 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518918  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02680  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)protein  40 
 
 
430 aa  71.2  0.000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181066  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>