193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0018 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0018  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  392  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0309934  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0358  hypothetical protein  65.1 
 
 
196 aa  241  3e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.798017 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1060  hypothetical protein  60.51 
 
 
195 aa  231  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128863  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1342  hypothetical protein  59.9 
 
 
194 aa  228  5e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.539265  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2488  hypothetical protein  59.9 
 
 
194 aa  228  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0325  hypothetical protein  59.9 
 
 
194 aa  228  5e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0602  hypothetical protein  59.9 
 
 
194 aa  228  5e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0985304  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1299  hypothetical protein  59.9 
 
 
194 aa  228  5e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1227  hypothetical protein  59.9 
 
 
194 aa  228  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0966  hypothetical protein  59.9 
 
 
194 aa  228  5e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0299  hypothetical protein  60 
 
 
196 aa  228  6e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0326717 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1507  hypothetical protein  58.85 
 
 
202 aa  224  4e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157266  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03909  hypothetical protein  61.46 
 
 
196 aa  222  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3612  hypothetical protein  55.15 
 
 
197 aa  216  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0935  hypothetical protein  56.63 
 
 
195 aa  215  4e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0957403 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0870  hypothetical protein  56.12 
 
 
195 aa  214  9e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.359532 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4806  hypothetical protein  56.48 
 
 
194 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0544796  hitchhiker  0.00048101 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1853  hypothetical protein  56.99 
 
 
194 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.134182  normal  0.0262074 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1004  hypothetical protein  54.08 
 
 
195 aa  209  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.550693  normal  0.189775 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1131  hypothetical protein  58.68 
 
 
188 aa  203  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4764  hypothetical protein  53.48 
 
 
196 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3308  hypothetical protein  50 
 
 
210 aa  201  4e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1009  hypothetical protein  51.01 
 
 
195 aa  200  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.491233 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2070  hypothetical protein  53.61 
 
 
197 aa  200  9.999999999999999e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237488  normal  0.473197 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2117  hypothetical protein  54.74 
 
 
196 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1586  hypothetical protein  51.85 
 
 
196 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1245  hypothetical protein  54.74 
 
 
196 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2587  hypothetical protein  54.74 
 
 
196 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0598996 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1123  hypothetical protein  54.74 
 
 
196 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01011  hypothetical protein  54.21 
 
 
196 aa  198  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01018  hypothetical protein  54.21 
 
 
196 aa  198  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1045  hypothetical protein  52.04 
 
 
195 aa  198  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1290  hypothetical protein  50.26 
 
 
197 aa  198  3.9999999999999996e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000115526 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2381  hypothetical protein  53.81 
 
 
201 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1521  hypothetical protein  50.26 
 
 
196 aa  196  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.386804 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1126  hypothetical protein  54.21 
 
 
196 aa  195  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1774  hypothetical protein  50.26 
 
 
194 aa  193  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0210891  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2634  nitroreductase  53.16 
 
 
196 aa  193  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.748855  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0932  hypothetical protein  50.78 
 
 
196 aa  192  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.971557  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2357  nitroreductase  52.04 
 
 
196 aa  192  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal  0.104936 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00764  hypothetical protein  48.7 
 
 
218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2096  hypothetical protein  48.19 
 
 
194 aa  174  7e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.545065  normal  0.946136 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4842  hypothetical protein  51.93 
 
 
199 aa  165  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2595  nitroreductase  42.78 
 
 
208 aa  164  9e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0915726  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5204  hypothetical protein  46.52 
 
 
197 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191632  normal  0.211461 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0678  nitroreductase  43.75 
 
 
206 aa  161  5.0000000000000005e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3854  nitroreductase  45.55 
 
 
201 aa  157  6e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0254406  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3014  nitroreductase  43.75 
 
 
195 aa  157  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129485  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1868  nitroreductase  43.23 
 
 
208 aa  156  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.047997  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5658  hypothetical protein  42.49 
 
 
201 aa  153  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2530  hypothetical protein  42.93 
 
 
258 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3535  hypothetical protein  41.41 
 
 
203 aa  145  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.868887 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16880  nitroreductase  38.78 
 
 
213 aa  135  5e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.337759  normal  0.0536837 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02660  hypothetical protein  38.78 
 
 
221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303317  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0266  hypothetical protein  38.27 
 
 
201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0129  hypothetical protein  35.68 
 
 
201 aa  112  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2948  nitroreductase  29.63 
 
 
214 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.5003  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  29.44 
 
 
206 aa  67.4  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4824  NADH dehydrogenase  27.84 
 
 
208 aa  64.7  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1006  nitroreductase  28.19 
 
 
202 aa  63.9  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269661  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0154  putative nitroreductase  31.07 
 
 
204 aa  62.4  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5169  nitroreductase  30.69 
 
 
211 aa  62.4  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2969  nitroreductase  30.23 
 
 
209 aa  62.4  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000187798  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3602  nitroreductase  28.26 
 
 
246 aa  61.6  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.263517  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  26.49 
 
 
206 aa  60.1  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1024  nitroreductase  26.83 
 
 
213 aa  59.7  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4463  nitroreductase family protein  25.57 
 
 
208 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.325624  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  27.32 
 
 
213 aa  58.9  0.00000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1374  nitroreductase  27.98 
 
 
202 aa  58.5  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0774  nitroreductase family protein  24.43 
 
 
208 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.139157 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0381  nitroreductase  26.09 
 
 
246 aa  58.2  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4241  nitroreductase family protein  23.86 
 
 
207 aa  57.4  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4079  nitroreductase family protein  23.86 
 
 
207 aa  57.4  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0494988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4090  nitroreductase family protein  23.86 
 
 
207 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192687  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1024  dihydropteridine reductase  26.34 
 
 
218 aa  57.8  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0405411  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4571  nitroreductase family protein  23.86 
 
 
207 aa  57.4  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0106  nitroreductase  26.14 
 
 
200 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0338  nitroreductase  26.09 
 
 
246 aa  57  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1868  dihydropteridine reductase  28.12 
 
 
216 aa  57  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8440  nitroreductase  28.16 
 
 
205 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1970  nitroreductase  31.28 
 
 
204 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0109  nitroreductase  26.14 
 
 
200 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2158  NAD(P)H nitroreductase  33.33 
 
 
204 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4422  nitroreductase family protein  23.86 
 
 
207 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3066  dihydropteridine reductase  25.99 
 
 
217 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.612691  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5933  putative nitroreductase  27.98 
 
 
200 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3952  nitroreductase  31.69 
 
 
211 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0851769 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1136  nitroreductase  27.06 
 
 
200 aa  54.7  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.710664  normal  0.0578189 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2077  dihydropteridine reductase  25.14 
 
 
217 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00539  dihydropteridine reductase, NAD(P)H-dependent, oxygen-insensitive  27.52 
 
 
217 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00528  hypothetical protein  27.52 
 
 
217 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.884755  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4759  nitroreductase  26.6 
 
 
221 aa  54.3  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000691202  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0659  dihydropteridine reductase  27.52 
 
 
217 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001134  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  24.87 
 
 
217 aa  54.3  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3068  dihydropteridine reductase  27.52 
 
 
217 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.260061  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0625  dihydropteridine reductase  27.52 
 
 
217 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0596  dihydropteridine reductase  28.19 
 
 
217 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.727984  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3051  6,7-dihydropteridine reductase  26.85 
 
 
217 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0472  dihydropteridine reductase  27.52 
 
 
217 aa  53.9  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  24.02 
 
 
181 aa  53.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>