285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1628 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1628  C-5 cytosine-specific DNA methylase  100 
 
 
359 aa  743    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3681  modification methylase HgiDII  54.2 
 
 
344 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0528  DNA-cytosine methyltransferase  55.69 
 
 
354 aa  391  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2196  DNA-cytosine methyltransferase  52.6 
 
 
366 aa  382  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227819  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2193  DNA-cytosine methyltransferase  48.85 
 
 
358 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.877984  normal  0.072963 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1175  DNA-cytosine methyltransferase  51.86 
 
 
349 aa  368  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4678  DNA-cytosine methyltransferase  51.3 
 
 
345 aa  366  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.201023  normal  0.324334 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0606  DNA-cytosine methyltransferase  49.57 
 
 
355 aa  366  1e-100  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0680  C-5 cytosine-specific DNA methylase  49.71 
 
 
350 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000225645 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  48.98 
 
 
373 aa  360  3e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3845  DNA-cytosine methyltransferase  50.43 
 
 
371 aa  335  5.999999999999999e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  43.06 
 
 
352 aa  268  8e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  39.44 
 
 
371 aa  251  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  37.04 
 
 
342 aa  250  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  39.89 
 
 
375 aa  246  4e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  35 
 
 
374 aa  206  7e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  38.26 
 
 
340 aa  200  3e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  34.05 
 
 
373 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  32.79 
 
 
362 aa  190  4e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  35.48 
 
 
365 aa  179  7e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4269  DNA-cytosine methyltransferase  31.12 
 
 
359 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  29.1 
 
 
319 aa  156  4e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  27.72 
 
 
395 aa  154  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0160  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  29.36 
 
 
404 aa  154  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  30.28 
 
 
357 aa  148  1.0000000000000001e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0891  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.45 
 
 
397 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.92 
 
 
387 aa  144  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  26.72 
 
 
361 aa  142  9e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  28.61 
 
 
438 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  30.86 
 
 
381 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  28.75 
 
 
389 aa  136  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1839  DNA-cytosine methyltransferase  28.06 
 
 
318 aa  134  3e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.414211  normal  0.341933 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  28.61 
 
 
398 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  29.2 
 
 
468 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.36 
 
 
415 aa  130  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  27.59 
 
 
423 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  27.56 
 
 
370 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  30.48 
 
 
361 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  26.99 
 
 
385 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  27.27 
 
 
423 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  28.13 
 
 
365 aa  126  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  26.58 
 
 
652 aa  122  7e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  27.2 
 
 
360 aa  122  8e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  28.74 
 
 
325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  26.16 
 
 
313 aa  120  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  26.19 
 
 
671 aa  119  6e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  26.54 
 
 
465 aa  119  7.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  27.93 
 
 
362 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  28.57 
 
 
355 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  27.66 
 
 
489 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  26.93 
 
 
313 aa  117  3.9999999999999997e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.977909 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  25.38 
 
 
657 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  27.08 
 
 
434 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0700  DNA-cytosine methyltransferase  27.07 
 
 
320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  25.5 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0576  DNA-cytosine methyltransferase  25.81 
 
 
313 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  24.62 
 
 
488 aa  112  9e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0824  DNA-cytosine methyltransferase  26.92 
 
 
349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  28.16 
 
 
334 aa  109  9.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  26.59 
 
 
310 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  26.82 
 
 
443 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  28.07 
 
 
406 aa  107  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0416  DNA-cytosine methyltransferase  25 
 
 
320 aa  107  3e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  24.75 
 
 
689 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  27.11 
 
 
415 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  27 
 
 
400 aa  106  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  26.93 
 
 
323 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  25.53 
 
 
399 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  26.4 
 
 
345 aa  105  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  24.88 
 
 
686 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0526  DNA-cytosine methyltransferase  26.4 
 
 
377 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243641  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  26.65 
 
 
431 aa  103  7e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  25.72 
 
 
412 aa  102  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  25.14 
 
 
308 aa  102  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  26.77 
 
 
418 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  24.88 
 
 
698 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  26.77 
 
 
418 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  27.17 
 
 
361 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4319  DNA-cytosine methyltransferase family protein  30.06 
 
 
312 aa  101  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165512 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1529  DNA-cytosine methyltransferase  26.28 
 
 
402 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000344499  unclonable  0.000000000227525 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2232  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  29.07 
 
 
405 aa  100  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.996757  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  25.88 
 
 
328 aa  99.4  8e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06638  C5 cytosine methyltransferase DmtAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q876R1]  25.56 
 
 
615 aa  98.6  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0121285  normal  0.227283 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  26.68 
 
 
421 aa  99  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1383  DNA-cytosine methyltransferase  26.93 
 
 
309 aa  98.6  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1413  DNA-cytosine methyltransferase  21.95 
 
 
420 aa  97.4  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.582499  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7048  DNA-cytosine methyltransferase  27.53 
 
 
358 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  26.26 
 
 
388 aa  96.7  5e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1322  DNA-cytosine methyltransferase  27.3 
 
 
429 aa  96.3  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  hitchhiker  0.000198005 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  23.85 
 
 
438 aa  95.9  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  28.5 
 
 
406 aa  95.9  9e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.81 
 
 
405 aa  95.5  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  25.2 
 
 
375 aa  95.5  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  24.93 
 
 
313 aa  95.1  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2442  DNA-cytosine methyltransferase  26.16 
 
 
464 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.767774  unclonable  0.00000000055978 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3920  DNA-cytosine methyltransferase  28.81 
 
 
358 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1568  DNA-cytosine methyltransferase  25 
 
 
662 aa  94.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0406485  hitchhiker  0.00122877 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3438  DNA modification cytosine-specific methyltransferase protein  25.91 
 
 
364 aa  94.4  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  27.91 
 
 
424 aa  94.4  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1093  DNA-cytosine methyltransferase  25.88 
 
 
386 aa  94  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>