252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4295 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3459  pyridoxal-dependent decarboxylase  73.21 
 
 
511 aa  741    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2551  pyridoxal-dependent decarboxylase  67.91 
 
 
534 aa  650    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.547739 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4295  Pyridoxal-dependent decarboxylase  100 
 
 
508 aa  1025    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000243421 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2740  pyridoxal-dependent decarboxylase  68.24 
 
 
530 aa  663    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.14205  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1074  Pyridoxal-dependent decarboxylase  64.23 
 
 
551 aa  599  1e-170  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0179371  normal  0.433316 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0285  pyridoxal-dependent decarboxylase  59.13 
 
 
529 aa  543  1e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0512  Pyridoxal-dependent decarboxylase  60.24 
 
 
544 aa  541  9.999999999999999e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2448  pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein  50 
 
 
515 aa  501  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1055  pyridoxal-dependent decarboxylase  52.83 
 
 
530 aa  501  1e-141  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3190  pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein  49.69 
 
 
515 aa  499  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.399603  normal  0.0148161 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2547  pyridoxal-dependent decarboxylase  49.38 
 
 
515 aa  496  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0590  putative L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  49.58 
 
 
484 aa  479  1e-134  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.126403  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0134  L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  48.1 
 
 
515 aa  459  9.999999999999999e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3171  pyridoxal-dependent decarboxylase  46.11 
 
 
505 aa  447  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.902274  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2835  Pyridoxal-dependent decarboxylase  45.73 
 
 
507 aa  443  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.579316  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0196  Pyridoxal-dependent decarboxylase  52.72 
 
 
484 aa  431  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.6927  normal  0.0347054 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1803  Pyridoxal-dependent decarboxylase  52.54 
 
 
529 aa  387  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0338537  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2838  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  41.06 
 
 
522 aa  346  7e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0758155  normal  0.28501 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0927  L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  36.36 
 
 
511 aa  329  9e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2714  pyridoxal-dependent decarboxylase  37.97 
 
 
488 aa  326  5e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216735  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2138  putative diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  35.6 
 
 
967 aa  323  6e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00227594  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3330  Pyridoxal-dependent decarboxylase  41.49 
 
 
503 aa  320  3e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.405304  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2288  pyridoxal-dependent decarboxylase  36.4 
 
 
494 aa  319  9e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.715836  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2059  Pyridoxal-dependent decarboxylase  41.33 
 
 
495 aa  318  1e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00190827  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2418  pyridoxal-dependent decarboxylase  41.61 
 
 
490 aa  318  2e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000894226  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1232  aminotransferase, class III/decarboxylase, group II  38.5 
 
 
961 aa  316  5e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000122861  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2354  Pyridoxal-dependent decarboxylase  40.8 
 
 
495 aa  315  8e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0161317  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02741  hypothetical protein  39.35 
 
 
963 aa  314  1.9999999999999998e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003101  diaminobutyrate-pyruvate transaminase/L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  39.87 
 
 
958 aa  315  1.9999999999999998e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4221  pyridoxal-dependent decarboxylase  39.16 
 
 
488 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.488782 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0214  Pyridoxal-dependent decarboxylase  39.37 
 
 
527 aa  293  4e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1807  Pyridoxal-dependent decarboxylase  40.79 
 
 
789 aa  250  4e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000170312  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2949  pyridoxal-dependent decarboxylase  35.99 
 
 
502 aa  219  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442662  normal  0.020472 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2555  decarboxylase, pyridoxal-dependent  31.08 
 
 
484 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100435 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1305  Pyridoxal-dependent decarboxylase  33.8 
 
 
480 aa  217  4e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2539  decarboxylase, pyridoxal-dependent  30.54 
 
 
484 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2724  decarboxylase, pyridoxal-dependent  30.54 
 
 
484 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2734  decarboxylase, pyridoxal-dependent  30.54 
 
 
484 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08514e-18 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1171  pyridoxal-dependent decarboxylase  33.57 
 
 
475 aa  203  5e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0333328 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2115  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  32.1 
 
 
489 aa  203  6e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04970  decarboxylase, pyridoxal-dependent  29.91 
 
 
479 aa  200  6e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.421495  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0661  pyridoxal-dependent decarboxylase  35.8 
 
 
484 aa  196  8.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000151703  normal  0.871149 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2157  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.27 
 
 
479 aa  196  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2033  pyridoxal-dependent decarboxylase  33.82 
 
 
490 aa  195  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.376208  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0606  non-ribosomal peptide synthetase module-containing protein  30.9 
 
 
462 aa  193  6e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.902571  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4065  Pyridoxal-dependent decarboxylase  31.54 
 
 
529 aa  193  6e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.125159  normal  0.183613 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1038  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  36.03 
 
 
483 aa  192  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1124  aromatic amino acid decarboxylase, putative  29.58 
 
 
491 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2916  Aromatic-L-amino-acid decarboxylase  31.07 
 
 
510 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122607 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4055  pyridoxal-dependent decarboxylase  35.44 
 
 
554 aa  183  6e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.505018  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5531  putative pyridoxal-dependent decarboxylase  32.08 
 
 
502 aa  183  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.245703 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4339  Pyridoxal-dependent decarboxylase  31.01 
 
 
517 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.843861  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003759  glutamate decarboxylase eukaryotic type  26 
 
 
548 aa  181  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1282  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.73 
 
 
477 aa  179  8e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2983  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  28.6 
 
 
496 aa  177  5e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0076  Pyridoxal-dependent decarboxylase  31.01 
 
 
458 aa  171  3e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1624  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.87 
 
 
552 aa  170  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02632  glutamate decarboxylase  25.54 
 
 
548 aa  169  8e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2032  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.93 
 
 
547 aa  168  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0351867  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1644  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.45 
 
 
550 aa  168  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0719  putative glutamate decarboxylase  27.68 
 
 
548 aa  167  4e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2310  L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  33.17 
 
 
489 aa  167  5.9999999999999996e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.506086  normal  0.726788 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0883  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  29.44 
 
 
461 aa  166  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.354437  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0934  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.07 
 
 
466 aa  164  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000000218274  decreased coverage  0.000132275 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3584  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.13 
 
 
611 aa  164  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09431  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  32.01 
 
 
461 aa  164  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1707  group II decarboxylase  29.85 
 
 
552 aa  163  6e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0663746  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36228  predicted protein  32.77 
 
 
453 aa  163  9e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1261  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  30.09 
 
 
483 aa  162  1e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4283  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.64 
 
 
486 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1007  putative decarboxylase  27.51 
 
 
543 aa  161  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3209  Pyridoxal-dependent decarboxylase  29.18 
 
 
579 aa  162  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16491  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  29.85 
 
 
470 aa  162  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.360036 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07761  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  30.27 
 
 
456 aa  161  3e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0845725  normal  0.0349206 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09421  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  28.4 
 
 
461 aa  161  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0460  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.18 
 
 
552 aa  158  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362513  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0144  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  29.78 
 
 
456 aa  157  3e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2160  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  26.15 
 
 
479 aa  157  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222222  normal  0.771411 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3931  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.88 
 
 
536 aa  157  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0831  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.51 
 
 
573 aa  157  6e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00169678  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1200  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.05 
 
 
560 aa  156  7e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1238  Pyridoxal-dependent decarboxylase  29.7 
 
 
486 aa  156  8e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0959  Pyridoxal-dependent decarboxylase  27.88 
 
 
538 aa  155  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2715  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.75 
 
 
548 aa  155  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.288765  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4944  Pyridoxal-dependent decarboxylase  28.86 
 
 
486 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.326969  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0114  Pyridoxal-dependent decarboxylase  29.9 
 
 
480 aa  154  4e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.15522  normal  0.0242531 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1334  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.78 
 
 
497 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1177  hypothetical protein  29.58 
 
 
474 aa  153  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1102  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.54 
 
 
492 aa  153  8.999999999999999e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.967255  normal  0.206901 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2686  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.01 
 
 
549 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.555524 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0931  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.54 
 
 
567 aa  152  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1769  glutamate decarboxylase, putative  26.81 
 
 
533 aa  151  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2520  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.81 
 
 
549 aa  152  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.212789 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2780  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.33 
 
 
550 aa  151  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.300778 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10231  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  27.45 
 
 
455 aa  151  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.1178 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2588  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.21 
 
 
549 aa  151  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2643  pyridoxal-dependent decarboxylase  24.79 
 
 
546 aa  151  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.160588  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1469  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.1 
 
 
549 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.899491  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1209  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  31.32 
 
 
469 aa  148  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2434  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.49 
 
 
554 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>