85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNI00230 on replicon NC_006694
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006694  CNI00230  eukaryotic translation initiation factor 2 alpha subunit, putative  100 
 
 		 300 aa  605  9.999999999999999e-173  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.433033  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03156  translation initiation factor eIF2 alpha subunit (Eurofung)  59.2 
 
 		 308 aa  361  8e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34538  predicted protein  54.95 
 
 		 320 aa  330  2e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000454395  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119592  Eukaryotic translation initiation factor 2, alpha subunit  48.7 
 
 		 322 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0150821  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1128  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  29.17 
 
 		 264 aa  99.8  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0642  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  27.91 
 
 		 265 aa  98.6  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000204722  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1802  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  27.09 
 
 		 256 aa  98.6  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1359  translation initiation factor 2, alpha subunit  27.38 
 
 		 277 aa  96.3  5e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.256809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1567  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  25.67 
 
 		 268 aa  96.3  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1009  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  27.49 
 
 		 265 aa  94.7  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1699  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  28.63 
 
 		 265 aa  95.1  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.328913  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0982  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  28.34 
 
 		 265 aa  91.3  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1152  translation initiation factor 2, alpha subunit  27.97 
 
 		 254 aa  90.5  3e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0964  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  28.85 
 
 		 265 aa  90.1  4e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.497618  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2023  translation initiation factor 2, alpha subunit  23.75 
 
 		 266 aa  89.4  7e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576744  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0703  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  25.1 
 
 		 262 aa  88.6  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0077  RNA-binding S1 domain-containing protein  27.95 
 
 		 265 aa  88.2  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.541121 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2051  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  28.87 
 
 		 259 aa  85.1  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1396  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  28.69 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0200343  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2790  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  28.28 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.289487  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0957  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  26.18 
 
 		 261 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.652274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1951  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  26.32 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.612676 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2502  translation initiation factor 2, alpha subunit  27.31 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0870  translation initiation factor 2, alpha subunit  26.05 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2880  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  27.6 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.651055  normal  0.408906 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1299  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  25.29 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0416  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  24.38 
 
 		 257 aa  68.6  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.131172  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1783  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  26.7 
 
 		 265 aa  67  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.030089 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0433  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  27.27 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1687  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  26.43 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.640158  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0995  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  25.95 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1009  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  27.8 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0502  RNA-binding S1 domain-containing protein  34.04 
 
 		 415 aa  55.8  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0507  30S ribosomal protein S1  32.41 
 
 		 574 aa  53.9  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.762722  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1234  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40 
 
 		 699 aa  52.8  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1728  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  33.72 
 
 		 672 aa  52  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0455896  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1702  30S ribosomal protein S1  28.67 
 
 		 577 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1350  RNA binding S1 domain protein  33.33 
 
 		 431 aa  50.4  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1795  SSU ribosomal protein S1P  29.9 
 
 		 539 aa  50.4  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0235  30S ribosomal protein S1  31.58 
 
 		 577 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.00000120876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1437  RNA binding S1 domain protein  30.11 
 
 		 400 aa  49.7  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.245145  normal  0.159598 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2015  RNA-binding S1 domain-containing protein  32.26 
 
 		 411 aa  49.7  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0652883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1730  RNA-binding S1 domain-containing protein  32.26 
 
 		 403 aa  49.3  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0218599  normal  0.469855 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0714  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  29.41 
 
 		 694 aa  49.3  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000369991  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19980  SSU ribosomal protein S1P  35.06 
 
 		 407 aa  47  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1732  30S ribosomal protein S1  27.68 
 
 		 589 aa  47  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000125222  decreased coverage  0.00441133 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1794  30S ribosomal protein S1  31.68 
 
 		 588 aa  47  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000217401  normal  0.053041 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1520  30S ribosomal protein S1  31 
 
 		 568 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446628  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1607  RNA-binding S1 domain-containing protein  29.79 
 
 		 365 aa  46.6  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00859677  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2435  30S ribosomal protein S1  31 
 
 		 568 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2347  30S ribosomal protein S1  31 
 
 		 568 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.139373  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1161  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.89 
 
 		 712 aa  46.2  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000184021  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0147  30S ribosomal protein S1  29.91 
 
 		 575 aa  46.2  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000000164989  normal  0.503273 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1027  RNA binding S1 domain protein  36.36 
 
 		 504 aa  46.2  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000173139  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1107  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.12 
 
 		 749 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.583336  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0309  30S ribosomal protein S1  27.12 
 
 		 564 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.470191 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1102  30S ribosomal protein S1  27.84 
 
 		 401 aa  45.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000946853  normal  0.0119462 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3572  RNA binding S1 domain protein  28.71 
 
 		 557 aa  45.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0452  30S ribosomal protein S1  27.68 
 
 		 592 aa  44.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000961926  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05300  SSU ribosomal protein S1P  31.87 
 
 		 403 aa  44.3  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.467971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2522  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.5 
 
 		 755 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1154  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  29.29 
 
 		 672 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.225673  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30354  Putative mitochondrial ribosomal protein S1  31.33 
 
 		 352 aa  45.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0824042 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2523  RNA binding S1 domain protein  32.61 
 
 		 405 aa  44.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.270612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3255  30S ribosomal protein S1  28.97 
 
 		 584 aa  43.9  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000271492  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2301  30S ribosomal protein S1  30 
 
 		 578 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1235  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.94 
 
 		 721 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.434132  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0995  30S ribosomal protein S1  29.47 
 
 		 584 aa  43.9  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1618  RNA-binding S1 domain-containing protein  28.26 
 
 		 532 aa  44.3  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1167  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.94 
 
 		 721 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.859366  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0408  ribosomal protein S1  26.04 
 
 		 553 aa  43.5  0.004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.460478  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1305  30S ribosomal protein S1  23.53 
 
 		 566 aa  43.5  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000305659  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1450  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  31.33 
 
 		 718 aa  43.5  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.103052  normal  0.272177 
 
 
-
 
NC_002620  TC0373  30S ribosomal protein S1  25 
 
 		 570 aa  43.1  0.005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0107492  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1350  ribosomal protein S1  32.98 
 
 		 579 aa  43.5  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000154477  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4360  30S ribosomal protein S1  22.45 
 
 		 567 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294177  hitchhiker  0.00911055 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4030  30S ribosomal protein S1  22.45 
 
 		 567 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2053  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31.58 
 
 		 723 aa  43.1  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0570  30S ribosomal protein S1  30.61 
 
 		 592 aa  43.1  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3880  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  30 
 
 		 777 aa  43.1  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1031  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.75 
 
 		 702 aa  42.7  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0967354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3847  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  39.73 
 
 		 711 aa  42.7  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.147568  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2244  30S ribosomal protein S1  24.73 
 
 		 571 aa  42.7  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.777167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1146  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.72 
 
 		 722 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.119982  normal  0.231253 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1577  30S ribosomal protein S1  28.16 
 
 		 587 aa  42.4  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00419028  normal  0.668764 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>