More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1802 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1802  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  100 
 
 
256 aa  497  1e-140  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2023  translation initiation factor 2, alpha subunit  65.66 
 
 
266 aa  352  2.9999999999999997e-96  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576744  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0642  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  38.76 
 
 
265 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000204722  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1152  translation initiation factor 2, alpha subunit  39.52 
 
 
254 aa  178  7e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1359  translation initiation factor 2, alpha subunit  37.69 
 
 
277 aa  173  1.9999999999999998e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.256809  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1699  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  36.14 
 
 
265 aa  156  4e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.328913  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0703  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  37.28 
 
 
262 aa  155  7e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1009  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  35.06 
 
 
265 aa  154  1e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0964  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  35.74 
 
 
265 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.497618  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0982  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  36.05 
 
 
265 aa  150  2e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1567  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  36.14 
 
 
268 aa  142  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0416  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  34.55 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.131172  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1783  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  36.55 
 
 
265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.030089 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0870  translation initiation factor 2, alpha subunit  30.04 
 
 
266 aa  132  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1299  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  32.26 
 
 
257 aa  132  6e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0957  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  33.62 
 
 
261 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.652274  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0995  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  35.71 
 
 
266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1951  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  35.16 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.612676 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1687  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  34.09 
 
 
264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.640158  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0433  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  33.46 
 
 
264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1396  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  33.74 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0200343  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1128  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  31.75 
 
 
264 aa  126  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2051  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  30.65 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2502  translation initiation factor 2, alpha subunit  28.85 
 
 
266 aa  119  4.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2790  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  28.85 
 
 
266 aa  117  3e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.289487  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0077  RNA-binding S1 domain-containing protein  31.36 
 
 
265 aa  115  7.999999999999999e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.541121 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2880  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  26.32 
 
 
277 aa  108  9.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.651055  normal  0.408906 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1009  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  27.8 
 
 
266 aa  103  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00230  eukaryotic translation initiation factor 2 alpha subunit, putative  27.09 
 
 
300 aa  98.6  9e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.433033  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03156  translation initiation factor eIF2 alpha subunit (Eurofung)  26.59 
 
 
308 aa  92  7e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34538  predicted protein  28.46 
 
 
320 aa  85.1  9e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000454395  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119592  Eukaryotic translation initiation factor 2, alpha subunit  26.02 
 
 
322 aa  65.5  0.0000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0150821  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1607  RNA-binding S1 domain-containing protein  35.87 
 
 
365 aa  57.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00859677  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1308  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.71 
 
 
696 aa  56.2  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00697732  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2976  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.71 
 
 
696 aa  56.2  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.31401e-17 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1593  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  36.9 
 
 
697 aa  55.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.029457  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0931  30S ribosomal protein S1  37.97 
 
 
561 aa  55.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0563  30S ribosomal protein S1  37.97 
 
 
560 aa  54.3  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.647894  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1591  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.52 
 
 
697 aa  53.1  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274375  normal  0.0293067 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0956  30S ribosomal protein S1  35.44 
 
 
573 aa  52.4  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00000014577  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3006  general stress protein 13  39.19 
 
 
124 aa  52  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1703  RNA binding S1 domain protein  33.78 
 
 
385 aa  52  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000241805  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1301  RNA binding S1 domain protein  33.75 
 
 
140 aa  52  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000152887  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3285  30S ribosomal protein S1  32.91 
 
 
561 aa  52  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00279338  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0092  RNA binding S1  30.84 
 
 
130 aa  52  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000304617  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1623  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  27.12 
 
 
810 aa  51.6  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.603124  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1543  30S ribosomal protein S1  35.44 
 
 
558 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1906  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.52 
 
 
696 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000617154  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0201  30S ribosomal protein S1  31.65 
 
 
570 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1149  RNA-binding S1 domain-containing protein  31.75 
 
 
124 aa  50.8  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000879414  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2882  30S ribosomal protein S1  31.65 
 
 
570 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0077101  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0428  30S ribosomal protein S1  31.65 
 
 
570 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2469  30S ribosomal protein S1  32.91 
 
 
561 aa  50.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.327946  normal  0.369216 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1235  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.15 
 
 
721 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.434132  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2993  30S ribosomal protein S1  31.65 
 
 
570 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1391  30S ribosomal protein S1  32.91 
 
 
561 aa  50.8  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00553115  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2945  30S ribosomal protein S1  31.65 
 
 
570 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.855668  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4160  30S ribosomal protein S1  31.65 
 
 
570 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2860  general stress protein 13  38.2 
 
 
121 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2572  30S ribosomal protein S1  31.65 
 
 
570 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.196878  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1638  30S ribosomal protein S1  31.65 
 
 
570 aa  50.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.82562  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1107  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.57 
 
 
749 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.583336  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1566  30S ribosomal protein S1  32.91 
 
 
566 aa  50.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1540  30S ribosomal protein S1  32.91 
 
 
558 aa  50.4  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1167  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.15 
 
 
721 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.859366  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3124  30S ribosomal protein S1  32.91 
 
 
562 aa  50.8  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00164205  normal  0.0119703 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0568  30S ribosomal protein S1  31.65 
 
 
570 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742386  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0947  30S ribosomal protein S1  31.65 
 
 
570 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.579155  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1597  30S ribosomal protein S1  32.91 
 
 
558 aa  50.4  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4724  30S ribosomal protein S1  32.91 
 
 
561 aa  51.2  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271218  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2257  30S ribosomal protein S1  31.65 
 
 
570 aa  50.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.165537  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0923  30S ribosomal protein S1  31.65 
 
 
576 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.261659  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1006  30S ribosomal protein S1  31.65 
 
 
576 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1047  30S ribosomal protein S1  31.65 
 
 
576 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1154  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  29.29 
 
 
672 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.225673  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0746  30S ribosomal protein S1  31.65 
 
 
589 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46132  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3001  30S ribosomal protein S1  31.65 
 
 
577 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213018  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0235  30S ribosomal protein S1  29.03 
 
 
577 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.00000120876  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0247  ribosomal protein S1  28.07 
 
 
562 aa  50.4  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1198  30S ribosomal protein S1  33.33 
 
 
557 aa  50.4  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2145  ribosomal protein S1  37.18 
 
 
573 aa  50.1  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000142665  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0927  30S ribosomal protein S1  31.65 
 
 
576 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.722612  normal  0.700665 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1027  RNA binding S1 domain protein  29.25 
 
 
504 aa  50.1  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000173139  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0982  30S ribosomal protein S1  31.65 
 
 
571 aa  50.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144535  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4661  SSU ribosomal protein S1P  35.44 
 
 
609 aa  50.4  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0143658  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1702  30S ribosomal protein S1  29.9 
 
 
577 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1614  30S ribosomal protein S1  31.65 
 
 
562 aa  50.4  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0896  30S ribosomal protein S1  36.49 
 
 
408 aa  50.4  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000252731  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2796  30S ribosomal protein S1  31.65 
 
 
561 aa  50.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.355849  hitchhiker  0.000269522 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1789  30S ribosomal protein S1  31.65 
 
 
561 aa  49.7  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123989 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0745  30S ribosomal protein S1  31.76 
 
 
491 aa  49.7  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.146171  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2244  30S ribosomal protein S1  32.91 
 
 
571 aa  49.7  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.777167  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2169  30S ribosomal protein S1  36.99 
 
 
387 aa  49.3  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000104963  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0964  30S ribosomal protein S1  32.91 
 
 
562 aa  49.3  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0903  ribosomal protein S1  31.65 
 
 
568 aa  49.3  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.055479  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1212  ribosomal protein S1  32.91 
 
 
556 aa  48.9  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0374524  normal  0.207409 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1025  ribosomal protein S1  31.65 
 
 
568 aa  49.3  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000189842  unclonable  0.0000000000588279 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1102  30S ribosomal protein S1  33.33 
 
 
401 aa  48.9  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000946853  normal  0.0119462 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1146  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.1 
 
 
722 aa  49.3  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.119982  normal  0.231253 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1112  RNA binding S1 domain protein  28.57 
 
 
397 aa  48.9  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000019918  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>