More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1152 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1152  translation initiation factor 2, alpha subunit  100 
 
 		 254 aa  516  1.0000000000000001e-145  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1567  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  51.35 
 
 		 268 aa  260  1e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1396  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  51.74 
 
 		 265 aa  256  3e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0200343  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0416  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  50.97 
 
 		 257 aa  243  3e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.131172  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0870  translation initiation factor 2, alpha subunit  47.1 
 
 		 266 aa  237  1e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1128  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  47.64 
 
 		 264 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0957  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  48.44 
 
 		 261 aa  230  1e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.652274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2502  translation initiation factor 2, alpha subunit  45.56 
 
 		 266 aa  229  3e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1009  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  45.04 
 
 		 265 aa  229  3e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2790  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  46.33 
 
 		 266 aa  229  5e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.289487  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2880  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  44.81 
 
 		 277 aa  225  5.0000000000000005e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.651055  normal  0.408906 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1951  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  45.49 
 
 		 263 aa  224  1e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.612676 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0964  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  43.51 
 
 		 265 aa  223  2e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.497618  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0703  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  44.4 
 
 		 262 aa  221  8e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1699  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  43.13 
 
 		 265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.328913  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0982  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  43.51 
 
 		 265 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1009  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  47.49 
 
 		 266 aa  217  2e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2051  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  47.64 
 
 		 259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1299  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  47.66 
 
 		 257 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1359  translation initiation factor 2, alpha subunit  40.7 
 
 		 277 aa  190  2e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.256809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1802  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  39.52 
 
 		 256 aa  178  7e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0642  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  35.29 
 
 		 265 aa  169  6e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000204722  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2023  translation initiation factor 2, alpha subunit  34.92 
 
 		 266 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576744  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0077  RNA-binding S1 domain-containing protein  38.86 
 
 		 265 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.541121 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1783  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  33.2 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.030089 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0433  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  32.79 
 
 		 264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1687  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  31.69 
 
 		 264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.640158  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0995  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  32.2 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03156  translation initiation factor eIF2 alpha subunit (Eurofung)  27.02 
 
 		 308 aa  93.6  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00230  eukaryotic translation initiation factor 2 alpha subunit, putative  27.97 
 
 		 300 aa  90.5  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.433033  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34538  predicted protein  25 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000454395  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119592  Eukaryotic translation initiation factor 2, alpha subunit  24.53 
 
 		 322 aa  75.9  0.0000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0150821  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2860  general stress protein 13  35 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2015  RNA-binding S1 domain-containing protein  37.08 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0652883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2797  hypothetical protein  35.29 
 
 		 134 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000939181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2483  hypothetical protein  35.29 
 
 		 134 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000579369  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0696  hypothetical protein  38.95 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000983919  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1730  RNA-binding S1 domain-containing protein  37.84 
 
 		 403 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0218599  normal  0.469855 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1301  RNA binding S1 domain protein  40 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000152887  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0653  RNA binding S1 domain protein  37.5 
 
 		 120 aa  61.2  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000131287  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0227  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.62 
 
 		 722 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.133448  normal  0.547858 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3070  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.8 
 
 		 707 aa  60.8  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.526485  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1437  RNA binding S1 domain protein  39.19 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.245145  normal  0.159598 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0436  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.62 
 
 		 722 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2662  RNA binding S1  32.31 
 
 		 140 aa  60.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000144376  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1154  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  40.96 
 
 		 672 aa  59.3  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.225673  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0502  RNA-binding S1 domain-containing protein  39.19 
 
 		 415 aa  58.9  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3511  general stress protein 13  34.55 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3006  general stress protein 13  35.71 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1422  RNA-binding S1 domain-containing protein  39.19 
 
 		 503 aa  58.9  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.324209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1031  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.97 
 
 		 702 aa  58.9  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0967354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0743  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  36.46 
 
 		 713 aa  58.5  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.10381  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4722  general stress protein 13  40.74 
 
 		 114 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5039  general stress protein 13  40.74 
 
 		 114 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4770  general stress protein 13  40.74 
 
 		 114 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4610  general stress protein 13  40.74 
 
 		 114 aa  58.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4632  general stress protein 13  40.74 
 
 		 114 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4916  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.11 
 
 		 725 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.937332 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5132  general stress protein 13  40.74 
 
 		 114 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3968  RNA-binding S1 domain-containing protein  40.7 
 
 		 514 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507698  normal  0.122374 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0202  general stress protein 13  40.74 
 
 		 114 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5011  general stress protein 13  40.74 
 
 		 114 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0677  hypothetical protein  38.75 
 
 		 121 aa  58.2  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5032  general stress protein 13  40.74 
 
 		 114 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0608546  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5044  general stress protein 13  40.74 
 
 		 114 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0613  RNA binding S1 domain protein  43.04 
 
 		 558 aa  58.2  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000620529  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0028  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.14 
 
 		 718 aa  57.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.171141 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1703  RNA binding S1 domain protein  40.28 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000241805  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2897  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  36.08 
 
 		 725 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0605  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.89 
 
 		 718 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0674  RNA binding S1  44.59 
 
 		 127 aa  57.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.175739 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0324  hypothetical protein  42.11 
 
 		 124 aa  57  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0939  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  36.08 
 
 		 739 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.57478  normal  0.652932 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1112  RNA binding S1 domain protein  38.16 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000019918  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1292  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.18 
 
 		 721 aa  57  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3080  RNA binding S1 domain protein  41.33 
 
 		 144 aa  57  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000220475  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4027  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.78 
 
 		 752 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.749576  normal  0.189287 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0970  RNA-binding protein  33.71 
 
 		 143 aa  57  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15110  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  40.28 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6517  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  42.47 
 
 		 793 aa  56.6  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.433198  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4396  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.78 
 
 		 745 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.735081 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0892  30S ribosomal protein S1  38.96 
 
 		 399 aa  56.6  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000236762  decreased coverage  0.00000000000000302812 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0530  hypothetical protein  34.38 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000417558  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0543  hypothetical protein  34.38 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000100816  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0268  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  36.46 
 
 		 714 aa  56.6  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00840028 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5522  30S ribosomal protein S1  42.11 
 
 		 495 aa  56.2  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4507  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.78 
 
 		 745 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.398327 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0981  RNA-binding S1 domain-containing protein  36.36 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000445297  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0896  30S ribosomal protein S1  41.67 
 
 		 408 aa  55.8  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000252731  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0514  30S ribosomal protein S1  40.51 
 
 		 557 aa  55.8  0.0000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3344  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.51 
 
 		 722 aa  55.8  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13921  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.66 
 
 		 721 aa  55.8  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13841  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.18 
 
 		 721 aa  55.8  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3198  RNA binding S1 domain protein  39.74 
 
 		 488 aa  55.8  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565242  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0058  hypothetical protein  35.35 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000238948  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4062  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37 
 
 		 712 aa  55.5  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2169  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.87 
 
 		 714 aa  55.5  0.0000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.184355  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1149  RNA-binding S1 domain-containing protein  36.36 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000879414  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1567  30S ribosomal protein S1  40.51 
 
 		 558 aa  55.5  0.0000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.449646  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1995  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.98 
 
 		 815 aa  55.5  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0984059  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>