127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0642 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0642  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  100 
 
 		 265 aa  531  1e-150  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000204722  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2023  translation initiation factor 2, alpha subunit  40.91 
 
 		 266 aa  204  1e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576744  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1802  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  38.76 
 
 		 256 aa  196  5.000000000000001e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0703  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  37.31 
 
 		 262 aa  176  3e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1359  translation initiation factor 2, alpha subunit  36.4 
 
 		 277 aa  170  3e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.256809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1152  translation initiation factor 2, alpha subunit  35.29 
 
 		 254 aa  169  6e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1009  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  34.85 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1699  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  34.34 
 
 		 265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.328913  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0982  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  35.83 
 
 		 265 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0964  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  33.96 
 
 		 265 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.497618  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0433  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  34.6 
 
 		 264 aa  156  3e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1687  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  33.84 
 
 		 264 aa  151  1e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.640158  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0995  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  34.6 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1783  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  33.46 
 
 		 265 aa  149  3e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.030089 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1567  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  33.59 
 
 		 268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0416  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  35.06 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.131172  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0870  translation initiation factor 2, alpha subunit  30.47 
 
 		 266 aa  139  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2790  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  29.46 
 
 		 266 aa  135  7.000000000000001e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.289487  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2502  translation initiation factor 2, alpha subunit  29.41 
 
 		 266 aa  135  9e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1396  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  31.66 
 
 		 265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0200343  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0957  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  33.62 
 
 		 261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.652274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2880  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  29.51 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.651055  normal  0.408906 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1128  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  32.55 
 
 		 264 aa  126  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1951  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  31.08 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.612676 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1009  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  29.8 
 
 		 266 aa  123  4e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2051  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  30.5 
 
 		 259 aa  122  5e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1299  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  33.73 
 
 		 257 aa  122  7e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0077  RNA-binding S1 domain-containing protein  26.79 
 
 		 265 aa  104  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.541121 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00230  eukaryotic translation initiation factor 2 alpha subunit, putative  27.91 
 
 		 300 aa  98.6  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.433033  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34538  predicted protein  25.68 
 
 		 320 aa  85.5  9e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000454395  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119592  Eukaryotic translation initiation factor 2, alpha subunit  25.28 
 
 		 322 aa  80.9  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0150821  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03156  translation initiation factor eIF2 alpha subunit (Eurofung)  25.77 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2860  general stress protein 13  35.96 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3006  general stress protein 13  37.8 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1301  RNA binding S1 domain protein  36.59 
 
 		 140 aa  55.5  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000152887  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1349  RNA-binding S1 domain-containing protein  31.58 
 
 		 543 aa  54.3  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.143474  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1337  RNA-binding S1 domain-containing protein  30.53 
 
 		 543 aa  52.8  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000610744  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4770  general stress protein 13  37.97 
 
 		 114 aa  52.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4610  general stress protein 13  37.97 
 
 		 114 aa  52.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4632  general stress protein 13  37.97 
 
 		 114 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5011  general stress protein 13  37.97 
 
 		 114 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5132  general stress protein 13  37.97 
 
 		 114 aa  52.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1618  RNA-binding S1 domain-containing protein  32.56 
 
 		 532 aa  52.8  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1607  RNA-binding S1 domain-containing protein  39.73 
 
 		 365 aa  52.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00859677  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5032  general stress protein 13  37.97 
 
 		 114 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0608546  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0202  general stress protein 13  37.97 
 
 		 114 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5039  general stress protein 13  37.97 
 
 		 114 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4722  general stress protein 13  37.97 
 
 		 114 aa  52.4  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5044  general stress protein 13  37.97 
 
 		 114 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01200  rRNA processing-related protein, putative  33.78 
 
 		 1484 aa  50.8  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3511  general stress protein 13  34 
 
 		 133 aa  51.2  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2672  30S ribosomal protein S1  37.14 
 
 		 399 aa  50.1  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1577  30S ribosomal protein S1  33.8 
 
 		 587 aa  50.4  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00419028  normal  0.668764 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0059  hypothetical protein  30.91 
 
 		 160 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000000544172  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0060  hypothetical protein  30.91 
 
 		 160 aa  49.3  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0056  hypothetical protein  30.91 
 
 		 160 aa  49.3  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.61011e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0056  hypothetical protein  30.91 
 
 		 160 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000079318  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0060  hypothetical protein  30.91 
 
 		 160 aa  49.3  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0067  hypothetical protein  30.91 
 
 		 160 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0070  hypothetical protein  30.91 
 
 		 160 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000137683  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0056  hypothetical protein  38.16 
 
 		 161 aa  48.9  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000117621  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1102  30S ribosomal protein S1  37.68 
 
 		 401 aa  48.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000946853  normal  0.0119462 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0056  hypothetical protein  38.16 
 
 		 152 aa  48.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000148596  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0066  hypothetical protein  38.16 
 
 		 161 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000157952  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5250  hypothetical protein  38.16 
 
 		 161 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000341067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1112  RNA binding S1 domain protein  32.5 
 
 		 397 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000019918  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0696  hypothetical protein  27.01 
 
 		 140 aa  47.4  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000983919  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0324  hypothetical protein  38.89 
 
 		 124 aa  47  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1795  SSU ribosomal protein S1P  38.03 
 
 		 539 aa  47  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4661  SSU ribosomal protein S1P  32.05 
 
 		 609 aa  47  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0143658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1292  SSU ribosomal protein S1P  35.14 
 
 		 396 aa  46.2  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00025498  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0677  hypothetical protein  32 
 
 		 121 aa  46.2  0.0006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3013  30S ribosomal protein S1  28.89 
 
 		 556 aa  46.2  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000348916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0247  ribosomal protein S1  32.94 
 
 		 562 aa  46.2  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83216  Part of small ribosomal subunit (SSU) processosome (contains U3 snoRNA)  34.78 
 
 		 1699 aa  45.8  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0841775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1221  30S ribosomal protein S1  32.53 
 
 		 382 aa  45.8  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000730459  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2872  RNA binding S1 domain protein  32.43 
 
 		 529 aa  45.4  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.569342  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1200  30S ribosomal protein S1  38.03 
 
 		 402 aa  45.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000802868  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1772  30S ribosomal protein S1  29.66 
 
 		 558 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1107  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.83 
 
 		 749 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.583336  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3942  30S ribosomal protein S1  29.66 
 
 		 558 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.121339  normal  0.203067 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1146  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.96 
 
 		 722 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.119982  normal  0.231253 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1235  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.83 
 
 		 721 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.434132  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1363  30S ribosomal protein S1  29.66 
 
 		 558 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0329116  normal  0.0187285 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1379  30S ribosomal protein S1  29.66 
 
 		 558 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1167  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.83 
 
 		 721 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.859366  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10450  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase  28.09 
 
 		 678 aa  45.4  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000887819  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1625  30S ribosomal protein S1  31.33 
 
 		 382 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000150504  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1882  30S ribosomal protein S1  34.72 
 
 		 573 aa  44.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.48438e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0931  30S ribosomal protein S1  34.29 
 
 		 561 aa  44.3  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1623  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  25 
 
 		 810 aa  44.3  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.603124  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1421  30S ribosomal protein S1  31.33 
 
 		 382 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00177938  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2860  ribosomal protein S1  28.77 
 
 		 557 aa  44.3  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105288 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1661  30S ribosomal protein S1  31.33 
 
 		 382 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1553  30S ribosomal protein S1  31.33 
 
 		 382 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00270143  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3791  30S ribosomal protein S1  31.33 
 
 		 382 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000784339  hitchhiker  0.000188764 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1380  30S ribosomal protein S1  31.33 
 
 		 382 aa  43.9  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107777  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1379  30S ribosomal protein S1  31.33 
 
 		 382 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000385959  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1519  30S ribosomal protein S1  31.33 
 
 		 382 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000156073  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3070  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  29.27 
 
 		 707 aa  43.5  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.526485  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>