More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0416 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0416  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  100 
 
 
257 aa  522  1e-147  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.131172  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1567  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  56.32 
 
 
268 aa  295  3e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1396  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  56.59 
 
 
265 aa  286  2e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0200343  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1128  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  54.37 
 
 
264 aa  270  2e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2051  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  51.76 
 
 
259 aa  264  1e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0870  translation initiation factor 2, alpha subunit  49.62 
 
 
266 aa  263  2e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2502  translation initiation factor 2, alpha subunit  50 
 
 
266 aa  263  3e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1951  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  50.2 
 
 
263 aa  259  4e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.612676 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1299  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  50.98 
 
 
257 aa  254  6e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2880  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  46.86 
 
 
277 aa  253  2.0000000000000002e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.651055  normal  0.408906 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2790  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  48.46 
 
 
266 aa  249  3e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.289487  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1009  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  51.72 
 
 
266 aa  248  8e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0957  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  50.39 
 
 
261 aa  246  2e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.652274  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1152  translation initiation factor 2, alpha subunit  50.97 
 
 
254 aa  243  3e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1009  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  42.91 
 
 
265 aa  204  1e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0964  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  42.53 
 
 
265 aa  202  4e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.497618  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1699  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  41.38 
 
 
265 aa  199  3e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.328913  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0982  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  41.38 
 
 
265 aa  192  4e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0703  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  41.31 
 
 
262 aa  189  5e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0077  RNA-binding S1 domain-containing protein  35.83 
 
 
265 aa  155  8e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.541121 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1359  translation initiation factor 2, alpha subunit  34.11 
 
 
277 aa  144  2e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.256809  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0642  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  35.06 
 
 
265 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000204722  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1802  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  34.55 
 
 
256 aa  134  9.999999999999999e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2023  translation initiation factor 2, alpha subunit  31.8 
 
 
266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576744  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0433  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  31.5 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1687  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  31.1 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.640158  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0995  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  29.67 
 
 
266 aa  107  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1783  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  30.83 
 
 
265 aa  105  8e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.030089 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03156  translation initiation factor eIF2 alpha subunit (Eurofung)  24.71 
 
 
308 aa  69.3  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00230  eukaryotic translation initiation factor 2 alpha subunit, putative  24.38 
 
 
300 aa  68.6  0.00000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.433033  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34538  predicted protein  28.46 
 
 
320 aa  67.4  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000454395  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0696  hypothetical protein  40.43 
 
 
140 aa  63.5  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000983919  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3070  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.8 
 
 
707 aa  63.9  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.526485  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0674  RNA binding S1  40.79 
 
 
127 aa  62.8  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.175739 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31151  predicted protein  37.63 
 
 
1135 aa  61.2  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.219431  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0970  RNA-binding protein  35.71 
 
 
143 aa  61.2  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2860  general stress protein 13  37.5 
 
 
121 aa  59.3  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0247  ribosomal protein S1  39.29 
 
 
562 aa  58.9  0.00000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0202  general stress protein 13  37.5 
 
 
114 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5032  general stress protein 13  37.5 
 
 
114 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0608546  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0142  RNA binding S1 domain protein  42.67 
 
 
128 aa  58.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000417569  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5044  general stress protein 13  37.5 
 
 
114 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5039  general stress protein 13  37.5 
 
 
114 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4770  general stress protein 13  37.5 
 
 
114 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4610  general stress protein 13  37.5 
 
 
114 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4632  general stress protein 13  37.5 
 
 
114 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5132  general stress protein 13  37.5 
 
 
114 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5011  general stress protein 13  37.5 
 
 
114 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0056  hypothetical protein  39.76 
 
 
161 aa  57.4  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000117621  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0066  RNA binding S1 domain protein  40.26 
 
 
129 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4722  general stress protein 13  37.5 
 
 
114 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2860  ribosomal protein S1  34.67 
 
 
557 aa  57.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.105288 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3095  RNA-binding S1 domain-containing protein  41.67 
 
 
501 aa  57.4  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000127417  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0059  hypothetical protein  39.76 
 
 
160 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000000544172  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0060  hypothetical protein  39.76 
 
 
160 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0056  hypothetical protein  39.76 
 
 
160 aa  57  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.61011e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0056  hypothetical protein  39.76 
 
 
160 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000079318  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0559  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  39.13 
 
 
692 aa  57  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.745175 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0395  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  39.13 
 
 
690 aa  57  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0060  hypothetical protein  39.76 
 
 
160 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0067  hypothetical protein  39.76 
 
 
160 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0070  hypothetical protein  39.76 
 
 
160 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000137683  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5250  hypothetical protein  39.76 
 
 
161 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000341067  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0066  hypothetical protein  39.76 
 
 
161 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000157952  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1031  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.28 
 
 
702 aa  57  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0967354  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0089  RNA binding S1  37.8 
 
 
152 aa  56.6  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3511  general stress protein 13  32.35 
 
 
133 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2245  RNA-binding S1 domain-containing protein  40.54 
 
 
798 aa  56.6  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.659597  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0056  hypothetical protein  39.76 
 
 
152 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000148596  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1955  RNA binding S1  39.47 
 
 
718 aa  56.2  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3344  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.5 
 
 
722 aa  56.2  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4396  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.16 
 
 
745 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.735081 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4027  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.16 
 
 
752 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.749576  normal  0.189287 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01307  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.75 
 
 
704 aa  55.8  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.624183  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0514  30S ribosomal protein S1  40.51 
 
 
557 aa  55.8  0.0000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0743  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.74 
 
 
713 aa  55.8  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.10381  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2811  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.75 
 
 
702 aa  55.8  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212974  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0207  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.74 
 
 
700 aa  55.5  0.0000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2015  RNA-binding S1 domain-containing protein  31.18 
 
 
411 aa  55.5  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0652883  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1567  30S ribosomal protein S1  40.51 
 
 
558 aa  55.5  0.0000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.449646  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1995  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  43.21 
 
 
815 aa  55.5  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0984059  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0183  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.74 
 
 
700 aa  55.5  0.0000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1149  RNA-binding S1 domain-containing protein  38.16 
 
 
124 aa  55.1  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000879414  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0991  30S ribosomal protein S1  39.36 
 
 
400 aa  54.7  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3006  general stress protein 13  36.59 
 
 
124 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00900  pre-mRNA splicing factor, putative  37.5 
 
 
1189 aa  55.1  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0653  RNA binding S1 domain protein  40.74 
 
 
120 aa  55.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000131287  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0981  RNA-binding S1 domain-containing protein  38.16 
 
 
124 aa  55.5  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000445297  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3968  RNA-binding S1 domain-containing protein  41.67 
 
 
514 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507698  normal  0.122374 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0436  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.79 
 
 
722 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0227  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.79 
 
 
722 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.133448  normal  0.547858 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4507  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.16 
 
 
745 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.398327 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0479  RNA-binding S1 domain-containing protein  39.73 
 
 
712 aa  54.7  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00985663  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3269  30S ribosomal protein S1  39.36 
 
 
400 aa  54.7  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1301  RNA binding S1 domain protein  32.56 
 
 
140 aa  54.7  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000152887  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0235  30S ribosomal protein S1  31.82 
 
 
577 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.00000120876  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1703  RNA binding S1 domain protein  38.36 
 
 
385 aa  55.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000241805  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1437  RNA binding S1 domain protein  36.11 
 
 
400 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.245145  normal  0.159598 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3632  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.71 
 
 
728 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0176906  hitchhiker  0.00320297 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0605  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.97 
 
 
718 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>