More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1128 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1128  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  100 
 
 		 264 aa  537  9.999999999999999e-153  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2051  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  68.97 
 
 		 259 aa  374  1e-102  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0957  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  64.89 
 
 		 261 aa  344  7e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.652274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1299  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  67.95 
 
 		 257 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1951  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  63.12 
 
 		 263 aa  338  5e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.612676 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0416  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  54.37 
 
 		 257 aa  270  2e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.131172  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1396  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  50.38 
 
 		 265 aa  262  4e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0200343  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1567  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  49.06 
 
 		 268 aa  261  1e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1152  translation initiation factor 2, alpha subunit  47.64 
 
 		 254 aa  232  4.0000000000000004e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2502  translation initiation factor 2, alpha subunit  44.96 
 
 		 266 aa  225  6e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0870  translation initiation factor 2, alpha subunit  43.41 
 
 		 266 aa  218  6e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2880  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  42.91 
 
 		 277 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.651055  normal  0.408906 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0964  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  43.68 
 
 		 265 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.497618  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1009  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  47.49 
 
 		 266 aa  210  2e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2790  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  42.25 
 
 		 266 aa  209  4e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.289487  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1699  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  42.69 
 
 		 265 aa  208  8e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.328913  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0703  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  41.92 
 
 		 262 aa  207  1e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1009  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  42.15 
 
 		 265 aa  207  2e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0982  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  42.53 
 
 		 265 aa  207  2e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1359  translation initiation factor 2, alpha subunit  38.91 
 
 		 277 aa  165  5.9999999999999996e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.256809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0077  RNA-binding S1 domain-containing protein  37.8 
 
 		 265 aa  161  1e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.541121 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2023  translation initiation factor 2, alpha subunit  32.53 
 
 		 266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576744  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1802  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  31.75 
 
 		 256 aa  126  3e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0642  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  32.55 
 
 		 265 aa  126  3e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000204722  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1783  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  30.13 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.030089 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1687  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  28.03 
 
 		 264 aa  116  3e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.640158  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0433  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  28.39 
 
 		 264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0995  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  29.92 
 
 		 266 aa  112  6e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00230  eukaryotic translation initiation factor 2 alpha subunit, putative  29.17 
 
 		 300 aa  99.8  4e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.433033  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34538  predicted protein  29.73 
 
 		 320 aa  83.6  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000454395  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03156  translation initiation factor eIF2 alpha subunit (Eurofung)  27.38 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119592  Eukaryotic translation initiation factor 2, alpha subunit  26.97 
 
 		 322 aa  70.9  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0150821  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0696  hypothetical protein  40.22 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000983919  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2860  general stress protein 13  33.72 
 
 		 121 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0674  RNA binding S1  40.54 
 
 		 127 aa  57.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.175739 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3511  general stress protein 13  32.11 
 
 		 133 aa  54.7  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00900  pre-mRNA splicing factor, putative  39.24 
 
 		 1189 aa  54.3  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0395  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  42.03 
 
 		 690 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3070  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.15 
 
 		 707 aa  54.7  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.526485  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2797  hypothetical protein  36.63 
 
 		 134 aa  53.9  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000939181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2483  hypothetical protein  36.63 
 
 		 134 aa  53.9  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000579369  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0559  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  42.03 
 
 		 692 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.745175 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0970  RNA-binding protein  26.72 
 
 		 143 aa  54.7  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0066  RNA binding S1 domain protein  38.96 
 
 		 129 aa  53.5  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1031  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.89 
 
 		 702 aa  53.5  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0967354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5011  general stress protein 13  32.11 
 
 		 114 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5039  general stress protein 13  32.11 
 
 		 114 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4770  general stress protein 13  32.11 
 
 		 114 aa  52.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4610  general stress protein 13  32.11 
 
 		 114 aa  52.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4632  general stress protein 13  32.11 
 
 		 114 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5132  general stress protein 13  32.11 
 
 		 114 aa  52.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0743  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.33 
 
 		 713 aa  52.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.10381  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5044  general stress protein 13  32.11 
 
 		 114 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0202  general stress protein 13  32.11 
 
 		 114 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5032  general stress protein 13  32.11 
 
 		 114 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0608546  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0142  RNA binding S1 domain protein  41.33 
 
 		 128 aa  52.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000417569  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1703  RNA binding S1 domain protein  36.11 
 
 		 385 aa  51.6  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000241805  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3632  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.78 
 
 		 728 aa  51.6  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0176906  hitchhiker  0.00320297 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4722  general stress protein 13  36.25 
 
 		 114 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2662  RNA binding S1  40.54 
 
 		 140 aa  51.6  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000144376  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0265  RNA binding S1 domain-containing protein  40.26 
 
 		 125 aa  52  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.383538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1618  RNA-binding S1 domain-containing protein  37.97 
 
 		 532 aa  51.6  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0122  RNA-binding S1 domain-containing protein  37.8 
 
 		 126 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2169  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.7 
 
 		 714 aa  50.8  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.184355  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1301  RNA binding S1 domain protein  30.23 
 
 		 140 aa  50.8  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000152887  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1102  30S ribosomal protein S1  37.33 
 
 		 401 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000946853  normal  0.0119462 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1422  RNA-binding S1 domain-containing protein  33.75 
 
 		 503 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.324209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2081  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.7 
 
 		 714 aa  50.8  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0369235  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0703  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.15 
 
 		 713 aa  50.8  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0602  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40 
 
 		 718 aa  50.8  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.597018  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2118  ribosomal protein S1  31.52 
 
 		 596 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000596679  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0653  RNA binding S1 domain protein  37.8 
 
 		 120 aa  51.2  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000131287  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3344  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.57 
 
 		 722 aa  51.2  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0268  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  33.75 
 
 		 714 aa  50.4  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00840028 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0059  hypothetical protein  38.37 
 
 		 160 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000000544172  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0060  hypothetical protein  38.37 
 
 		 160 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0056  hypothetical protein  38.37 
 
 		 160 aa  50.1  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.61011e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0056  hypothetical protein  38.37 
 
 		 160 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000079318  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0066  hypothetical protein  38.37 
 
 		 161 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000157952  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0060  hypothetical protein  38.37 
 
 		 160 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119651  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0070  hypothetical protein  38.37 
 
 		 160 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000137683  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0056  hypothetical protein  38.37 
 
 		 161 aa  50.1  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000117621  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5250  hypothetical protein  38.37 
 
 		 161 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000341067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0067  hypothetical protein  38.37 
 
 		 160 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31151  predicted protein  37.5 
 
 		 1135 aa  50.1  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.219431  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3935  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.56 
 
 		 715 aa  50.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.138516  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42780  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.16 
 
 		 702 aa  50.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.705764  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0235  30S ribosomal protein S1  32.22 
 
 		 577 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.00000120876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0089  RNA binding S1  30.43 
 
 		 152 aa  49.7  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0056  hypothetical protein  38.55 
 
 		 152 aa  49.3  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000148596  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2080  cytidylate kinase/ribosomal protein S1  37.97 
 
 		 811 aa  49.3  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0227  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.33 
 
 		 722 aa  49.3  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.133448  normal  0.547858 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0917  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.77 
 
 		 696 aa  48.9  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.327573  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15110  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  36.49 
 
 		 376 aa  49.3  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1098  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.77 
 
 		 696 aa  48.9  0.00007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3080  RNA binding S1 domain protein  39.19 
 
 		 144 aa  48.9  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000220475  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0991  30S ribosomal protein S1  36.49 
 
 		 400 aa  48.9  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0825  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.94 
 
 		 698 aa  48.9  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0159879 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03393  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.94 
 
 		 710 aa  48.9  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2774  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  29.76 
 
 		 716 aa  48.9  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>