More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_30354 on replicon NC_009357
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009357  OSTLU_30354  Putative mitochondrial ribosomal protein S1  100 
 
 		 352 aa  706    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0824042 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14990  30S ribosomal protein S1  34.48 
 
 		 493 aa  107  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0409109  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1960  RNA binding S1 domain protein  35.47 
 
 		 492 aa  106  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1804  30S ribosomal protein S1  35.47 
 
 		 491 aa  106  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000161597 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2065  30S ribosomal protein S1  35.47 
 
 		 491 aa  106  7e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00632138  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1515  RNA binding S1 domain protein  34.98 
 
 		 490 aa  105  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.906108  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1229  30S ribosomal protein S1  34.98 
 
 		 488 aa  105  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.964467  normal  0.190984 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1191  30S ribosomal protein S1  33.33 
 
 		 485 aa  104  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00406916  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12990  30S ribosomal protein S1  34.48 
 
 		 492 aa  104  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.927286 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20190  SSU ribosomal protein S1P  34.98 
 
 		 496 aa  105  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.287124 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1437  RNA binding S1 domain protein  31.2 
 
 		 400 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.245145  normal  0.159598 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0961  RNA binding S1 domain protein  33.33 
 
 		 496 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2850  RNA binding S1 domain protein  33.81 
 
 		 487 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000968936  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1477  RNA binding S1 domain-containing protein  33.81 
 
 		 480 aa  104  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.22973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2968  Ribosomal protein S1-like protein  33.81 
 
 		 500 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2193  30S ribosomal protein S1  33.33 
 
 		 488 aa  103  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.210966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5494  30S ribosomal protein S1  33 
 
 		 493 aa  102  9e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117184  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1057  30S ribosomal protein S1  33 
 
 		 492 aa  101  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11140  30S ribosomal protein S1  34.48 
 
 		 485 aa  102  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.28152  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3034  30S ribosomal protein S1  33.5 
 
 		 485 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000095518  hitchhiker  0.00573325 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5672  30S ribosomal protein S1  33.99 
 
 		 493 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.457368 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5522  30S ribosomal protein S1  33.5 
 
 		 495 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1112  RNA binding S1 domain protein  38.07 
 
 		 397 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000019918  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1467  30S ribosomal protein S1  36.02 
 
 		 584 aa  99.4  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000364254  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4287  RNA-binding S1 domain-containing protein  36.02 
 
 		 393 aa  99.4  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000310337  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0745  30S ribosomal protein S1  32.86 
 
 		 491 aa  99  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.146171  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11646  30S ribosomal protein S1  33.5 
 
 		 481 aa  99  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.75465 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0934  RNA-binding S1 domain-containing protein  36.02 
 
 		 388 aa  99  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000731277  normal  0.167396 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1089  30S ribosomal protein S1  33 
 
 		 515 aa  98.6  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0119116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2989  30S ribosomal protein S1  32.02 
 
 		 490 aa  99  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0790572  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0601  30S ribosomal protein S1  32.86 
 
 		 500 aa  98.6  2e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0892  30S ribosomal protein S1  32.89 
 
 		 399 aa  97.4  3e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000236762  decreased coverage  0.00000000000000302812 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2872  RNA binding S1 domain protein  33.5 
 
 		 487 aa  97.1  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2435  RNA binding S1 domain protein  33.5 
 
 		 499 aa  97.1  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3198  RNA binding S1 domain protein  33.5 
 
 		 488 aa  97.1  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565242  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3713  RNA-binding S1 domain-containing protein  37.93 
 
 		 397 aa  97.4  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000276005  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3356  30S ribosomal protein S1  33 
 
 		 481 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0698685  normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3561  30S ribosomal protein S1  33 
 
 		 481 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0469219  normal  0.360425 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2948  30S ribosomal protein S1  34.44 
 
 		 505 aa  96.7  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.188906 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1329  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  32.41 
 
 		 736 aa  96.3  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000119457  normal  0.0289615 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25930  30S ribosomal protein S1  32.51 
 
 		 495 aa  96.3  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3020  30S ribosomal protein S1  33 
 
 		 479 aa  95.9  9e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156856  normal  0.0844361 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1079  RNA binding S1 domain protein  33.98 
 
 		 427 aa  95.9  9e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3005  30S ribosomal protein S1  33 
 
 		 479 aa  95.9  9e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3051  30S ribosomal protein S1  33 
 
 		 479 aa  95.9  9e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2145  ribosomal protein S1  33.33 
 
 		 573 aa  95.5  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000142665  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2015  RNA-binding S1 domain-containing protein  34.07 
 
 		 411 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0652883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2382  ribosomal protein S1  32.38 
 
 		 608 aa  94  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal  0.526812 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0502  RNA-binding S1 domain-containing protein  33.83 
 
 		 415 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2523  RNA binding S1 domain protein  35.2 
 
 		 405 aa  92.4  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.270612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1730  RNA-binding S1 domain-containing protein  35.43 
 
 		 403 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0218599  normal  0.469855 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1413  30S ribosomal protein S1  32.5 
 
 		 555 aa  91.3  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0578612  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0149  30S ribosomal protein S1  32.68 
 
 		 569 aa  91.7  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1292  ribosomal protein S1  34.1 
 
 		 720 aa  91.7  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1178  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  34.57 
 
 		 677 aa  91.7  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.426785  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0293  30S ribosomal protein S1  33.33 
 
 		 573 aa  90.9  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1577  30S ribosomal protein S1  35.29 
 
 		 587 aa  90.9  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00419028  normal  0.668764 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0563  30S ribosomal protein S1  34.2 
 
 		 560 aa  90.9  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.647894  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0991  30S ribosomal protein S1  34.65 
 
 		 400 aa  90.5  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0962  RNA binding S1 domain protein  34.98 
 
 		 418 aa  90.5  4e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.331059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3269  30S ribosomal protein S1  34.65 
 
 		 400 aa  90.5  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1350  RNA binding S1 domain protein  34.76 
 
 		 431 aa  89.7  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0309  30S ribosomal protein S1  37.11 
 
 		 564 aa  89.7  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.470191 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2603  30S ribosomal protein S1  32.31 
 
 		 574 aa  89.4  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00445858  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1376  30S ribosomal protein S1  33.16 
 
 		 558 aa  88.6  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1372  30S ribosomal protein S1  33.16 
 
 		 558 aa  88.6  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1330  ribosomal protein S1  32.71 
 
 		 560 aa  89.4  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000364638  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2917  30S ribosomal protein S1  31.79 
 
 		 571 aa  88.6  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.371234  normal  0.0728232 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0931  30S ribosomal protein S1  32.72 
 
 		 561 aa  89  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1212  ribosomal protein S1  33.17 
 
 		 556 aa  89  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0374524  normal  0.207409 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3385  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  30.09 
 
 		 661 aa  89  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000070499  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2860  ribosomal protein S1  29.63 
 
 		 557 aa  88.6  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105288 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3140  30S ribosomal protein S1  33.99 
 
 		 493 aa  88.2  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3369  30S ribosomal protein S1  33.99 
 
 		 493 aa  88.2  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.412554  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0754  30S ribosomal protein S1  30.85 
 
 		 575 aa  88.2  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0180  30S ribosomal protein S1  35.12 
 
 		 561 aa  87.8  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000762655  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1292  SSU ribosomal protein S1P  36.41 
 
 		 396 aa  87.4  3e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00025498  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1154  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  32.16 
 
 		 672 aa  87  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.225673  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2872  RNA binding S1 domain protein  29.52 
 
 		 529 aa  87  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.569342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05300  SSU ribosomal protein S1P  31.78 
 
 		 403 aa  87  4e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.467971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0867  30S ribosomal protein S1  29.44 
 
 		 586 aa  86.7  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314961  normal  0.0879612 
 
 
-
 
NC_004310  BR0027  30S ribosomal protein S1  30.68 
 
 		 566 aa  86.7  6e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.173864  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0026  30S ribosomal protein S1  30.68 
 
 		 566 aa  86.7  6e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0029  30S ribosomal protein S1  30.68 
 
 		 566 aa  86.7  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10333  30S ribosomal protein S1  30.81 
 
 		 619 aa  86.3  7e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.869439  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0103  30S ribosomal protein S1  32.31 
 
 		 569 aa  86.3  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.924927 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2229  30S ribosomal protein S1  31.02 
 
 		 571 aa  86.3  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.516713  normal  0.0580456 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2672  30S ribosomal protein S1  34.38 
 
 		 399 aa  85.9  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1198  30S ribosomal protein S1  30.59 
 
 		 557 aa  85.9  9e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3458  30S ribosomal protein S1  30.11 
 
 		 568 aa  85.9  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0194  30S ribosomal protein S1  30.68 
 
 		 573 aa  85.5  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.571877  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2936  30S ribosomal protein S1  29.79 
 
 		 577 aa  85.9  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4360  30S ribosomal protein S1  30.11 
 
 		 567 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294177  hitchhiker  0.00911055 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3255  30S ribosomal protein S1  30.77 
 
 		 584 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000271492  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0675  30S ribosomal protein S1  30.48 
 
 		 582 aa  84.7  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.690527 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0995  30S ribosomal protein S1  30.77 
 
 		 584 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4030  30S ribosomal protein S1  30.11 
 
 		 567 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3606  30S ribosomal protein S1  30.11 
 
 		 569 aa  84.7  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0098  30S ribosomal protein S1  30.65 
 
 		 566 aa  85.1  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1350  ribosomal protein S1  30.91 
 
 		 579 aa  84.7  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000154477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>