234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_34538 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_34538  predicted protein  100 
 
 		 320 aa  649    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000454395  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03156  translation initiation factor eIF2 alpha subunit (Eurofung)  58.28 
 
 		 308 aa  360  2e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00230  eukaryotic translation initiation factor 2 alpha subunit, putative  54.95 
 
 		 300 aa  330  2e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.433033  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119592  Eukaryotic translation initiation factor 2, alpha subunit  49.33 
 
 		 322 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0150821  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1359  translation initiation factor 2, alpha subunit  28.86 
 
 		 277 aa  93.2  5e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.256809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0077  RNA-binding S1 domain-containing protein  28.35 
 
 		 265 aa  92  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.541121 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0703  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  25.81 
 
 		 262 aa  91.7  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1009  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  26.64 
 
 		 265 aa  89.7  6e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0982  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  25.1 
 
 		 265 aa  88.6  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2023  translation initiation factor 2, alpha subunit  28.47 
 
 		 266 aa  87  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576744  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0964  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  25 
 
 		 265 aa  87  4e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.497618  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1802  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  28.46 
 
 		 256 aa  85.1  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0642  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  25.68 
 
 		 265 aa  85.5  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000204722  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1128  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  29.73 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1699  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  23.79 
 
 		 265 aa  83.2  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.328913  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1152  translation initiation factor 2, alpha subunit  25 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1567  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  26.52 
 
 		 268 aa  77.4  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2790  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  23.94 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.289487  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2051  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  25.68 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1951  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  24.81 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.612676 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1396  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  23.92 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0200343  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0416  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  28.46 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.131172  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0957  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  25.64 
 
 		 261 aa  62  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.652274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2502  translation initiation factor 2, alpha subunit  23.55 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0870  translation initiation factor 2, alpha subunit  24.81 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1350  RNA binding S1 domain protein  35.71 
 
 		 431 aa  56.2  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2880  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  21.25 
 
 		 277 aa  55.8  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.651055  normal  0.408906 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1702  30S ribosomal protein S1  32.41 
 
 		 577 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0507  30S ribosomal protein S1  33.33 
 
 		 574 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.762722  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0867  30S ribosomal protein S1  28.7 
 
 		 586 aa  54.3  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314961  normal  0.0879612 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3255  30S ribosomal protein S1  29.63 
 
 		 584 aa  53.1  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000271492  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22161  30S ribosomal protein S1  34.18 
 
 		 367 aa  52.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0995  30S ribosomal protein S1  29.63 
 
 		 584 aa  52.8  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1299  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  35.37 
 
 		 257 aa  52.8  0.000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1505  30S ribosomal protein S1  34.18 
 
 		 343 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000040832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3490  30S ribosomal protein S1  34.18 
 
 		 328 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4111  RNA-binding S1 domain-containing protein  34.18 
 
 		 341 aa  52  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2603  30S ribosomal protein S1  27.66 
 
 		 574 aa  51.2  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00445858  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4661  SSU ribosomal protein S1P  27.72 
 
 		 609 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0143658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3072  30S ribosomal protein S1  34.18 
 
 		 331 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4028  30S ribosomal protein S1  34.18 
 
 		 321 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.861757  hitchhiker  0.00019437 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3048  30S ribosomal protein S1  34.18 
 
 		 331 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00340355  normal  0.25508 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1607  RNA-binding S1 domain-containing protein  30.11 
 
 		 365 aa  50.8  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00859677  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2015  RNA-binding S1 domain-containing protein  32.26 
 
 		 411 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0652883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0235  30S ribosomal protein S1  32.63 
 
 		 577 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.00000120876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0714  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  29.46 
 
 		 694 aa  50.8  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000369991  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1009  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  24.89 
 
 		 266 aa  50.4  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0502  RNA-binding S1 domain-containing protein  30.11 
 
 		 415 aa  50.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1292  ribosomal protein S1  27.37 
 
 		 720 aa  50.1  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1783  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  23.58 
 
 		 265 aa  50.1  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.030089 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1730  RNA-binding S1 domain-containing protein  32.26 
 
 		 403 aa  49.7  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0218599  normal  0.469855 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3713  RNA-binding S1 domain-containing protein  29.09 
 
 		 397 aa  49.7  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000276005  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1025  ribosomal protein S1  25.53 
 
 		 568 aa  49.3  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000189842  unclonable  0.0000000000588279 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0903  ribosomal protein S1  25.53 
 
 		 568 aa  49.3  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.055479  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1728  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  29.17 
 
 		 672 aa  49.3  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0455896  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0850  30S ribosomal protein S1  25.53 
 
 		 562 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.334273 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0909  30S ribosomal protein S1  25.53 
 
 		 562 aa  48.9  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2569  30S ribosomal protein S1  25.53 
 
 		 564 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1854  30S ribosomal protein S1  30.28 
 
 		 560 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.229903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0149  30S ribosomal protein S1  34.55 
 
 		 569 aa  48.5  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0722  30S ribosomal protein S1  25.53 
 
 		 564 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0779  30S ribosomal protein S1  25.53 
 
 		 562 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0110313 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15870  30S ribosomal protein S1  30 
 
 		 559 aa  49.3  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3001  30S ribosomal protein S1  25.53 
 
 		 577 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213018  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0428  30S ribosomal protein S1  25.53 
 
 		 570 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1687  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  23.33 
 
 		 264 aa  48.1  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.640158  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0927  30S ribosomal protein S1  25.53 
 
 		 576 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.722612  normal  0.700665 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2257  30S ribosomal protein S1  25.53 
 
 		 570 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.165537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4030  30S ribosomal protein S1  23.4 
 
 		 567 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2993  30S ribosomal protein S1  25.53 
 
 		 570 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4160  30S ribosomal protein S1  25.53 
 
 		 570 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0746  30S ribosomal protein S1  25.53 
 
 		 589 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1867  30S ribosomal protein S1  33.33 
 
 		 367 aa  48.1  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.61448  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0468  30S ribosomal protein S1  33.33 
 
 		 386 aa  48.1  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0964  30S ribosomal protein S1  26.6 
 
 		 562 aa  48.1  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1638  30S ribosomal protein S1  25.53 
 
 		 570 aa  47.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.82562  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4360  30S ribosomal protein S1  23.4 
 
 		 567 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294177  hitchhiker  0.00911055 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0982  30S ribosomal protein S1  25.53 
 
 		 571 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2163  30S ribosomal protein S1  30.56 
 
 		 559 aa  48.1  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0054934  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0201  30S ribosomal protein S1  25.53 
 
 		 570 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0568  30S ribosomal protein S1  25.53 
 
 		 570 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742386  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4663  30S ribosomal protein S1  31.65 
 
 		 390 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0608752  decreased coverage  0.00279875 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2945  30S ribosomal protein S1  25.53 
 
 		 570 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.855668  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0098  30S ribosomal protein S1  26.6 
 
 		 566 aa  48.1  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0923  30S ribosomal protein S1  25.53 
 
 		 576 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.261659  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1308  30S ribosomal protein S1  26 
 
 		 557 aa  48.1  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.302956  hitchhiker  0.0000000365743 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2882  30S ribosomal protein S1  25.53 
 
 		 570 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0077101  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1047  30S ribosomal protein S1  25.53 
 
 		 576 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1006  30S ribosomal protein S1  25.53 
 
 		 576 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0433  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  23.71 
 
 		 264 aa  48.5  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0500  30S ribosomal protein S1  26 
 
 		 557 aa  48.1  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.170768  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3285  30S ribosomal protein S1  25 
 
 		 561 aa  47.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00279338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2796  30S ribosomal protein S1  25.53 
 
 		 561 aa  47.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.355849  hitchhiker  0.000269522 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2572  30S ribosomal protein S1  25.53 
 
 		 570 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.196878  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3124  30S ribosomal protein S1  25 
 
 		 562 aa  48.5  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00164205  normal  0.0119703 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0563  30S ribosomal protein S1  25.53 
 
 		 560 aa  48.1  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.647894  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2244  30S ribosomal protein S1  26.6 
 
 		 571 aa  48.1  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.777167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0947  30S ribosomal protein S1  25.53 
 
 		 570 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.579155  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3035  30S ribosomal protein S1  27 
 
 		 567 aa  47.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00687642  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1795  SSU ribosomal protein S1P  26.72 
 
 		 539 aa  47.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>