93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_119592 on replicon NC_009356
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009356  OSTLU_119592  Eukaryotic translation initiation factor 2, alpha subunit  100 
 
 
322 aa  657    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0150821  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03156  translation initiation factor eIF2 alpha subunit (Eurofung)  51.52 
 
 
308 aa  308  6.999999999999999e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34538  predicted protein  49.33 
 
 
320 aa  289  5.0000000000000004e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000454395  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00230  eukaryotic translation initiation factor 2 alpha subunit, putative  48.7 
 
 
300 aa  286  4e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.433033  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1009  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  27.34 
 
 
265 aa  83.6  0.000000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0982  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  26.55 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0642  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  25.28 
 
 
265 aa  80.9  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000204722  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0964  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  27.04 
 
 
265 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.497618  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1699  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  26.38 
 
 
265 aa  75.9  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.328913  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1152  translation initiation factor 2, alpha subunit  24.53 
 
 
254 aa  75.9  0.0000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1567  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  23.59 
 
 
268 aa  72  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0703  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  21.9 
 
 
262 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1128  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  26.97 
 
 
264 aa  70.9  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2051  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  24.82 
 
 
259 aa  67  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1359  translation initiation factor 2, alpha subunit  30.87 
 
 
277 aa  65.9  0.0000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.256809  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1802  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  26.02 
 
 
256 aa  65.5  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0077  RNA-binding S1 domain-containing protein  25.28 
 
 
265 aa  64.7  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.541121 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2790  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  24.91 
 
 
266 aa  65.1  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.289487  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0957  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  24.26 
 
 
261 aa  63.9  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.652274  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1951  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  23.29 
 
 
263 aa  63.5  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.612676 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1396  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  25.36 
 
 
265 aa  61.2  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0200343  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2023  translation initiation factor 2, alpha subunit  24.81 
 
 
266 aa  58.2  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576744  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2502  translation initiation factor 2, alpha subunit  24.62 
 
 
266 aa  55.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0870  translation initiation factor 2, alpha subunit  23.6 
 
 
266 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0416  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  21.66 
 
 
257 aa  53.1  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.131172  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1299  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  23.66 
 
 
257 aa  53.1  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3255  30S ribosomal protein S1  36.49 
 
 
584 aa  51.6  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000271492  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0995  30S ribosomal protein S1  36.49 
 
 
584 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1795  SSU ribosomal protein S1P  40.58 
 
 
539 aa  51.2  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0507  30S ribosomal protein S1  26.13 
 
 
574 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.762722  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1702  30S ribosomal protein S1  27.37 
 
 
577 aa  49.3  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2880  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  23.83 
 
 
277 aa  48.9  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.651055  normal  0.408906 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1607  RNA-binding S1 domain-containing protein  31.18 
 
 
365 aa  48.9  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00859677  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0433  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  24.27 
 
 
264 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0235  30S ribosomal protein S1  27.37 
 
 
577 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.00000120876  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0201  30S ribosomal protein S1  28.92 
 
 
570 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2569  30S ribosomal protein S1  32.43 
 
 
564 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2993  30S ribosomal protein S1  28.92 
 
 
570 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0779  30S ribosomal protein S1  32.43 
 
 
562 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0110313 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4160  30S ribosomal protein S1  28.92 
 
 
570 aa  47.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2257  30S ribosomal protein S1  28.92 
 
 
570 aa  47.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.165537  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0927  30S ribosomal protein S1  28.92 
 
 
576 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.722612  normal  0.700665 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0428  30S ribosomal protein S1  28.92 
 
 
570 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1638  30S ribosomal protein S1  28.92 
 
 
570 aa  47.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.82562  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1006  30S ribosomal protein S1  28.92 
 
 
576 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0909  30S ribosomal protein S1  32.43 
 
 
562 aa  47.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0722  30S ribosomal protein S1  32.43 
 
 
564 aa  47.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151231  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0568  30S ribosomal protein S1  28.92 
 
 
570 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2945  30S ribosomal protein S1  28.92 
 
 
570 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.855668  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2882  30S ribosomal protein S1  28.92 
 
 
570 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0077101  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0850  30S ribosomal protein S1  32.43 
 
 
562 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.334273 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0947  30S ribosomal protein S1  28.92 
 
 
570 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.579155  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0923  30S ribosomal protein S1  28.92 
 
 
576 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.261659  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2244  30S ribosomal protein S1  34.72 
 
 
571 aa  47.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.777167  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2572  30S ribosomal protein S1  28.92 
 
 
570 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.196878  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1047  30S ribosomal protein S1  28.92 
 
 
576 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0964  30S ribosomal protein S1  34.72 
 
 
562 aa  47  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1981  ribosomal protein S1  30.09 
 
 
604 aa  47  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000204813  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1308  30S ribosomal protein S1  33.33 
 
 
557 aa  46.6  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.302956  hitchhiker  0.0000000365743 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0500  30S ribosomal protein S1  33.33 
 
 
557 aa  46.6  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.170768  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0867  30S ribosomal protein S1  28.92 
 
 
586 aa  46.6  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314961  normal  0.0879612 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1350  RNA binding S1 domain protein  30.93 
 
 
431 aa  46.2  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2603  30S ribosomal protein S1  28.75 
 
 
574 aa  45.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00445858  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2163  30S ribosomal protein S1  28.32 
 
 
559 aa  45.4  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0054934  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3385  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  28.92 
 
 
661 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000070499  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1009  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  33.73 
 
 
266 aa  45.4  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1687  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  23.17 
 
 
264 aa  45.1  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.640158  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0746  30S ribosomal protein S1  27.71 
 
 
589 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46132  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0373  30S ribosomal protein S1  28.89 
 
 
570 aa  44.7  0.002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0107492  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2069  30S ribosomal protein S1  33.33 
 
 
571 aa  44.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0000607618  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4030  30S ribosomal protein S1  20.41 
 
 
567 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0896  30S ribosomal protein S1  25.62 
 
 
408 aa  45.1  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000252731  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2469  30S ribosomal protein S1  31.94 
 
 
561 aa  45.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.327946  normal  0.369216 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4360  30S ribosomal protein S1  20.41 
 
 
567 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294177  hitchhiker  0.00911055 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1391  30S ribosomal protein S1  31.94 
 
 
561 aa  45.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00553115  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3001  30S ribosomal protein S1  27.71 
 
 
577 aa  44.3  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213018  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0982  30S ribosomal protein S1  27.71 
 
 
571 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144535  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1280  30S ribosomal protein S1  31.08 
 
 
559 aa  43.5  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0113187  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1783  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  22.26 
 
 
265 aa  43.5  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.030089 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0563  30S ribosomal protein S1  26.83 
 
 
560 aa  43.5  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.647894  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1467  30S ribosomal protein S1  30.12 
 
 
584 aa  43.5  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000364254  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5424  RNA binding S1 domain protein  32.1 
 
 
763 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3285  30S ribosomal protein S1  30.56 
 
 
561 aa  43.1  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00279338  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3035  30S ribosomal protein S1  31.94 
 
 
567 aa  42.7  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00687642  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4724  30S ribosomal protein S1  30.56 
 
 
561 aa  43.1  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271218  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07900  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  36.36 
 
 
705 aa  42.7  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1154  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  31.33 
 
 
672 aa  42.7  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.225673  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19980  SSU ribosomal protein S1P  32.43 
 
 
407 aa  42.7  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1614  30S ribosomal protein S1  29.73 
 
 
562 aa  42.7  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0408  ribosomal protein S1  26.8 
 
 
553 aa  42.7  0.009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.460478  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0927  30S ribosomal protein S1  30.56 
 
 
569 aa  42.7  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000030887  normal  0.340595 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1071  30S ribosomal protein S1  30.56 
 
 
569 aa  42.7  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000319804  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1566  30S ribosomal protein S1  30.56 
 
 
566 aa  42.4  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>