More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1951 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1951  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  100 
 
 		 263 aa  529  1e-149  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.612676 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2051  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  64.23 
 
 		 259 aa  340  1e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1128  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  63.12 
 
 		 264 aa  338  5e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0957  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  62.84 
 
 		 261 aa  322  3e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.652274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1299  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  61.24 
 
 		 257 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0416  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  50.2 
 
 		 257 aa  259  4e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.131172  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1567  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  47.01 
 
 		 268 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1396  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  47.17 
 
 		 265 aa  246  3e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0200343  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1152  translation initiation factor 2, alpha subunit  45.49 
 
 		 254 aa  224  1e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2880  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  43.61 
 
 		 277 aa  215  5e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.651055  normal  0.408906 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0870  translation initiation factor 2, alpha subunit  43.02 
 
 		 266 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2502  translation initiation factor 2, alpha subunit  43.02 
 
 		 266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2790  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  43.95 
 
 		 266 aa  207  1e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.289487  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1009  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  39.62 
 
 		 265 aa  195  7e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0964  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  38.46 
 
 		 265 aa  191  1e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.497618  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1009  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  42.06 
 
 		 266 aa  187  2e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1699  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  37.45 
 
 		 265 aa  185  7e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.328913  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0703  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  35.8 
 
 		 262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0982  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  36.54 
 
 		 265 aa  182  6e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1359  translation initiation factor 2, alpha subunit  34.92 
 
 		 277 aa  154  1e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.256809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0077  RNA-binding S1 domain-containing protein  36.08 
 
 		 265 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.541121 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1802  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  35.16 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0642  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  31.08 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000204722  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2023  translation initiation factor 2, alpha subunit  31.01 
 
 		 266 aa  121  9.999999999999999e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576744  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1783  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  28.22 
 
 		 265 aa  106  4e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.030089 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1687  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  28.63 
 
 		 264 aa  105  6e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.640158  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0433  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  28.22 
 
 		 264 aa  105  9e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0995  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  29.03 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00230  eukaryotic translation initiation factor 2 alpha subunit, putative  26.32 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.433033  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03156  translation initiation factor eIF2 alpha subunit (Eurofung)  25.57 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34538  predicted protein  24.81 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000454395  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119592  Eukaryotic translation initiation factor 2, alpha subunit  23.29 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0150821  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0674  RNA binding S1  44.59 
 
 		 127 aa  61.2  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.175739 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0970  RNA-binding protein  30.36 
 
 		 143 aa  58.5  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0696  hypothetical protein  43.06 
 
 		 140 aa  57.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000983919  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3511  general stress protein 13  35.29 
 
 		 133 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0395  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  44.78 
 
 		 690 aa  56.6  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0559  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  44.78 
 
 		 692 aa  56.6  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.745175 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3006  general stress protein 13  35.19 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1031  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.67 
 
 		 702 aa  55.5  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0967354  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5039  general stress protein 13  34.58 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5044  general stress protein 13  34.58 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4770  general stress protein 13  34.58 
 
 		 114 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4610  general stress protein 13  34.58 
 
 		 114 aa  55.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5032  general stress protein 13  34.58 
 
 		 114 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0608546  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4632  general stress protein 13  34.58 
 
 		 114 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5132  general stress protein 13  34.58 
 
 		 114 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0202  general stress protein 13  34.58 
 
 		 114 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3070  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.37 
 
 		 707 aa  54.7  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.526485  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2797  hypothetical protein  36.96 
 
 		 134 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000939181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2483  hypothetical protein  36.96 
 
 		 134 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000579369  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1301  RNA binding S1 domain protein  33.72 
 
 		 140 aa  54.7  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000152887  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5011  general stress protein 13  34.58 
 
 		 114 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0066  RNA binding S1 domain protein  44.12 
 
 		 129 aa  54.3  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4722  general stress protein 13  34.58 
 
 		 114 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3344  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.28 
 
 		 722 aa  54.3  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0743  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.74 
 
 		 713 aa  54.3  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.10381  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2662  RNA binding S1  36.71 
 
 		 140 aa  53.9  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000144376  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1146  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.07 
 
 		 722 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.119982  normal  0.231253 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0235  30S ribosomal protein S1  36.36 
 
 		 577 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.00000120876  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0324  hypothetical protein  35.64 
 
 		 124 aa  52.8  0.000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2169  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.78 
 
 		 714 aa  52.4  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.184355  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2081  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.78 
 
 		 714 aa  52.4  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0369235  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42780  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.89 
 
 		 702 aa  52.4  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.705764  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2080  cytidylate kinase/ribosomal protein S1  39.24 
 
 		 811 aa  52  0.000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1561  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.8 
 
 		 699 aa  51.6  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000108143  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0981  RNA-binding S1 domain-containing protein  36.19 
 
 		 124 aa  52  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000445297  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1098  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.58 
 
 		 696 aa  51.6  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0058  hypothetical protein  38.82 
 
 		 132 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000238948  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1149  RNA-binding S1 domain-containing protein  36.19 
 
 		 124 aa  52  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000879414  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0917  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.58 
 
 		 696 aa  51.6  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.327573  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0677  hypothetical protein  36.26 
 
 		 121 aa  52  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1593  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.67 
 
 		 697 aa  50.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.029457  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0059  hypothetical protein  34.34 
 
 		 160 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000000544172  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0056  hypothetical protein  34.34 
 
 		 161 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000117621  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0060  hypothetical protein  34.34 
 
 		 160 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0056  hypothetical protein  34.34 
 
 		 160 aa  50.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.61011e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0056  hypothetical protein  34.34 
 
 		 160 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000079318  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1235  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.02 
 
 		 721 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.434132  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2860  general stress protein 13  34.12 
 
 		 121 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0812  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.71 
 
 		 706 aa  50.8  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2264  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1102  30S ribosomal protein S1  38.67 
 
 		 401 aa  51.2  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000946853  normal  0.0119462 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1591  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.67 
 
 		 697 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274375  normal  0.0293067 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0060  hypothetical protein  34.34 
 
 		 160 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119651  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0070  hypothetical protein  34.34 
 
 		 160 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000137683  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1107  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.02 
 
 		 749 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.583336  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5457  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.89 
 
 		 701 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1167  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.02 
 
 		 721 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.859366  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0067  hypothetical protein  34.34 
 
 		 160 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1944  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.85 
 
 		 720 aa  51.2  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0229407 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62710  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.89 
 
 		 701 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.14789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0066  hypothetical protein  32.14 
 
 		 161 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000157952  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5250  hypothetical protein  32.14 
 
 		 161 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000341067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0653  RNA binding S1 domain protein  34.94 
 
 		 120 aa  50.4  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000131287  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0056  hypothetical protein  36.47 
 
 		 132 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3374  RNA-binding S1 domain-containing protein  30.43 
 
 		 786 aa  50.4  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0056  hypothetical protein  38.96 
 
 		 152 aa  50.1  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000148596  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0825  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.91 
 
 		 698 aa  50.4  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0159879 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0541  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  37.5 
 
 		 711 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4573  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.19 
 
 		 701 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.348013  normal  0.924419 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>