More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1299 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1299  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  100 
 
 		 257 aa  521  1e-147  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2051  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  67.7 
 
 		 259 aa  356  1.9999999999999998e-97  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1128  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  67.95 
 
 		 264 aa  348  5e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0957  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  64.59 
 
 		 261 aa  341  7e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.652274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1951  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  61.24 
 
 		 263 aa  320  1.9999999999999998e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.612676 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0416  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  50.98 
 
 		 257 aa  263  3e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.131172  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1567  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  48.28 
 
 		 268 aa  261  1e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1396  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  49.62 
 
 		 265 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0200343  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0870  translation initiation factor 2, alpha subunit  45.35 
 
 		 266 aa  228  7e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2880  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  43.28 
 
 		 277 aa  223  3e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.651055  normal  0.408906 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1009  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  48.44 
 
 		 266 aa  223  3e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1152  translation initiation factor 2, alpha subunit  47.66 
 
 		 254 aa  222  4e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2502  translation initiation factor 2, alpha subunit  44.75 
 
 		 266 aa  221  9.999999999999999e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2790  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  44.53 
 
 		 266 aa  219  5e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.289487  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0964  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  42.8 
 
 		 265 aa  206  2e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.497618  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1699  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  42.05 
 
 		 265 aa  206  3e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.328913  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0982  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  42.8 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1009  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  40.15 
 
 		 265 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0703  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  38.46 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0077  RNA-binding S1 domain-containing protein  33.98 
 
 		 265 aa  157  1e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.541121 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1359  translation initiation factor 2, alpha subunit  34.75 
 
 		 277 aa  143  3e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.256809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1802  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  32.26 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0642  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  33.73 
 
 		 265 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000204722  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2023  translation initiation factor 2, alpha subunit  33.19 
 
 		 266 aa  129  6e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576744  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1783  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  28.51 
 
 		 265 aa  101  9e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.030089 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0433  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  27.27 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1687  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  28.81 
 
 		 264 aa  100  3e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.640158  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0995  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  28.46 
 
 		 266 aa  96.3  4e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00230  eukaryotic translation initiation factor 2 alpha subunit, putative  25.29 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.433033  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03156  translation initiation factor eIF2 alpha subunit (Eurofung)  24.42 
 
 		 308 aa  68.9  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1031  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  44.44 
 
 		 702 aa  62.4  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0967354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0674  RNA binding S1  44.59 
 
 		 127 aa  61.6  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.175739 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3511  general stress protein 13  36.54 
 
 		 133 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0142  RNA binding S1 domain protein  40 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000417569  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5039  general stress protein 13  41.25 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4722  general stress protein 13  41.25 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5032  general stress protein 13  41.25 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0608546  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4770  general stress protein 13  41.25 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4610  general stress protein 13  41.25 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4632  general stress protein 13  41.25 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5011  general stress protein 13  41.25 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5132  general stress protein 13  41.25 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5044  general stress protein 13  41.25 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0202  general stress protein 13  41.25 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2797  hypothetical protein  34.58 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000939181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2483  hypothetical protein  34.58 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000579369  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119592  Eukaryotic translation initiation factor 2, alpha subunit  23.66 
 
 		 322 aa  58.5  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0150821  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2860  general stress protein 13  36.9 
 
 		 121 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1102  30S ribosomal protein S1  39.47 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000946853  normal  0.0119462 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0235  30S ribosomal protein S1  33.7 
 
 		 577 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.00000120876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42780  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  43.24 
 
 		 702 aa  57  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.705764  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3344  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.74 
 
 		 722 aa  57  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0743  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.79 
 
 		 713 aa  56.6  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.10381  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3070  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  36.59 
 
 		 707 aa  56.6  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.526485  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2169  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.48 
 
 		 714 aa  56.2  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.184355  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5457  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  43.24 
 
 		 701 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62710  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  43.24 
 
 		 701 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.14789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2081  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.48 
 
 		 714 aa  56.2  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0369235  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3006  general stress protein 13  40.24 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0696  hypothetical protein  40.79 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000983919  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0970  RNA-binding protein  29.09 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15110  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  42.47 
 
 		 376 aa  55.8  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2013  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  44.44 
 
 		 712 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0339212  normal  0.44313 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5184  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.47 
 
 		 753 aa  55.5  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0783  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.54 
 
 		 701 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00491346  normal  0.157543 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3514  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.47 
 
 		 772 aa  54.7  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3260  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  36.47 
 
 		 707 aa  55.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4708  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.54 
 
 		 701 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0102803 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0725  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.54 
 
 		 701 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.959792  normal  0.0305384 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4176  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.19 
 
 		 701 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.310509  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0066  RNA binding S1 domain protein  38.67 
 
 		 129 aa  53.9  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4573  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.54 
 
 		 701 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.348013  normal  0.924419 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2704  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.81 
 
 		 722 aa  53.9  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0597018  normal  0.0425513 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4707  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.54 
 
 		 701 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.181629  normal  0.111929 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1944  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.85 
 
 		 720 aa  53.9  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0229407 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0653  RNA binding S1 domain protein  38.3 
 
 		 120 aa  54.7  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000131287  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3604  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.54 
 
 		 725 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0558589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2918  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.7 
 
 		 740 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.777239  normal  0.227939 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0268  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  33.68 
 
 		 714 aa  54.7  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00840028 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0541  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  37.97 
 
 		 711 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2080  cytidylate kinase/ribosomal protein S1  37.97 
 
 		 811 aa  53.9  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0981  RNA-binding S1 domain-containing protein  38.16 
 
 		 124 aa  53.5  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000445297  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34538  predicted protein  22.27 
 
 		 320 aa  53.5  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000454395  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1339  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.67 
 
 		 718 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0982499  normal  0.0498481 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1149  RNA-binding S1 domain-containing protein  36.67 
 
 		 124 aa  53.5  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000879414  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0395  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  40.58 
 
 		 690 aa  53.5  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4062  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.74 
 
 		 712 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0559  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  40.58 
 
 		 692 aa  53.5  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.745175 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2170  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.67 
 
 		 714 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0402548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3356  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.97 
 
 		 711 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2291  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.67 
 
 		 714 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0701506  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2774  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.52 
 
 		 716 aa  53.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3647  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.97 
 
 		 711 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0534  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.97 
 
 		 711 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000544711 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1112  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.52 
 
 		 716 aa  53.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.254666  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5581  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.67 
 
 		 715 aa  53.5  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.298486  normal  0.0925755 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1056  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.67 
 
 		 713 aa  53.1  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00845594  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1489  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.28 
 
 		 706 aa  53.1  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.622753  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1696  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  44.62 
 
 		 699 aa  53.5  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00000649299  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1420  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  36.59 
 
 		 703 aa  53.1  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0845346  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>