More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1567 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1567  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  100 
 
 
268 aa  547  1e-155  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1396  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  68.28 
 
 
265 aa  368  1e-101  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0200343  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0416  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  56.32 
 
 
257 aa  295  4e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.131172  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2051  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  50 
 
 
259 aa  262  4.999999999999999e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1128  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  49.06 
 
 
264 aa  261  1e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1152  translation initiation factor 2, alpha subunit  51.35 
 
 
254 aa  260  1e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1951  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  47.01 
 
 
263 aa  254  1.0000000000000001e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.612676 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1299  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  48.28 
 
 
257 aa  253  3e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0870  translation initiation factor 2, alpha subunit  47.51 
 
 
266 aa  249  4e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0957  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  46.82 
 
 
261 aa  247  1e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.652274  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2880  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  45.96 
 
 
277 aa  244  6.999999999999999e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.651055  normal  0.408906 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2790  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  46.48 
 
 
266 aa  239  2.9999999999999997e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.289487  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2502  translation initiation factor 2, alpha subunit  44.83 
 
 
266 aa  237  1e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1009  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  47.66 
 
 
266 aa  231  8.000000000000001e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1009  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  42.91 
 
 
265 aa  219  3e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1699  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  42.26 
 
 
265 aa  218  8.999999999999998e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.328913  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0964  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  42.15 
 
 
265 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.497618  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0982  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  41 
 
 
265 aa  208  6e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0703  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  41.31 
 
 
262 aa  199  6e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0077  RNA-binding S1 domain-containing protein  38.64 
 
 
265 aa  159  4e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.541121 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1359  translation initiation factor 2, alpha subunit  33.85 
 
 
277 aa  152  4e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.256809  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2023  translation initiation factor 2, alpha subunit  34.4 
 
 
266 aa  148  7e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576744  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0642  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  33.59 
 
 
265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000204722  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1802  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  36.14 
 
 
256 aa  142  4e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1783  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  32.05 
 
 
265 aa  115  6e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.030089 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0433  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  28.75 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1687  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  28.28 
 
 
264 aa  107  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.640158  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0995  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  27.9 
 
 
266 aa  106  4e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00230  eukaryotic translation initiation factor 2 alpha subunit, putative  25.67 
 
 
300 aa  96.3  4e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.433033  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03156  translation initiation factor eIF2 alpha subunit (Eurofung)  26.24 
 
 
308 aa  82  0.000000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34538  predicted protein  26.52 
 
 
320 aa  77.4  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000454395  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119592  Eukaryotic translation initiation factor 2, alpha subunit  23.59 
 
 
322 aa  72  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0150821  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3070  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.67 
 
 
707 aa  70.5  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.526485  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2169  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.86 
 
 
714 aa  67.8  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.184355  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2081  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.86 
 
 
714 aa  67.4  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0369235  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3572  RNA binding S1 domain protein  47.95 
 
 
557 aa  67.8  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2118  ribosomal protein S1  38.1 
 
 
596 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000596679  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0743  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40 
 
 
713 aa  66.6  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.10381  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1703  RNA binding S1 domain protein  43.06 
 
 
385 aa  65.9  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000241805  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3810  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.91 
 
 
774 aa  65.9  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0319705 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0268  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  38.78 
 
 
714 aa  65.9  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00840028 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0696  hypothetical protein  44.59 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000983919  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2860  general stress protein 13  40.7 
 
 
121 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1149  RNA-binding S1 domain-containing protein  36.97 
 
 
124 aa  65.5  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000879414  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0227  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  44.3 
 
 
722 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.133448  normal  0.547858 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0981  RNA-binding S1 domain-containing protein  36.97 
 
 
124 aa  65.1  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000445297  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0235  30S ribosomal protein S1  38.2 
 
 
577 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.00000120876  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3847  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  44.74 
 
 
711 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.147568  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4062  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.43 
 
 
712 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0436  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  43.04 
 
 
722 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3632  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  44.3 
 
 
728 aa  64.7  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0176906  hitchhiker  0.00320297 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0028  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  44.3 
 
 
718 aa  64.7  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.171141 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1031  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.89 
 
 
702 aa  64.7  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0967354  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0653  RNA binding S1 domain protein  38.26 
 
 
120 aa  63.9  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000131287  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4382  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.43 
 
 
712 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.968521 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0092  RNA binding S1  35.09 
 
 
130 aa  63.5  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000304617  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2015  RNA-binding S1 domain-containing protein  35.44 
 
 
411 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0652883  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0674  RNA binding S1  39.22 
 
 
127 aa  63.2  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.175739 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0605  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.77 
 
 
718 aa  62.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0543  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.31 
 
 
771 aa  62.8  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.109089  normal  0.335288 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1027  RNA binding S1 domain protein  41.57 
 
 
504 aa  62.8  0.000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000173139  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2080  cytidylate kinase/ribosomal protein S1  41.1 
 
 
811 aa  62.4  0.000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0507  30S ribosomal protein S1  37.63 
 
 
574 aa  62.4  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.762722  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2797  hypothetical protein  32.77 
 
 
134 aa  62.4  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000939181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2483  hypothetical protein  32.77 
 
 
134 aa  62.4  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000579369  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0075  RNA binding S1 domain protein  40.82 
 
 
120 aa  62  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000591466  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1235  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  45.33 
 
 
721 aa  62  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.434132  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1107  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  45.33 
 
 
749 aa  62  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.583336  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1167  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  45.33 
 
 
721 aa  62  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.859366  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0896  30S ribosomal protein S1  43.21 
 
 
408 aa  62  0.000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000252731  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03031  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.98 
 
 
734 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0541  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  41.98 
 
 
711 aa  62  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3607  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.98 
 
 
711 aa  62  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4396  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.91 
 
 
745 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.735081 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4483  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.98 
 
 
711 aa  62  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1730  RNA-binding S1 domain-containing protein  36.49 
 
 
403 aa  62  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0218599  normal  0.469855 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0164  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  43.37 
 
 
704 aa  61.6  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3647  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.98 
 
 
711 aa  62  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2333  30S ribosomal protein S1  39.39 
 
 
570 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000922659  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42780  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.11 
 
 
702 aa  61.6  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.705764  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4027  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.91 
 
 
752 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.749576  normal  0.189287 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1292  ribosomal protein S1  39.24 
 
 
720 aa  61.6  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3356  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.98 
 
 
711 aa  62  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0122  RNA-binding S1 domain-containing protein  35.92 
 
 
126 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3935  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.77 
 
 
715 aa  62  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.138516  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02982  hypothetical protein  41.98 
 
 
734 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3192  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  39.77 
 
 
715 aa  62  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.002791  normal  0.0369352 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0534  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.98 
 
 
711 aa  62  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000544711 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00520  RNA binding S1 domain protein  40 
 
 
124 aa  61.2  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.85433e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3344  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.51 
 
 
722 aa  61.6  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1041  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.96 
 
 
698 aa  60.8  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000243364  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0502  RNA-binding S1 domain-containing protein  37.84 
 
 
415 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1437  RNA binding S1 domain protein  36.49 
 
 
400 aa  60.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.245145  normal  0.159598 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1329  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  40.51 
 
 
736 aa  60.8  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000119457  normal  0.0289615 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0142  RNA binding S1 domain protein  38.46 
 
 
128 aa  61.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000417569  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0725  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.11 
 
 
701 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.959792  normal  0.0305384 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3050  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.11 
 
 
710 aa  61.2  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.464324  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62710  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.11 
 
 
701 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.14789  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0812  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.96 
 
 
706 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2264  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1146  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  44 
 
 
722 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.119982  normal  0.231253 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>