53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0433 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0433  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  100 
 
 
264 aa  525  1e-148  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1687  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  95.45 
 
 
264 aa  508  1e-143  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.640158  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1783  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  85.98 
 
 
265 aa  472  1e-132  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.030089 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0995  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  83.33 
 
 
266 aa  437  9.999999999999999e-123  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1359  translation initiation factor 2, alpha subunit  41.57 
 
 
277 aa  191  8e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.256809  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2023  translation initiation factor 2, alpha subunit  36.33 
 
 
266 aa  158  1e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576744  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0642  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  34.6 
 
 
265 aa  156  3e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000204722  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1009  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  33.47 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1802  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  33.46 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0964  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  32.16 
 
 
265 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.497618  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1396  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  31.87 
 
 
265 aa  129  6e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0200343  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0703  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  32.6 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1152  translation initiation factor 2, alpha subunit  32.79 
 
 
254 aa  126  5e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0982  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  33.04 
 
 
265 aa  124  1e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0957  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  29.96 
 
 
261 aa  120  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.652274  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1699  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  30.2 
 
 
265 aa  120  3e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.328913  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2051  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  29.1 
 
 
259 aa  119  6e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1128  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  28.39 
 
 
264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0416  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  31.5 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.131172  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1567  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  28.75 
 
 
268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1951  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  28.22 
 
 
263 aa  105  9e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.612676 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0077  RNA-binding S1 domain-containing protein  27.89 
 
 
265 aa  98.6  9e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.541121 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2502  translation initiation factor 2, alpha subunit  29.46 
 
 
266 aa  98.2  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1299  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  27.27 
 
 
257 aa  95.1  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2880  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  24.81 
 
 
277 aa  93.2  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.651055  normal  0.408906 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0870  translation initiation factor 2, alpha subunit  27.92 
 
 
266 aa  92.8  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2790  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  28.82 
 
 
266 aa  92.8  6e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.289487  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1009  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  29.22 
 
 
266 aa  91.7  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00230  eukaryotic translation initiation factor 2 alpha subunit, putative  27.27 
 
 
300 aa  65.1  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.433033  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03156  translation initiation factor eIF2 alpha subunit (Eurofung)  25.57 
 
 
308 aa  60.1  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1027  30S ribosomal protein S1  34.78 
 
 
563 aa  49.3  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000294308  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2860  general stress protein 13  33.33 
 
 
121 aa  48.9  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34538  predicted protein  23.71 
 
 
320 aa  48.5  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000454395  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1308  30S ribosomal protein S1  34.67 
 
 
557 aa  47.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.302956  hitchhiker  0.0000000365743 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0500  30S ribosomal protein S1  34.67 
 
 
557 aa  47.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.170768  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119592  Eukaryotic translation initiation factor 2, alpha subunit  24.27 
 
 
322 aa  47.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0150821  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3070  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  30.86 
 
 
707 aa  47.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.526485  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1854  30S ribosomal protein S1  33.7 
 
 
560 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.229903  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15870  30S ribosomal protein S1  32.93 
 
 
559 aa  44.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1967  30S ribosomal protein S1  31.71 
 
 
559 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23330  30S ribosomal protein S1  31.71 
 
 
559 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000169607  hitchhiker  0.00388994 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0972  30S ribosomal protein S1  34.15 
 
 
556 aa  43.5  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.577662  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1750  ribosomal protein S1  31.52 
 
 
563 aa  43.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00710774  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3642  30S ribosomal protein S1  31.52 
 
 
563 aa  43.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0546866  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0902  30S ribosomal protein S1  34.15 
 
 
556 aa  43.5  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0920  30S ribosomal protein S1  34.15 
 
 
556 aa  43.1  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0964  30S ribosomal protein S1  32 
 
 
562 aa  42.4  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5039  general stress protein 13  29.41 
 
 
114 aa  42  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5044  general stress protein 13  29.41 
 
 
114 aa  42  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3511  general stress protein 13  30.59 
 
 
133 aa  42  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0247  ribosomal protein S1  29.87 
 
 
562 aa  42  0.01  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5032  general stress protein 13  29.41 
 
 
114 aa  42  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0608546  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0202  general stress protein 13  29.41 
 
 
114 aa  42  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>