More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0703 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0703  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  100 
 
 
262 aa  523  1e-147  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0964  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  69.08 
 
 
265 aa  372  1e-102  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.497618  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0982  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  69.08 
 
 
265 aa  374  1e-102  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1699  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  67.56 
 
 
265 aa  368  1e-101  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.328913  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1009  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  66.79 
 
 
265 aa  363  1e-99  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1152  translation initiation factor 2, alpha subunit  44.4 
 
 
254 aa  221  8e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1128  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  41.92 
 
 
264 aa  207  1e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2051  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  41 
 
 
259 aa  203  2e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2790  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  41.7 
 
 
266 aa  204  2e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.289487  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2880  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  39.78 
 
 
277 aa  199  5e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.651055  normal  0.408906 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1567  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  41.31 
 
 
268 aa  199  5e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0957  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  40.47 
 
 
261 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.652274  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1396  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  42.41 
 
 
265 aa  192  3e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0200343  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2502  translation initiation factor 2, alpha subunit  39 
 
 
266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0416  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  41.31 
 
 
257 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.131172  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0870  translation initiation factor 2, alpha subunit  37.84 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1951  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  35.8 
 
 
263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.612676 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1299  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  38.46 
 
 
257 aa  182  6e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0642  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  37.31 
 
 
265 aa  176  3e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000204722  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1009  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  38.76 
 
 
266 aa  171  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2023  translation initiation factor 2, alpha subunit  37.84 
 
 
266 aa  166  5e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576744  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1802  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  37.28 
 
 
256 aa  155  8e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1359  translation initiation factor 2, alpha subunit  34.5 
 
 
277 aa  144  1e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.256809  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0077  RNA-binding S1 domain-containing protein  33.08 
 
 
265 aa  132  5e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.541121 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1783  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  34.43 
 
 
265 aa  129  6e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.030089 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0433  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  32.6 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0995  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  35.24 
 
 
266 aa  123  2e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1687  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  31.42 
 
 
264 aa  122  6e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.640158  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34538  predicted protein  25.81 
 
 
320 aa  91.7  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000454395  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00230  eukaryotic translation initiation factor 2 alpha subunit, putative  25.1 
 
 
300 aa  88.6  9e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.433033  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03156  translation initiation factor eIF2 alpha subunit (Eurofung)  25.28 
 
 
308 aa  77.4  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119592  Eukaryotic translation initiation factor 2, alpha subunit  21.9 
 
 
322 aa  71.2  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0150821  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1292  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.56 
 
 
721 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2860  general stress protein 13  35.65 
 
 
121 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13631  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.11 
 
 
721 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2015  RNA-binding S1 domain-containing protein  39.74 
 
 
411 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0652883  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13841  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.11 
 
 
721 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13921  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.11 
 
 
721 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1112  RNA binding S1 domain protein  38.16 
 
 
397 aa  60.1  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000019918  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3006  general stress protein 13  43.06 
 
 
124 aa  59.3  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0230  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.65 
 
 
693 aa  58.9  0.00000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.336814  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2522  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.63 
 
 
755 aa  58.5  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0265  RNA binding S1 domain-containing protein  40.43 
 
 
125 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.383538  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3588  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.38 
 
 
746 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4770  general stress protein 13  36.14 
 
 
114 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4610  general stress protein 13  36.14 
 
 
114 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4632  general stress protein 13  36.14 
 
 
114 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4722  general stress protein 13  36.14 
 
 
114 aa  57.4  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0202  general stress protein 13  36.14 
 
 
114 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5132  general stress protein 13  36.14 
 
 
114 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3070  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.37 
 
 
707 aa  57.4  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.526485  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3511  general stress protein 13  37.35 
 
 
133 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5011  general stress protein 13  36.14 
 
 
114 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5032  general stress protein 13  36.14 
 
 
114 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0608546  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1730  RNA-binding S1 domain-containing protein  39.47 
 
 
403 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0218599  normal  0.469855 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1098  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.53 
 
 
696 aa  57  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2080  cytidylate kinase/ribosomal protein S1  40 
 
 
811 aa  57  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1618  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.68 
 
 
532 aa  57  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5039  general stress protein 13  36.14 
 
 
114 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0949  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40 
 
 
747 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2976  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.51 
 
 
696 aa  57  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.31401e-17 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1795  SSU ribosomal protein S1P  45.95 
 
 
539 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0917  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.53 
 
 
696 aa  57  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.327573  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5044  general stress protein 13  36.14 
 
 
114 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0546  RNA binding S1 domain protein  42.86 
 
 
410 aa  56.6  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3847  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  40.51 
 
 
711 aa  56.6  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.147568  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1301  RNA binding S1 domain protein  43.06 
 
 
140 aa  56.6  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000152887  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0970  RNA-binding protein  34.83 
 
 
143 aa  56.6  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1639  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  44.44 
 
 
700 aa  56.2  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3572  RNA binding S1 domain protein  44.44 
 
 
557 aa  56.2  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07900  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  41.46 
 
 
705 aa  56.2  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl341  fused polyribonucleotide nucleotidyltransferase/ribosomal protein S1 domain-containing protein  41.79 
 
 
78 aa  55.8  0.0000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0493011  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2860  ribosomal protein S1  37.5 
 
 
557 aa  55.8  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.105288 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0788  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  48.33 
 
 
732 aa  56.2  0.0000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000677019  normal  0.144869 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3880  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.1 
 
 
777 aa  55.8  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0677  hypothetical protein  28.8 
 
 
121 aa  56.2  0.0000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1308  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.89 
 
 
696 aa  56.2  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00697732  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0066  RNA binding S1 domain protein  36.56 
 
 
129 aa  55.8  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0605  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.98 
 
 
718 aa  55.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1031  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  36.49 
 
 
702 aa  55.5  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0967354  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1235  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  43.24 
 
 
721 aa  55.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.434132  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1146  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.5 
 
 
722 aa  55.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.119982  normal  0.231253 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1167  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  43.24 
 
 
721 aa  55.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.859366  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4027  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.51 
 
 
752 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.749576  normal  0.189287 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_843  polyribonucleotide nucleotidyltransferase (polynucleotide phosphorylase)  39 
 
 
720 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.946894  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0934  RNA-binding S1 domain-containing protein  36.99 
 
 
388 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000731277  normal  0.167396 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1107  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  43.24 
 
 
749 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.583336  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2013  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.97 
 
 
712 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0339212  normal  0.44313 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4396  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.51 
 
 
745 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.735081 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1422  RNA-binding S1 domain-containing protein  37.78 
 
 
503 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.324209  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1789  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  33.64 
 
 
733 aa  54.7  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0142  RNA binding S1 domain protein  43.84 
 
 
128 aa  54.7  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000417569  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0380  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  43.86 
 
 
703 aa  54.7  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00000345435  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3324  guanosine pentaphosphate synthetase I/polyribonucleotide nucleotidyltransferase  40.85 
 
 
775 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.109983  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2662  RNA binding S1  39.76 
 
 
140 aa  55.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000144376  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1193  RNA binding S1 domain protein  37.93 
 
 
500 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000667111  hitchhiker  0.00401101 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3968  RNA-binding S1 domain-containing protein  37.78 
 
 
514 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507698  normal  0.122374 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1593  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.54 
 
 
697 aa  53.9  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.029457  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0324  hypothetical protein  31.71 
 
 
124 aa  53.9  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0923  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.89 
 
 
725 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>