More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0870 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_0870  translation initiation factor 2, alpha subunit  100 
 
 		 266 aa  534  1e-151  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2502  translation initiation factor 2, alpha subunit  86.09 
 
 		 266 aa  473  1e-132  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2790  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  75.19 
 
 		 266 aa  418  1e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.289487  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2880  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  70.4 
 
 		 277 aa  392  1e-108  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.651055  normal  0.408906 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1009  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  72.93 
 
 		 266 aa  370  1e-102  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0416  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  49.62 
 
 		 257 aa  263  2e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.131172  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1567  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  47.51 
 
 		 268 aa  249  4e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1396  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  46.79 
 
 		 265 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0200343  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1152  translation initiation factor 2, alpha subunit  47.1 
 
 		 254 aa  237  1e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2051  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  45.74 
 
 		 259 aa  228  1e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1299  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  45.35 
 
 		 257 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1128  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  43.41 
 
 		 264 aa  218  6e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0957  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  43.02 
 
 		 261 aa  216  4e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.652274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1951  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  43.02 
 
 		 263 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.612676 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1009  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  40.38 
 
 		 265 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0964  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  39.23 
 
 		 265 aa  194  2e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.497618  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1699  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  38.85 
 
 		 265 aa  191  9e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.328913  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0982  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  38.85 
 
 		 265 aa  187  1e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0703  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  37.84 
 
 		 262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0642  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  30.47 
 
 		 265 aa  139  3e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000204722  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1802  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  30.04 
 
 		 256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1359  translation initiation factor 2, alpha subunit  31.32 
 
 		 277 aa  122  7e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.256809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0077  RNA-binding S1 domain-containing protein  26.17 
 
 		 265 aa  113  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.541121 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2023  translation initiation factor 2, alpha subunit  27.57 
 
 		 266 aa  110  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576744  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0433  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  27.92 
 
 		 264 aa  92.8  5e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1783  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  26.89 
 
 		 265 aa  92  9e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.030089 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1687  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  26.97 
 
 		 264 aa  87  3e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.640158  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0995  translation initiation factor IF-2 subunit alpha  26.09 
 
 		 266 aa  85.1  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00230  eukaryotic translation initiation factor 2 alpha subunit, putative  26.05 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.433033  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0674  RNA binding S1  44.87 
 
 		 127 aa  71.6  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.175739 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3511  general stress protein 13  41.77 
 
 		 133 aa  67  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2860  general stress protein 13  39.74 
 
 		 121 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5039  general stress protein 13  42.31 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4770  general stress protein 13  42.31 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4610  general stress protein 13  42.31 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4632  general stress protein 13  42.31 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5132  general stress protein 13  42.31 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5032  general stress protein 13  42.31 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0608546  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5044  general stress protein 13  42.31 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5011  general stress protein 13  42.31 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0202  general stress protein 13  42.31 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4722  general stress protein 13  42.31 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2245  RNA-binding S1 domain-containing protein  40.54 
 
 		 798 aa  66.2  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.659597  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0354  RNA binding S1 domain protein  41.33 
 
 		 718 aa  65.9  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03156  translation initiation factor eIF2 alpha subunit (Eurofung)  25 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0395  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  46.38 
 
 		 690 aa  64.3  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0559  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  46.38 
 
 		 692 aa  64.3  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.745175 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3006  general stress protein 13  34.51 
 
 		 124 aa  63.9  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1955  RNA binding S1  39.47 
 
 		 718 aa  63.5  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3572  RNA binding S1 domain protein  47.22 
 
 		 557 aa  63.2  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0745  30S ribosomal protein S1  41.56 
 
 		 491 aa  62.8  0.000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.146171  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1422  RNA-binding S1 domain-containing protein  40 
 
 		 503 aa  62.8  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.324209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3080  RNA binding S1 domain protein  45.83 
 
 		 144 aa  62  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000220475  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0895  RNA-binding S1 domain-containing protein  38.36 
 
 		 861 aa  62.4  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2844  Tex-like protein protein-like protein  38.36 
 
 		 815 aa  62  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.142606  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0066  RNA binding S1 domain protein  41.33 
 
 		 129 aa  62  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0990  RNA binding S1 domain protein  38.36 
 
 		 830 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00382286 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2744  RNA binding S1  36.99 
 
 		 772 aa  60.8  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3968  RNA-binding S1 domain-containing protein  38.89 
 
 		 514 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507698  normal  0.122374 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3095  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.84 
 
 		 501 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000127417  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0259  RNA binding S1  38.37 
 
 		 782 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3070  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.96 
 
 		 707 aa  61.2  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.526485  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2662  RNA binding S1  37.5 
 
 		 140 aa  60.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000144376  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1303  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.47 
 
 		 772 aa  60.5  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.035241  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1368  transcription-related protein  42.47 
 
 		 772 aa  60.5  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0747  RNA binding S1 domain protein  40.54 
 
 		 699 aa  60.5  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.338297  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1406  RNA-binding S1 domain-containing protein  36.99 
 
 		 780 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252881  decreased coverage  0.0000000874326 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0058  hypothetical protein  39.13 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000238948  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1098  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.67 
 
 		 696 aa  59.7  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1112  RNA binding S1 domain protein  39.47 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000019918  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0917  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.67 
 
 		 696 aa  59.7  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.327573  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0265  RNA binding S1 domain-containing protein  41.33 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.383538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1762  RNA binding S1 domain protein  36.14 
 
 		 785 aa  60.1  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432806  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0479  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.47 
 
 		 712 aa  59.7  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00985663  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1609  S1 RNA-binding domain-containing protein  36.99 
 
 		 781 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217486  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0089  RNA binding S1  37.8 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2811  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.79 
 
 		 702 aa  59.7  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01307  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.79 
 
 		 704 aa  59.3  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.624183  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0146  hypothetical protein  40.82 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2527  RNA binding S1 domain protein  36.99 
 
 		 782 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197314  hitchhiker  0.0000000921984 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1632  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  43.48 
 
 		 703 aa  59.3  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.141024  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0696  hypothetical protein  37.63 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000983919  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2039  RNA binding S1 domain protein  36.49 
 
 		 795 aa  59.3  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.883528  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1222  RNA-binding S1 domain-containing protein  33.71 
 
 		 784 aa  59.3  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.923017  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3722  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.19 
 
 		 701 aa  59.3  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3541  general secretion pathway protein J  35.14 
 
 		 772 aa  58.9  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.489396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1037  RNA binding S1  38.36 
 
 		 778 aa  58.9  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.255171  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0142  RNA binding S1 domain protein  44 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000417569  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1031  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.24 
 
 		 702 aa  58.5  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0967354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0207  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.79 
 
 		 700 aa  58.9  0.00000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0183  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.79 
 
 		 700 aa  58.9  0.00000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0235  30S ribosomal protein S1  35.23 
 
 		 577 aa  58.9  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.00000120876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2332  RNA binding S1 domain protein  36.99 
 
 		 838 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.430037  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0327  S1 RNA binding domain protein  36.99 
 
 		 773 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0543  hypothetical protein  39.8 
 
 		 133 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000100816  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1728  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  44 
 
 		 672 aa  58.2  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0455896  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0530  hypothetical protein  39.8 
 
 		 133 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000417558  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00795  S1 RNA binding domain protein  38.36 
 
 		 786 aa  58.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0660252  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1472  RNA-binding S1 domain-containing protein  36.99 
 
 		 782 aa  58.5  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.528687 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1944  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.79 
 
 		 720 aa  58.5  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0229407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>