256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5382 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007950  Bpro_5382  phage integrase  100 
 
 		 228 aa  464  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.31221  hitchhiker  0.00239771 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4451  phage integrase  75.22 
 
 		 229 aa  345  5e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5700  integrase family protein  46.67 
 
 		 226 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6742  integrase family protein  44.29 
 
 		 236 aa  169  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4358  phage integrase family protein  30.28 
 
 		 221 aa  120  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.436387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4571  integrase family protein  32.57 
 
 		 221 aa  118  9e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.624666  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0140  hypothetical protein  30.41 
 
 		 194 aa  97.4  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2946  phage integrase family protein  29.11 
 
 		 190 aa  92.4  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.329988 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2812  integrase family protein  32.11 
 
 		 188 aa  89  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0076  integrase family protein  30.23 
 
 		 189 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0081  integrase family protein  31.16 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0500  integrase family protein  32.11 
 
 		 188 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1839  phage integrase family protein  30.84 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.637517  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1689  phage integrase family protein  28.35 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0163  integrase family protein  29.76 
 
 		 189 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4322  phage integrase family protein  29.22 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.205034  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  27.23 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  26.98 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  26.34 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2063  phage integrase family protein  25.77 
 
 		 188 aa  61.2  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.668188  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  24.55 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  31.44 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2245  hypothetical protein  33.52 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.468605 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1075  integrase family protein  28.35 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0347  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.37 
 
 		 307 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  28.29 
 
 		 332 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1457  integrase family protein  27.14 
 
 		 326 aa  57.8  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  26.53 
 
 		 317 aa  57  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  23.66 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.75 
 
 		 298 aa  57  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4114  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.25 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1743  Phage integrase  24.61 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.87 
 
 		 313 aa  55.5  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0534  site-specific recombinase IntIA  26.13 
 
 		 327 aa  55.1  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1220  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.27 
 
 		 330 aa  54.7  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2933  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.23 
 
 		 313 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.83049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  25.48 
 
 		 294 aa  53.9  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  29.73 
 
 		 295 aa  53.9  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3960  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.89 
 
 		 311 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.011638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07060  site-specific recombinase XerD  28.42 
 
 		 315 aa  53.1  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.273434 
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  25.98 
 
 		 307 aa  52  0.000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0074  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.65 
 
 		 307 aa  52  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1478  integrase/recombinase XerD  27.43 
 
 		 298 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0755097  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  27.04 
 
 		 324 aa  51.6  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3189  integrase family protein  29.84 
 
 		 345 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000247196  hitchhiker  0.000000000920932 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1286  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.56 
 
 		 298 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0511461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5002  hypothtical protein  25.47 
 
 		 308 aa  51.6  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0748381  hitchhiker  0.0000000255834 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  25.98 
 
 		 307 aa  51.6  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0967  integrase family protein  28.21 
 
 		 373 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2473  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.2 
 
 		 306 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3087  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.2 
 
 		 306 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2276  tyrosine recombinase XerD  30.57 
 
 		 301 aa  50.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235275  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3661  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.89 
 
 		 311 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2124  phage integrase family protein  25.81 
 
 		 301 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.308322  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2996  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.7 
 
 		 306 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0374572 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1030  site-specific tyrosine recombinase XerC  28 
 
 		 307 aa  50.1  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3133  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.7 
 
 		 306 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3104  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.2 
 
 		 306 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.494742 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1617  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.51 
 
 		 330 aa  49.7  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000155402  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00203  tyrosine recombinase  26.8 
 
 		 306 aa  49.7  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2501  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.7 
 
 		 312 aa  49.7  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal  0.936606 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0474  phage integrase family protein  25.11 
 
 		 355 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5943  phage integrase family protein  25.11 
 
 		 355 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0582  phage integrase family protein  25.11 
 
 		 355 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6437  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.03 
 
 		 306 aa  49.3  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.798094 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0271  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.54 
 
 		 351 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28022  normal  0.462537 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  26.37 
 
 		 307 aa  49.3  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0083  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.38 
 
 		 322 aa  49.3  0.00005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  23.11 
 
 		 295 aa  48.9  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2064  phage integrase  28.37 
 
 		 297 aa  48.9  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1560  tyrosine recombinase XerD  30.61 
 
 		 331 aa  48.9  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.736869  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  25.77 
 
 		 335 aa  48.9  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.07 
 
 		 298 aa  48.9  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  27.46 
 
 		 310 aa  48.5  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0977  integron integrase  29.69 
 
 		 329 aa  48.9  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002113  tyrosine recombinase XerC  25.46 
 
 		 310 aa  48.5  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2565  hypothetical protein  32.24 
 
 		 317 aa  48.5  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.420603 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1624  phage/XerD family site-specific recombinase  24.37 
 
 		 341 aa  48.5  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.389199 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0128  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.56 
 
 		 303 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.742386  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0139  tyrosine recombinase XerD  28.04 
 
 		 312 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3082  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.15 
 
 		 306 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.633641  normal  0.120316 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0170  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.85 
 
 		 306 aa  47.8  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2509  integrase family protein  27.5 
 
 		 380 aa  47.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.593152  normal  0.73908 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0890  tyrosine recombinase XerD  26.64 
 
 		 300 aa  47.8  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.267893  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0663  tyrosine recombinase XerD  28.04 
 
 		 305 aa  47.8  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3643  tyrosine recombinase XerD  26.17 
 
 		 309 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1995  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.18 
 
 		 302 aa  47  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0651  tyrosine recombinase XerD  27.09 
 
 		 297 aa  47  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0950079  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3012  tyrosine recombinase XerD subunit  26.83 
 
 		 295 aa  47.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146868  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3524  tyrosine recombinase XerD  26.17 
 
 		 309 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0843  tyrosine recombinase XerD  26.17 
 
 		 309 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3587  integrase family protein  28 
 
 		 304 aa  46.6  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  decreased coverage  0.00000000515843  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1196  phage integrase  26.6 
 
 		 291 aa  46.6  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0350  phage integrase family protein  25.98 
 
 		 341 aa  47  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000105216  hitchhiker  0.0000498769 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3447  integrase family protein  27.75 
 
 		 324 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3866  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  27.03 
 
 		 300 aa  46.6  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3550  integrase family protein  26.02 
 
 		 324 aa  46.2  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3449  tyrosine recombinase XerD  26.17 
 
 		 300 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0747  tyrosine recombinase XerD  27.56 
 
 		 303 aa  45.8  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000635712  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2381  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.44 
 
 		 311 aa  45.8  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>