More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6299 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6299  porin Gram-negative type  100 
 
 		 369 aa  748    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0285  outer membrane protein (porin)  60.56 
 
 		 367 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1016  outer membrane porin  55.68 
 
 		 358 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.308629  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0587  putative outer membrane porin  54.72 
 
 		 365 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2322  outer membrane porin protein  54.72 
 
 		 365 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1848  putative outer membrane porin  54.72 
 
 		 365 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0156948  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0881  putative outer membrane porin  54.72 
 
 		 365 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1102  outer membrane porin  55.4 
 
 		 358 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2703  porin Gram-negative type  52.16 
 
 		 372 aa  354  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  50.97 
 
 		 385 aa  342  5e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  43.77 
 
 		 375 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  43.07 
 
 		 381 aa  268  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  43.72 
 
 		 381 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  41.21 
 
 		 383 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  42.97 
 
 		 375 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  40.95 
 
 		 383 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  42.97 
 
 		 375 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  42.97 
 
 		 375 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  43.58 
 
 		 381 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  41.73 
 
 		 374 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  44.24 
 
 		 379 aa  261  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3151  outer membrane protein (porin)  43.33 
 
 		 370 aa  259  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  41.27 
 
 		 379 aa  258  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  41.56 
 
 		 389 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  40.91 
 
 		 379 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  42.97 
 
 		 392 aa  257  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  40.91 
 
 		 379 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  40.91 
 
 		 379 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  43.94 
 
 		 379 aa  256  4e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  40.91 
 
 		 379 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  40.97 
 
 		 385 aa  255  7e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  41.21 
 
 		 436 aa  255  7e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  43.08 
 
 		 396 aa  255  7e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  41.21 
 
 		 386 aa  255  9e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  41.21 
 
 		 386 aa  255  9e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  41.21 
 
 		 386 aa  255  9e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  41.21 
 
 		 386 aa  255  9e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  41.21 
 
 		 386 aa  255  9e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  40.66 
 
 		 379 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  40.71 
 
 		 385 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  42.78 
 
 		 381 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  41.21 
 
 		 436 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  42.94 
 
 		 375 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  40.95 
 
 		 386 aa  252  7e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  40.82 
 
 		 381 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  43.39 
 
 		 389 aa  249  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  42.9 
 
 		 380 aa  249  6e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  42.9 
 
 		 380 aa  248  9e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  40.71 
 
 		 383 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  43.62 
 
 		 414 aa  248  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  40.71 
 
 		 383 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  40.51 
 
 		 390 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  41.44 
 
 		 384 aa  247  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  43.73 
 
 		 384 aa  246  4e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  43.73 
 
 		 384 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  43.73 
 
 		 384 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  43.73 
 
 		 384 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  43.73 
 
 		 384 aa  246  4e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  43.73 
 
 		 384 aa  246  4e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  43.73 
 
 		 384 aa  246  4e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  40.46 
 
 		 383 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0103  outer membrane porin OpcP  42.43 
 
 		 411 aa  246  6e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  43.12 
 
 		 389 aa  245  8e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  40.25 
 
 		 391 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  40.2 
 
 		 383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  40.46 
 
 		 383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  40.7 
 
 		 383 aa  243  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  41.18 
 
 		 384 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0385  outer membrane protein (porin)  41.47 
 
 		 370 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  41.18 
 
 		 384 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  41.82 
 
 		 383 aa  243  5e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  41.18 
 
 		 384 aa  242  6e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  41.18 
 
 		 384 aa  242  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  41.18 
 
 		 384 aa  242  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4625  porin  40.53 
 
 		 370 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0866781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  41.78 
 
 		 383 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  40.91 
 
 		 384 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  40.5 
 
 		 391 aa  240  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  39.15 
 
 		 380 aa  240  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5151  porin  40.26 
 
 		 370 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5009  porin  40.79 
 
 		 370 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  40.85 
 
 		 383 aa  239  8e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  41.13 
 
 		 376 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  39.78 
 
 		 380 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  40.16 
 
 		 387 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  40.05 
 
 		 378 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  39.21 
 
 		 380 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3103  porin  40.26 
 
 		 370 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5264  porin  40.26 
 
 		 370 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  39.68 
 
 		 380 aa  235  9e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  42.18 
 
 		 384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1012  OmpC family outer membrane porin  38.38 
 
 		 375 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000562807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0415  OmpC family outer membrane porin  39.39 
 
 		 386 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  41.08 
 
 		 384 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  41.35 
 
 		 384 aa  234  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  41.08 
 
 		 384 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0370  OmpC family outer membrane porin  38.62 
 
 		 389 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0393  OmpC family outer membrane porin  39.65 
 
 		 386 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  41.08 
 
 		 384 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  39.78 
 
 		 379 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>