More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4374 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6226  transcriptional regulator  79.25 
 
 		 509 aa  841    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3752  GntR family transcriptional regulator  62.55 
 
 		 513 aa  641    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.840218  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1990  GntR family transcriptional regulator  76.27 
 
 		 508 aa  794    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0695  GntR family transcriptional regulator  92.13 
 
 		 508 aa  976    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0519778  hitchhiker  0.00612564 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4514  transcriptional regulator  76.57 
 
 		 509 aa  788    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.260672 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4374  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 508 aa  1050    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2022  transcriptional regulator  57.11 
 
 		 509 aa  578  1.0000000000000001e-163  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.190123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0071  GntR family transcriptional regulator  50.1 
 
 		 496 aa  474  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3848  transcriptional regulator, GntR family  48.48 
 
 		 506 aa  458  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4287  GntR family transcriptional regulator  49.19 
 
 		 512 aa  452  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00564262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5672  transcriptional regulator  48.62 
 
 		 508 aa  440  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179378 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0109  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  48.7 
 
 		 513 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.290721  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0135  GntR family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 527 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.868038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4755  transcriptional regulator  47.97 
 
 		 501 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0046  transcriptional regulator  42.74 
 
 		 490 aa  390  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0170475 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0157  GntR family transcriptional regulator  44.47 
 
 		 486 aa  387  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3508  GntR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 489 aa  385  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0025  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.19 
 
 		 494 aa  379  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0156  GntR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 488 aa  350  3e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1648  GntR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 495 aa  350  4e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2044  HTH-type transcriptional regulator  38.96 
 
 		 488 aa  345  1e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.411969 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4858  GntR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 491 aa  339  9e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0612909 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1835  putative transcriptional regulator  39.41 
 
 		 491 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.752029  normal  0.359008 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4274  GntR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 499 aa  337  3.9999999999999995e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.334325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2850  GntR family transcriptional regulator  40.49 
 
 		 495 aa  334  3e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.107434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4017  GntR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 489 aa  323  5e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1493  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 497 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.40552 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.29 
 
 		 485 aa  237  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  36.08 
 
 		 485 aa  234  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 504 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  36.34 
 
 		 494 aa  220  5e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0891  transcriptional regulator  33.13 
 
 		 504 aa  219  1e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00132013  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  35.74 
 
 		 509 aa  217  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 494 aa  217  5e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 494 aa  217  5e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0801  regulatory protein GntR, HTH  33.33 
 
 		 508 aa  216  7e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0129569  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1740  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 494 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.844969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  35.11 
 
 		 494 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4324  transcriptional regulator  34.88 
 
 		 495 aa  213  9e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.203783 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0205  transcriptional regulator, GntR family  32.05 
 
 		 463 aa  213  9e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146418 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1805  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 504 aa  212  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  31.22 
 
 		 501 aa  211  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3840  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.94 
 
 		 499 aa  210  4e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0222  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.26 
 
 		 464 aa  211  4e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0348  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 495 aa  210  4e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3492  GntR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 473 aa  209  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.249903  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 501 aa  209  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 501 aa  209  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3060  putative transcriptional regulator, GntR family  32.79 
 
 		 464 aa  209  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0090  aminotransferase, MocR-like  29.77 
 
 		 463 aa  208  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.83 
 
 		 488 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4307  transcriptional regulator  32.31 
 
 		 488 aa  207  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.79 
 
 		 495 aa  204  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1952  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.86 
 
 		 465 aa  204  4e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00720437  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3711  transcriptional regulator  31.74 
 
 		 504 aa  203  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0129081 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4139  GntR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 503 aa  203  7e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5231  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.76 
 
 		 488 aa  202  9e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 569 aa  202  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4020  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  32.41 
 
 		 499 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.703474  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3267  transcriptional regulator  32.38 
 
 		 492 aa  200  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0565  GntR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 493 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.41207 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4441  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.68 
 
 		 490 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.944559 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.85 
 
 		 515 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6316  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 493 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03480  GntR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 473 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000129974 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2233  GntR family transcriptional regulator  34.37 
 
 		 488 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.420665  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4510  GntR family transcriptional regulator  31.26 
 
 		 493 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.670433 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0986  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.5 
 
 		 495 aa  197  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5126  GntR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 492 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.835239  normal  0.332894 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0760  GntR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 490 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4136  transcriptional regulator  33.47 
 
 		 515 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.53433  normal  0.112546 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4510  transcriptional regulator  31.24 
 
 		 489 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0192  GntR family regulatory protein  36.5 
 
 		 570 aa  196  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  30.18 
 
 		 497 aa  196  7e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  35.92 
 
 		 508 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3030  transcriptional regulator  32.78 
 
 		 537 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640152  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2363  GntR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 459 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 509 aa  196  9e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1682  transcriptional regulator  36.5 
 
 		 493 aa  196  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2075  transcriptional regulator, GntR family  30.69 
 
 		 471 aa  196  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  31.88 
 
 		 509 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3373  transcriptional regulator  28.87 
 
 		 484 aa  195  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.98747  normal  0.499869 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.66 
 
 		 497 aa  195  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.75 
 
 		 501 aa  196  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 513 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2304  regulatory protein GntR, HTH  31.39 
 
 		 475 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10010  putative transcriptional regulator  31.34 
 
 		 496 aa  196  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2866  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 492 aa  194  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.156549  normal  0.161976 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.5 
 
 		 503 aa  194  2e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0552603  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1600  GntR family regulatory protein  36.5 
 
 		 493 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  29.86 
 
 		 517 aa  195  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 509 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0415  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 520 aa  194  3e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1208  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 574 aa  194  4e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3230  transcriptional regulator, GntR family  30.75 
 
 		 471 aa  194  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.45 
 
 		 472 aa  194  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0423  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.43 
 
 		 494 aa  193  6e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4721  GntR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 492 aa  192  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967408  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3136  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.52 
 
 		 496 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1925  GntR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 488 aa  191  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>