204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2621 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  60.53 
 
 		 810 aa  770    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  100 
 
 		 877 aa  1657    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1487  YadA domain-containing protein  52.38 
 
 		 472 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.693194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1526  YadA domain-containing protein  43.07 
 
 		 735 aa  262  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373525 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  37.16 
 
 		 1117 aa  259  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02177  putative hemagglutinin-related protein  43.82 
 
 		 1309 aa  254  7e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.732104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  46.88 
 
 		 3635 aa  250  7e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  35.53 
 
 		 3355 aa  247  8e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  44.08 
 
 		 4384 aa  235  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  46.35 
 
 		 4726 aa  235  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1650  hemagglutination repeat-containing protein  34.04 
 
 		 880 aa  224  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4704  YadA domain-containing protein  35.33 
 
 		 1072 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.818119 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  34.72 
 
 		 831 aa  221  5e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  32.9 
 
 		 820 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  32.94 
 
 		 831 aa  218  4e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  32.94 
 
 		 831 aa  218  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  33.02 
 
 		 816 aa  218  4e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  32.9 
 
 		 816 aa  218  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  32.9 
 
 		 816 aa  218  5e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  32.9 
 
 		 816 aa  218  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  39.48 
 
 		 575 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  39.64 
 
 		 536 aa  212  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  33.81 
 
 		 3192 aa  210  9e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  35.47 
 
 		 597 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1761  YadA domain-containing protein  33.08 
 
 		 876 aa  201  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  35.15 
 
 		 597 aa  197  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  35.15 
 
 		 597 aa  197  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0544  YadA domain protein  35.8 
 
 		 2392 aa  195  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.14824 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  34.58 
 
 		 2832 aa  195  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3524  hemagglutination repeat-containing protein  32.25 
 
 		 878 aa  194  6e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  40.09 
 
 		 589 aa  194  8e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4338  YadA domain-containing protein  35.39 
 
 		 3126 aa  193  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  29.93 
 
 		 1447 aa  193  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  29.92 
 
 		 1447 aa  192  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  29.83 
 
 		 1472 aa  192  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  38.64 
 
 		 1440 aa  191  4e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3524  YadA domain-containing protein  47.1 
 
 		 330 aa  191  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  38.64 
 
 		 1190 aa  190  8e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  33.07 
 
 		 1342 aa  184  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  32.24 
 
 		 1446 aa  184  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6072  YadA domain-containing protein  34.19 
 
 		 1125 aa  183  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.613322 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6584  YadA domain-containing protein  36.12 
 
 		 898 aa  182  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  33.69 
 
 		 1197 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6760  YadA domain-containing protein  33.69 
 
 		 1197 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116787  normal  0.0242941 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6349  YadA domain-containing protein  34.18 
 
 		 1197 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6369  YadA domain-containing protein  42.47 
 
 		 1204 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.771283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  38.42 
 
 		 617 aa  178  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  40.5 
 
 		 1451 aa  179  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0377  YadA-like protein  46.5 
 
 		 423 aa  176  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.337345  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  39.15 
 
 		 827 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2396  YadA domain protein  39.45 
 
 		 655 aa  174  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6824  YadA domain-containing protein  41.91 
 
 		 1417 aa  173  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335586  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  41.16 
 
 		 2504 aa  173  2e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0868  hemagglutination repeat-containing protein  34.84 
 
 		 716 aa  171  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  31.41 
 
 		 1616 aa  168  4e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  31.41 
 
 		 1616 aa  168  4e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  40.43 
 
 		 1390 aa  168  5e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  31.75 
 
 		 1674 aa  167  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  34.99 
 
 		 2868 aa  167  8e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6865  YadA domain-containing protein  44.54 
 
 		 967 aa  167  8e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557127  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  31.81 
 
 		 1616 aa  165  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0871  YadA domain-containing protein  35.13 
 
 		 716 aa  166  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02671  adhesin-like protein A  34.62 
 
 		 1265 aa  165  4.0000000000000004e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  30.66 
 
 		 1588 aa  162  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  31.09 
 
 		 1549 aa  162  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  35.1 
 
 		 1613 aa  162  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  33.93 
 
 		 737 aa  161  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2395  Haemagluttinin domain protein  35.93 
 
 		 2141 aa  157  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819478  normal  0.219334 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  38.04 
 
 		 1068 aa  156  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  28.97 
 
 		 1516 aa  153  1e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  37.2 
 
 		 1186 aa  151  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  38.22 
 
 		 1012 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4028  putative adhesin  39.56 
 
 		 279 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  40.52 
 
 		 962 aa  147  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5846  YadA-like protein  39.44 
 
 		 492 aa  145  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2315  YadA domain protein  42.27 
 
 		 1713 aa  143  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.241675 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7374  YadA/haemagluttinin like protein  32.39 
 
 		 1854 aa  139  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00142444  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1483  YadA domain protein  29.82 
 
 		 1333 aa  139  2e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  34.31 
 
 		 4191 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0855  outer membrane protein XadA  35.23 
 
 		 815 aa  132  3e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.912116  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3245  Haemagluttinin domain protein  33.98 
 
 		 1814 aa  132  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.691037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  27.25 
 
 		 1230 aa  128  4.0000000000000003e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0774  YadA domain-containing protein  35.7 
 
 		 650 aa  128  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000258117  hitchhiker  0.0000000471777 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0768  YadA domain-containing protein  30.95 
 
 		 997 aa  127  9e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0441  outer membrane protein, haemagluttinin-like  31.27 
 
 		 2866 aa  127  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192445  normal  0.347106 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6312  surface protein  47.57 
 
 		 356 aa  127  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  38.69 
 
 		 3718 aa  125  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0142  hypothetical protein  39.94 
 
 		 548 aa  123  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0813  haemagluttinin motif-containing protein  34.46 
 
 		 715 aa  123  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.783026  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0649  hemagluttinin motif-containing protein  34.46 
 
 		 1535 aa  122  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0499566  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0528  Hep_Hag family protein  42.03 
 
 		 378 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2381  Hep_Hag family protein  34.46 
 
 		 1626 aa  122  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1776  surface-exposed protein  34.46 
 
 		 1766 aa  122  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.885924  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1168  surface-exposed protein  34.46 
 
 		 1705 aa  121  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  31.48 
 
 		 2396 aa  120  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1090  haemagluttinin motif-containing protein  34.27 
 
 		 1669 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2020  intracellular motility protein A  42.03 
 
 		 460 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2793  hemagluttinin-like protein  40.62 
 
 		 601 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0749  hemagglutinin domain-containing protein  43.64 
 
 		 373 aa  119  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2118  hemagglutinin domain-containing protein  44.24 
 
 		 378 aa  119  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0929674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>