More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1204 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  100 
 
 		 461 aa  914    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  45.34 
 
 		 470 aa  371  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  41.52 
 
 		 472 aa  360  4e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  37.41 
 
 		 455 aa  292  1e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  37.33 
 
 		 454 aa  288  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  36.88 
 
 		 455 aa  277  3e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  36.99 
 
 		 449 aa  276  6e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  36.59 
 
 		 455 aa  267  2.9999999999999995e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  36.36 
 
 		 455 aa  266  5e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  36.12 
 
 		 454 aa  261  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  35.32 
 
 		 455 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  34.31 
 
 		 442 aa  249  5e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  32.09 
 
 		 466 aa  241  1e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  31.45 
 
 		 477 aa  242  1e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  34.67 
 
 		 447 aa  232  1e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  33.86 
 
 		 447 aa  231  3e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  32.96 
 
 		 460 aa  223  6e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  34.43 
 
 		 449 aa  223  6e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  32.37 
 
 		 496 aa  220  3e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  31.74 
 
 		 456 aa  218  2e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  34.38 
 
 		 460 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  33.78 
 
 		 461 aa  217  2.9999999999999998e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  33.92 
 
 		 456 aa  217  4e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  31.18 
 
 		 466 aa  213  5.999999999999999e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  29.26 
 
 		 466 aa  209  6e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  30.91 
 
 		 496 aa  209  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  35.04 
 
 		 464 aa  206  8e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  33.86 
 
 		 447 aa  205  1e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  32.95 
 
 		 451 aa  204  3e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  32.42 
 
 		 456 aa  203  4e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  31.6 
 
 		 452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  29.41 
 
 		 448 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  30.2 
 
 		 454 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  29.69 
 
 		 462 aa  196  5.000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  28.95 
 
 		 493 aa  196  7e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  30.4 
 
 		 451 aa  196  9e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  33.18 
 
 		 451 aa  195  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  30.14 
 
 		 455 aa  192  8e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  30.5 
 
 		 448 aa  192  1e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  29.55 
 
 		 451 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  29.55 
 
 		 451 aa  189  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  29.55 
 
 		 451 aa  188  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  29.08 
 
 		 451 aa  189  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  29.31 
 
 		 451 aa  188  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  33.91 
 
 		 466 aa  188  2e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  29.31 
 
 		 451 aa  187  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  29.31 
 
 		 451 aa  187  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  29.31 
 
 		 451 aa  187  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  29.02 
 
 		 464 aa  186  5e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  28.82 
 
 		 452 aa  186  6e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  30.96 
 
 		 459 aa  186  7e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  29.08 
 
 		 451 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  31.26 
 
 		 455 aa  184  3e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  28.22 
 
 		 451 aa  184  3e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  29.84 
 
 		 448 aa  182  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  27.46 
 
 		 452 aa  182  2e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  27.46 
 
 		 439 aa  181  2e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4053  multidrug efflux pump VmrA  28.54 
 
 		 465 aa  181  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  29.86 
 
 		 447 aa  181  2e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2975  multidrug efflux pump VmrA  28.64 
 
 		 459 aa  180  4.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592966 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  29.98 
 
 		 440 aa  180  5.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  29.64 
 
 		 452 aa  178  2e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  29.58 
 
 		 458 aa  178  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  29.46 
 
 		 442 aa  177  5e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  28.47 
 
 		 448 aa  176  8e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  28.7 
 
 		 450 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0140  multidrug efflux pump VmrA  29.87 
 
 		 464 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3175  multi anti extrusion protein MatE  28.22 
 
 		 472 aa  173  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000666598  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  27.74 
 
 		 446 aa  172  7.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  28.32 
 
 		 448 aa  172  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1582  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.13 
 
 		 467 aa  169  8e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200155  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  29.55 
 
 		 467 aa  168  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  28.39 
 
 		 456 aa  168  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0835  Na+-driven multidrug efflux pump  27.5 
 
 		 452 aa  168  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552719  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  30.7 
 
 		 461 aa  166  8e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  29.36 
 
 		 451 aa  166  1.0000000000000001e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  29.34 
 
 		 448 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  29.11 
 
 		 450 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2404  MATE efflux family protein  30.34 
 
 		 440 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000448098  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  29.11 
 
 		 450 aa  162  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  28.5 
 
 		 451 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  29.01 
 
 		 450 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  28.5 
 
 		 451 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  29.12 
 
 		 449 aa  160  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  29.52 
 
 		 443 aa  160  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.74 
 
 		 451 aa  156  6e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0153  MATE efflux family protein  29.5 
 
 		 447 aa  156  7e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0350  MATE efflux family protein  29.05 
 
 		 455 aa  155  1e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0967  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28 
 
 		 434 aa  155  1e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000590306  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1593  MATE efflux family protein  28.76 
 
 		 460 aa  155  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2775  MATE efflux family protein  27.9 
 
 		 456 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  28.27 
 
 		 451 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3452  MATE efflux family protein  29.36 
 
 		 445 aa  150  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000316888  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2191  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.94 
 
 		 446 aa  150  4e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1259  multi anti extrusion protein MatE  28.84 
 
 		 449 aa  150  6e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  29.44 
 
 		 440 aa  149  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0514  multi antimicrobial extrusion protein MatE  29.79 
 
 		 437 aa  146  7.0000000000000006e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000852803  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  27.02 
 
 		 459 aa  145  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3092  MATE efflux family protein  26.61 
 
 		 472 aa  144  5e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.755141 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1120  MATE efflux family protein  29.31 
 
 		 444 aa  140  6e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>