More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_0002 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  100 
 
 		 381 aa  775    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0002  DNA polymerase III subunit beta  95.28 
 
 		 379 aa  737    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173994  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0002  DNA polymerase III subunit beta  94.75 
 
 		 379 aa  734    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  95.01 
 
 		 379 aa  738    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  95.54 
 
 		 379 aa  741    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  96.59 
 
 		 381 aa  754    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000341772  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  95.01 
 
 		 379 aa  738    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  94.49 
 
 		 381 aa  743    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0002  DNA polymerase III subunit beta  94.75 
 
 		 379 aa  734    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132884  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  96.59 
 
 		 381 aa  754    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  95.28 
 
 		 379 aa  736    Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0002  DNA polymerase III subunit beta  73.23 
 
 		 378 aa  571  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167002  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  70.87 
 
 		 378 aa  552  1e-156  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  54.19 
 
 		 377 aa  422  1e-117  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  53.02 
 
 		 377 aa  412  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  53.02 
 
 		 377 aa  412  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  46.74 
 
 		 380 aa  346  3e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0002  DNA polymerase sliding clamp subunit  44.65 
 
 		 376 aa  322  5e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000188302  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2456  DNA polymerase III subunit beta  40.58 
 
 		 376 aa  305  6e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0115889  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2430  DNA polymerase III subunit beta  40.84 
 
 		 376 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000841235  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0002  DNA polymerase III, beta subunit  41.78 
 
 		 378 aa  303  4.0000000000000003e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2604  DNA polymerase III subunit beta  40.05 
 
 		 376 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.756021  hitchhiker  0.0000491978 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2720  DNA polymerase III subunit beta  40.31 
 
 		 376 aa  301  9e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.001463  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2499  DNA polymerase III subunit beta  40.31 
 
 		 376 aa  300  2e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000103767  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2684  DNA polymerase III subunit beta  40.31 
 
 		 376 aa  300  2e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2699  DNA polymerase III subunit beta  40.31 
 
 		 376 aa  301  2e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000020623 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2460  DNA polymerase III subunit beta  40.31 
 
 		 376 aa  299  7e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000810658  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2706  DNA polymerase III subunit beta  39.79 
 
 		 376 aa  297  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2750  DNA polymerase III subunit beta  39.53 
 
 		 376 aa  295  1e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0002  DNA polymerase III, beta subunit  41.16 
 
 		 374 aa  290  2e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.017071  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0002  DNA polymerase III subunit beta  38.8 
 
 		 378 aa  264  2e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0002  DNA polymerase III, beta subunit  37.86 
 
 		 374 aa  263  4.999999999999999e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000374529  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  37.73 
 
 		 366 aa  258  2e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  37.73 
 
 		 366 aa  258  2e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  36.05 
 
 		 365 aa  256  6e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0002  DNA polymerase III subunit beta  37.4 
 
 		 378 aa  255  8e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0002  DNA polymerase III subunit beta  36.2 
 
 		 380 aa  255  8e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.376275  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.12 
 
 		 367 aa  247  3e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  35.26 
 
 		 370 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.55 
 
 		 370 aa  239  5e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000729086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.91 
 
 		 367 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.226085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0002  DNA polymerase III subunit beta  35.44 
 
 		 366 aa  223  3e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.039801  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  35.79 
 
 		 366 aa  222  7e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.04 
 
 		 370 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0003  DNA polymerase III, beta subunit  30.99 
 
 		 374 aa  204  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00459981  hitchhiker  0.00000116577 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0816  DNA polymerase III, beta subunit  32.02 
 
 		 366 aa  204  3e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.731986  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.29 
 
 		 372 aa  202  6e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000259068  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.2 
 
 		 389 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.105928  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00020  DNA polymerase III, beta subunit  30.97 
 
 		 367 aa  196  5.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  30.49 
 
 		 376 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1227  DNA polymerase III, beta subunit  31.11 
 
 		 378 aa  191  2e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000128167  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1009  DNA polymerase III, beta subunit  30.85 
 
 		 378 aa  191  2e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000512645  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0953  DNA polymerase III, beta subunit  28.97 
 
 		 374 aa  190  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2834  DNA polymerase III subunit beta  30.65 
 
 		 372 aa  189  5e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.17 
 
 		 373 aa  187  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00126039  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1036  DNA polymerase III, beta subunit  30.08 
 
 		 378 aa  187  3e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000328779  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  29.47 
 
 		 366 aa  186  5e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000553224  hitchhiker  0.000000389013 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0003  DNA polymerase III subunit beta  31.09 
 
 		 372 aa  186  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295963  hitchhiker  0.00000350231 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0001  DNA polymerase III, beta subunit  28.98 
 
 		 372 aa  186  7e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0872728  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3374  DNA polymerase III subunit beta  29.87 
 
 		 372 aa  186  8e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1343  DNA polymerase III subunit beta  30.83 
 
 		 372 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0012  DNA polymerase III subunit beta  30.83 
 
 		 372 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4329  DNA polymerase III subunit beta  30.83 
 
 		 372 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00020  DNA polymerase III, beta subunit  29.84 
 
 		 365 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1551  DNA polymerase III, beta subunit  31.85 
 
 		 367 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.422589  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2795  DNA polymerase III subunit beta  30.13 
 
 		 370 aa  182  9.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.924667  normal  0.594035 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.15 
 
 		 372 aa  181  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0618208  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4592  DNA polymerase III subunit beta  30.57 
 
 		 372 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0352599 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0001  DNA polymerase III subunit beta  29.87 
 
 		 390 aa  181  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.174171  normal  0.105878 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.24 
 
 		 372 aa  181  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.142435  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.15 
 
 		 372 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.42 
 
 		 372 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000138199  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0002  DNA polymerase III subunit beta  30 
 
 		 372 aa  178  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3543  DNA polymerase III subunit beta  30.57 
 
 		 372 aa  178  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.53 
 
 		 372 aa  177  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.474691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.23 
 
 		 373 aa  177  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0966551  normal  0.572668 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.27 
 
 		 372 aa  177  3e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000275643  normal  0.722211 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.19 
 
 		 376 aa  177  4e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.57 
 
 		 397 aa  176  6e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00789927  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.9 
 
 		 375 aa  176  6e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.9 
 
 		 375 aa  176  6e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1016  DNA polymerase III subunit beta  30.25 
 
 		 393 aa  175  9e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1045  DNA polymerase III subunit beta  30.25 
 
 		 393 aa  175  9e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000409555  unclonable  0.00000000281863 
 
 
-
 
NC_004310  BR0002  DNA polymerase III subunit beta  30.57 
 
 		 397 aa  175  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41342  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.64 
 
 		 375 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0003  DNA polymerase III, beta subunit  31.09 
 
 		 369 aa  175  9.999999999999999e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000352181 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4406  DNA polymerase III, beta subunit  27.91 
 
 		 377 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.150139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0351  DNA polymerase III subunit beta  29.02 
 
 		 412 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.12 
 
 		 373 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.394263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0749  DNA polymerase III, beta subunit  27.39 
 
 		 377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00160623  normal  0.0661529 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0019  DNA polymerase III, beta subunit  29.56 
 
 		 378 aa  173  5e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2239  DNA polymerase III subunit beta  30.33 
 
 		 373 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0102545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0004  DNA polymerase III subunit beta  30.39 
 
 		 385 aa  172  9e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.638398  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.53 
 
 		 372 aa  172  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.96 
 
 		 369 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2506  DNA polymerase III subunit beta  27.44 
 
 		 366 aa  171  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000126636  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0004  DNA polymerase III subunit beta  28.76 
 
 		 372 aa  170  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114385  unclonable  5.12755e-25 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.05 
 
 		 373 aa  170  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0861969  hitchhiker  0.000000929484 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00001  DNA polymerase III subunit beta  32.58 
 
 		 385 aa  169  7e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.280893  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1278  DNA polymerase III subunit beta  29.02 
 
 		 373 aa  169  8e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  unclonable  2.76035e-25  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>