53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0074 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0074  putative general secretion pathway protein J  100 
 
 
222 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0015  putative general secretion pathway protein J  98.65 
 
 
222 aa  430  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293753  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0055  general secretion pathway protein  98.65 
 
 
232 aa  430  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.163391  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3237  putative general secretion pathway protein J  94.59 
 
 
229 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.722967  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0056  putative general secretion pathway protein J  90.09 
 
 
231 aa  392  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0045  putative general secretion pathway protein J  90.09 
 
 
234 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0055  putative general secretion pathway protein J  89.19 
 
 
224 aa  388  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0954003  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2669  general secretory pathway protein J  78.87 
 
 
242 aa  338  4e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2778  general secretory pathway protein J  78.87 
 
 
242 aa  338  4e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1883  general secretory pathway protein J  78.87 
 
 
242 aa  338  4e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0015  general secretion pathway protein J  78.87 
 
 
242 aa  337  7e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0530373  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0015  general secretion pathway protein J  78.87 
 
 
242 aa  337  7e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0227  general secretory pathway protein J  78.87 
 
 
242 aa  337  7e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.291181  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0014  general secretory pathway protein J  79.05 
 
 
242 aa  332  2e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3511  general secretory pathway protein J  78.82 
 
 
203 aa  320  8e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3943  putative general secretory pathway protein J  65.73 
 
 
228 aa  293  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.173018 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3077  putative general secretory pathway protein J  63.18 
 
 
234 aa  279  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  7.85542e-07 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4494  putative general secretory pathway protein J  64.18 
 
 
201 aa  272  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305758  normal  0.13576 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1064  Type II secretory pathway component PulJ  35.15 
 
 
226 aa  105  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00786562  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3047  general secretory pathway J transmembrane protein  33.73 
 
 
240 aa  83.6  2e-15  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353213  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3109  general secretory pathway J transmembrane protein  36.69 
 
 
240 aa  82.8  4e-15  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388678  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3394  putative general secretory pathway J transmembrane protein  34.57 
 
 
247 aa  75.5  6e-13  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3387  Type II secretory pathway component PulJ  28.92 
 
 
230 aa  74.3  1e-12  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3131  general secretion pathway protein J  30.68 
 
 
215 aa  64.3  1e-09  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.702697  normal  0.037121 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3422  general secretion pathway protein J  32.09 
 
 
232 aa  62.8  4e-09  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33509e-05 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5692  hypothetical protein  31.76 
 
 
233 aa  60.1  3e-08  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.434625  normal  0.174572 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3196  hypothetical protein  33.85 
 
 
202 aa  60.1  3e-08  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114017  hitchhiker  0.00348326 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0537  methylation  28.97 
 
 
226 aa  58.5  7e-08  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55530  putative type II secretion system protein  32.79 
 
 
213 aa  58.5  8e-08  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0378882 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3224  general secretory pathway J transmembrane protein  22.93 
 
 
212 aa  55.1  8e-07  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0147  general secretion pathway protein J  30 
 
 
253 aa  54.3  1e-06  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1078  hypothetical protein  34.09 
 
 
227 aa  53.1  4e-06  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  35.51 
 
 
145 aa  50.4  2e-05  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3524  hypothetical protein  31.9 
 
 
282 aa  50.1  3e-05  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0132086  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4245  general secretion pathway protein J  32.61 
 
 
197 aa  50.1  3e-05  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0360831 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0651  hypothetical protein  40.68 
 
 
225 aa  49.7  4e-05  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4833  putative type II secretion system protein  29.94 
 
 
191 aa  48.5  9e-05  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1324  methylation  29.06 
 
 
235 aa  47.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0672  hypothetical protein  38.33 
 
 
227 aa  47  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.142154  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1528  general secretion pathway protein J  32.2 
 
 
291 aa  46.6  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.81636  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2920  general secretion pathway protein J  56.76 
 
 
239 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.34948  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2375  general secretion pathway protein J  48.84 
 
 
223 aa  46.6  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.69272  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2205  type II secretion system protein J  35.82 
 
 
204 aa  46.2  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0654355  normal  0.781056 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2680  type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  41.18 
 
 
146 aa  45.8  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0723  type-4 fimbrial pilin-like transmembrane protein  34.33 
 
 
161 aa  45.4  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2535  general secretory pathway protein J  46.15 
 
 
223 aa  45.4  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0358104  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3217  N-terminal methylation site  35.06 
 
 
159 aa  45.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.280155 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1895  general secretion pathway protein J  35 
 
 
206 aa  43.9  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5180  fimbrial protein pilin  34.07 
 
 
169 aa  43.5  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0088813  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00607  general secretion pathway protein J  39.53 
 
 
250 aa  42.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  42.03 
 
 
130 aa  42  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0127  general secretion pathway protein J  27.07 
 
 
251 aa  42  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  36.21 
 
 
141 aa  41.6  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  3.62369e-07 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>