More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4505 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  82.43 
 
 		 442 aa  708    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0543  hypothetical protein  82.43 
 
 		 442 aa  708    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1284  FAD-dependent oxidoreductase  82.43 
 
 		 442 aa  709    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  82.43 
 
 		 442 aa  708    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  82.43 
 
 		 442 aa  708    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2539  agaE protein  82.21 
 
 		 442 aa  706    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1161  FAD dependent oxidoreductase  91.89 
 
 		 444 aa  791    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1461  putative lipoprotein  81.74 
 
 		 436 aa  681    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  82.43 
 
 		 442 aa  708    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  94.82 
 
 		 444 aa  827    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  75.67 
 
 		 446 aa  649    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  94.37 
 
 		 444 aa  824    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4505  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 444 aa  892    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4047  FAD dependent oxidoreductase  98.2 
 
 		 455 aa  876    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.812767 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  94.37 
 
 		 444 aa  824    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  72.32 
 
 		 446 aa  627  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4903  FAD dependent oxidoreductase  72.77 
 
 		 446 aa  618  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0595104 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  34.65 
 
 		 442 aa  245  9.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0702  D-amino acid oxidase family protein  34.93 
 
 		 442 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.382621  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  37.79 
 
 		 447 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  37.85 
 
 		 447 aa  242  1e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3826  FAD dependent oxidoreductase  34.47 
 
 		 442 aa  242  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3695  FAD dependent oxidoreductase  34.62 
 
 		 445 aa  241  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.822265  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1578  FAD dependent oxidoreductase  38.6 
 
 		 447 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.497346  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5297  oxidoreductase  35.5 
 
 		 443 aa  236  7e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.893259  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  35.58 
 
 		 423 aa  236  9e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  37.71 
 
 		 428 aa  234  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  35.08 
 
 		 442 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  32.96 
 
 		 460 aa  232  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2825  FAD dependent oxidoreductase  38.34 
 
 		 443 aa  232  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.893963 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1838  FAD dependent oxidoreductase  34.16 
 
 		 430 aa  229  5e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.659002  normal  0.295676 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0459  FAD dependent oxidoreductase  34.49 
 
 		 430 aa  229  8e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3069  FAD dependent oxidoreductase  34.67 
 
 		 441 aa  228  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.211431  hitchhiker  0.00906466 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3166  FAD dependent oxidoreductase  34.41 
 
 		 430 aa  226  8e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.71572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3518  FAD dependent oxidoreductase  35.13 
 
 		 431 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00768036  normal  0.224647 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4605  FAD dependent oxidoreductase  33.72 
 
 		 444 aa  216  5e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  33.64 
 
 		 439 aa  215  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2277  FAD dependent oxidoreductase  34.12 
 
 		 433 aa  216  9.999999999999999e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.811789 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1592  FAD dependent oxidoreductase  34.91 
 
 		 430 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6361  FAD dependent oxidoreductase  33.48 
 
 		 441 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5298  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 441 aa  213  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.494862  normal  0.217732 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  31.57 
 
 		 441 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2645  FAD dependent oxidoreductase  32.41 
 
 		 443 aa  212  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.864133  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6338  FAD dependent oxidoreductase  33.03 
 
 		 446 aa  212  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3290  FAD dependent oxidoreductase  34.22 
 
 		 451 aa  208  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1548  FAD dependent oxidoreductase  34.69 
 
 		 441 aa  208  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.746039 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6064  FAD dependent oxidoreductase  33.03 
 
 		 441 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2637  FAD dependent oxidoreductase  33.71 
 
 		 441 aa  207  4e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.754665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5888  oxidoreductase  32.58 
 
 		 445 aa  206  5e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1649  FAD dependent oxidoreductase  33.56 
 
 		 441 aa  206  9e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.756737  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6437  FAD dependent oxidoreductase  33.03 
 
 		 441 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6672  FAD dependent oxidoreductase  33.03 
 
 		 441 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6270  FAD dependent oxidoreductase  33.03 
 
 		 441 aa  204  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119616 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3761  FAD dependent oxidoreductase  34.61 
 
 		 431 aa  201  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5907  FAD dependent oxidoreductase  33.26 
 
 		 441 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5300  FAD dependent oxidoreductase  34.27 
 
 		 441 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5589  FAD dependent oxidoreductase  33.49 
 
 		 441 aa  189  9e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.17966 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5001  FAD dependent oxidoreductase  33.11 
 
 		 441 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.58394  normal  0.404419 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2806  FAD dependent oxidoreductase  33.03 
 
 		 466 aa  187  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00827549  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1927  putative deaminase  32.72 
 
 		 441 aa  186  9e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.70122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2919  FAD dependent oxidoreductase  32.12 
 
 		 442 aa  178  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  31.72 
 
 		 395 aa  154  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0860  FAD dependent oxidoreductase  26.57 
 
 		 471 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 		 382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4833  FAD dependent oxidoreductase  27.98 
 
 		 385 aa  145  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.866256 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  28.03 
 
 		 390 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  28.12 
 
 		 390 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  29.48 
 
 		 396 aa  139  7.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  28.33 
 
 		 392 aa  139  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  29.81 
 
 		 383 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 		 378 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  26.79 
 
 		 386 aa  134  3e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  25.24 
 
 		 387 aa  133  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  29.69 
 
 		 378 aa  133  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  29.18 
 
 		 388 aa  133  7.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  28.19 
 
 		 394 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 386 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  28.02 
 
 		 388 aa  130  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  29.02 
 
 		 383 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  29.02 
 
 		 383 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 		 389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  27.71 
 
 		 393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  27.62 
 
 		 377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  27.75 
 
 		 385 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  25.36 
 
 		 374 aa  128  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  28.37 
 
 		 394 aa  126  7e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  28.67 
 
 		 389 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  27.01 
 
 		 382 aa  124  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3536  FAD dependent oxidoreductase  30.14 
 
 		 382 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  25.85 
 
 		 381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  25.6 
 
 		 383 aa  121  3e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  26 
 
 		 385 aa  121  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  29.12 
 
 		 380 aa  120  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  24.46 
 
 		 373 aa  120  6e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5371  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 		 382 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  28.17 
 
 		 378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4434  FAD dependent oxidoreductase  28.14 
 
 		 378 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862237  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  25.24 
 
 		 397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 984 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  27.86 
 
 		 389 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>