284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A0660 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_0648  polysaccharide export protein  50.81 
 
 
779 aa  648  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1959  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  99.2 
 
 
875 aa  1701  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.940843  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1986  polysaccharide biosynthesis protein, putative  90.19 
 
 
877 aa  1535  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0566  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  99.25 
 
 
800 aa  1545  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0660  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  100 
 
 
877 aa  1754  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2676  polysaccharide export protein  44.2 
 
 
849 aa  578  1e-163  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2732  polysaccharide export protein  40.08 
 
 
753 aa  485  1e-135  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445544  normal  0.725394 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  41.3 
 
 
803 aa  478  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  32.07 
 
 
948 aa  333  6e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  32.48 
 
 
869 aa  323  1e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  30.5 
 
 
952 aa  316  1e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  30.6 
 
 
936 aa  294  6e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  31.04 
 
 
833 aa  291  3e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3403  polysaccharide export protein  30.77 
 
 
977 aa  283  1e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00684592  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  32.23 
 
 
1055 aa  234  6e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0888  polysaccharide export protein  28.94 
 
 
940 aa  234  7e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.434689  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  33.19 
 
 
834 aa  226  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  33.05 
 
 
781 aa  223  1e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  32.26 
 
 
828 aa  219  3e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  31.83 
 
 
828 aa  218  4e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  33.13 
 
 
827 aa  211  5e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  30.96 
 
 
869 aa  209  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1382  polysaccharide export protein  31.84 
 
 
837 aa  204  5e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1375  polysaccharide export protein  32.99 
 
 
837 aa  204  6e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193694  decreased coverage  2.8911e-06 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1315  polysaccharide export protein  31.84 
 
 
837 aa  204  8e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0893778 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1714  polysaccharide export protein  30.13 
 
 
947 aa  202  2e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397648  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2903  polysaccharide export protein  32.6 
 
 
828 aa  201  7e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0690654  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  39.33 
 
 
576 aa  199  2e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  27.83 
 
 
919 aa  198  5e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  28.02 
 
 
912 aa  194  4e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  34.82 
 
 
931 aa  192  3e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  34.8 
 
 
920 aa  191  6e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  29.46 
 
 
919 aa  190  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  35.89 
 
 
915 aa  189  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  36.74 
 
 
910 aa  187  8e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1078  polysaccharide export protein  25.96 
 
 
830 aa  186  1e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  31.26 
 
 
922 aa  186  1e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  32.49 
 
 
897 aa  183  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  34.78 
 
 
921 aa  179  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1576  ClpX, ATPase regulatory subunit  28.63 
 
 
833 aa  177  1e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  3.3468e-07  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0473  polysaccharide export protein  27.35 
 
 
824 aa  176  2e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3949  polysaccharide export protein  26.06 
 
 
823 aa  174  6e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.256427 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  30.4 
 
 
869 aa  173  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1345  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  30.3 
 
 
568 aa  172  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000291611 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4605  polysaccharide export protein  26.47 
 
 
791 aa  170  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321524  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.13 
 
 
920 aa  166  2e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  25.51 
 
 
852 aa  163  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0353  polysaccharide export protein  27.7 
 
 
830 aa  162  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.949664  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4937  polysaccharide export protein  25 
 
 
800 aa  149  2e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00100729  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2769  polysaccharide export protein  28.7 
 
 
846 aa  144  8e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2568  Soluble ligand binding domain protein  30.84 
 
 
812 aa  135  2e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171347  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2584  polysaccharide export protein  26.62 
 
 
605 aa  124  9e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  unclonable  2.40824e-05 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1344  polysaccharide export protein  40.12 
 
 
425 aa  121  6e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00232143 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1307  polysaccharide export protein  27.35 
 
 
565 aa  113  1e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  25.66 
 
 
478 aa  107  7e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1826  polysaccharide export protein  28.44 
 
 
516 aa  106  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.698968  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5952  polysaccharide export protein  26.21 
 
 
557 aa  105  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001787  capsular polysaccharide export system periplasmic protein KpsD  25.05 
 
 
579 aa  99.8  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  31.13 
 
 
580 aa  96.7  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  5.41966e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0293  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  24.9 
 
 
552 aa  95.1  5e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.994472  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1779  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  28.9 
 
 
552 aa  94.4  8e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1618  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  29.17 
 
 
552 aa  94  1e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3241  polysaccharide export protein  30.16 
 
 
587 aa  93.2  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1690  polysaccharide export protein  25.65 
 
 
558 aa  92.4  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1438  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  28.84 
 
 
552 aa  92.4  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.473166  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3221  polysialic acid capsule transport protein KpsD  24.62 
 
 
558 aa  91.3  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.364488  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02766  hypothetical protein  24.57 
 
 
558 aa  90.9  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  3.32683e-06  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02816  KpsD protein  24.57 
 
 
558 aa  90.9  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  4.3482e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03058  capsular polysaccharide transport protein, putative  30.81 
 
 
609 aa  90.1  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  30.4 
 
 
347 aa  84  1e-14  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.78188e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0246  polysaccharide export protein  26.57 
 
 
537 aa  82  4e-14  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  8.56367e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  24.64 
 
 
373 aa  77  1e-12  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0621  KpsD protein  24.37 
 
 
606 aa  76.6  2e-12  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  24.28 
 
 
473 aa  76.3  3e-12  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  30.26 
 
 
431 aa  75.9  3e-12  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  26.2 
 
 
388 aa  74.3  8e-12  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  30.82 
 
 
205 aa  74.3  9e-12  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  30 
 
 
392 aa  74.3  9e-12  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  30.54 
 
 
387 aa  73.9  1e-11  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  28.12 
 
 
252 aa  73.9  1e-11  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  23.85 
 
 
379 aa  73.9  1e-11  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3726  polysaccharide export protein  30 
 
 
392 aa  73.9  1e-11  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.448229 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  30.54 
 
 
392 aa  73.9  1e-11  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  30.54 
 
 
387 aa  73.9  1e-11  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13851  hypothetical protein  23.94 
 
 
365 aa  73.2  2e-11  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  29.94 
 
 
392 aa  73.2  2e-11  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  23.79 
 
 
362 aa  72.8  2e-11  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4938  polysaccharide export protein  22.65 
 
 
603 aa  72.8  3e-11  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  25.12 
 
 
317 aa  71.6  5e-11  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  30.54 
 
 
397 aa  71.6  5e-11  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2365  polysaccharide export protein  24.81 
 
 
282 aa  70.9  1e-10  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  25 
 
 
378 aa  69.7  2e-10  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  5.97973e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0819  polysaccharide export protein  26.67 
 
 
379 aa  70.1  2e-10  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2482  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  29.94 
 
 
391 aa  69.7  3e-10  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153813  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2620  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  29.94 
 
 
391 aa  69.7  3e-10  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0546  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  29.94 
 
 
396 aa  69.3  3e-10  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0915  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  29.94 
 
 
396 aa  69.3  3e-10  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138032  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1013  hypothetical protein  27.49 
 
 
191 aa  68.2  7e-10  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.528873  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2030  polysaccharide export protein  26.44 
 
 
282 aa  67.8  7e-10  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.440027  normal  0.0564831 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  24.76 
 
 
378 aa  67.8  8e-10  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>