More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0094 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A0094  regulatory protein  100 
 
 		 211 aa  435  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0082  hypothetical protein  96.68 
 
 		 338 aa  430  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00626494  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0121  putative transcriptional regulator  66.99 
 
 		 334 aa  304  7e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0425295  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3221  transcriptional regulator, putative  66.03 
 
 		 339 aa  300  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0132  AraC-type DNA-binding domain-containing proteins  46.8 
 
 		 337 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.968788  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0122  AraC family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 330 aa  101  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1666  helix-turn-helix-domain-containing protein  34.38 
 
 		 360 aa  94.7  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6017  AraC family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 425 aa  94  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.938285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6580  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 364 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.111702  normal  0.0245572 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6097  AraC family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 389 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5733  AraC family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 389 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.874497  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0976  transcriptional regulator, AraC family  31.79 
 
 		 341 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6093  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 398 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0365291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5855  AraC family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 385 aa  89.7  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4184  helix-turn-helix domain-containing protein  31.38 
 
 		 341 aa  89.4  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26598  normal  0.842889 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7549  AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 389 aa  89.7  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2942  AraC family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 359 aa  87.4  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00260427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0134  AraC family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 330 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4237  AraC family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 331 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.339126  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2953  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 357 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0291809 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4528  helix-turn-helix domain-containing protein  29.65 
 
 		 345 aa  82  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3897  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 327 aa  82  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1889  AraC family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 360 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0152823  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6019  transcriptional regulator, Fis family  33.94 
 
 		 365 aa  81.3  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2002  hypothetical protein  27.78 
 
 		 335 aa  80.9  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5228  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  30.58 
 
 		 343 aa  80.9  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1690  AraC family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 341 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1997  hypothetical protein  27.78 
 
 		 335 aa  80.5  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5438  transcriptional regulator, AraC family  35.33 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5539  AraC family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 364 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0657  AraC family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 337 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3167  helix-turn-helix domain-containing protein  31.28 
 
 		 352 aa  78.2  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2544  transcriptional regulator, AraC family  29.44 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3011  AraC family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 339 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476287  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2376  transcriptional regulator, AraC family  28.83 
 
 		 359 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4690  transcriptional regulator OruR  30.34 
 
 		 339 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5670  transcriptional regulator, AraC family  33.71 
 
 		 335 aa  77  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.661826  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4117  AraC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.344929 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2972  AraC family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 364 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.183535 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2934  transcriptional regulator, AraC family  29.79 
 
 		 358 aa  77  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53520  transcriptional regulator OruR  29.21 
 
 		 339 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827107 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5548  AraC family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 366 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2784  AraC family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 398 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00366686  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3102  helix-turn-helix, AraC type  29.25 
 
 		 330 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110134 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5360  AraC family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 366 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.345948  normal  0.401219 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5783  AraC family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 366 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5630  AraC family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 332 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.389433  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2038  helix-turn-helix domain-containing protein  30.05 
 
 		 338 aa  76.3  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.980028  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5976  AraC family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 324 aa  75.9  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5388  AraC family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 330 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74038  normal  0.0344366 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5248  helix-turn-helix domain-containing protein  27.55 
 
 		 330 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23442  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2629  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 382 aa  75.1  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5339  AraC family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407019 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0519  helix-turn-helix domain-containing protein  31.71 
 
 		 345 aa  73.9  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326701  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2956  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 343 aa  74.3  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6811  AraC family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 366 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1759  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 338 aa  73.9  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.206949  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3431  AraC family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 341 aa  73.6  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.147255  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2760  AraC family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 332 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2543  AraC family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 336 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.354483  hitchhiker  0.0000426703 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2587  helix-turn-helix domain-containing protein  34.43 
 
 		 337 aa  73.2  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3110  helix-turn-helix domain-containing protein  31 
 
 		 330 aa  72.4  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6270  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 369 aa  72  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335751  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1559  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 369 aa  72  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565202  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4197  transcriptional regulator  30.81 
 
 		 333 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510712  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4529  AraC family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 345 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0469  helix-turn-helix domain-containing protein  31.12 
 
 		 353 aa  70.9  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1128  transcriptional regulator, AraC family  32.39 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0451  AraC family transcriptional regulator  31 
 
 		 327 aa  70.1  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6759  AraC family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 369 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.902706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2042  putative transcriptional regulator  31.38 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5805  AraC family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 372 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597808  normal  0.277234 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2075  helix-turn-helix domain-containing protein  28.04 
 
 		 348 aa  70.1  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000856929  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2365  AraC family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000370263  hitchhiker  0.0000237936 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29180  AraC family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 339 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173637 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24140  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 345 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.434132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49150  transcriptional regulator  30.81 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236586 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1260  Helix-turn-helix, AraC domain protein  30.17 
 
 		 339 aa  69.3  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0717392  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6223  transcriptional regulator, AraC family  30.86 
 
 		 339 aa  69.3  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1538  AraC family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 346 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38751 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5728  AraC family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 334 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3805  transcriptional regulator, AraC family  29.19 
 
 		 346 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256933  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3981  putative transcriptional regulator  29.19 
 
 		 339 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7688  transcriptional regulatory protein  31.09 
 
 		 338 aa  68.9  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.636938  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0616  AraC family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 344 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2307  Helix-turn-helix, AraC domain protein  29.01 
 
 		 345 aa  68.2  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394496  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5362  AraC family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 348 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal  0.226827 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2577  AraC family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 344 aa  68.2  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.25861  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0563  AraC family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 340 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0769  AraC family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 340 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.93872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1503  AraC family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 340 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.369518  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0588  AraC family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 340 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4573  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 342 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1607  AraC family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 370 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5546  AraC family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1113  AraC family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 339 aa  67.4  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5781  AraC family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 348 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.436402 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5972  AraC family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0382965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1280  AraC family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 340 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.388416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>