More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0276 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0276  transporter, putative  100 
 
 		 383 aa  774    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0290  putative transporter  99.48 
 
 		 383 aa  768    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0341  RND family efflux transporter MFP subunit  81 
 
 		 375 aa  598  1e-170  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.666034  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2795  RND family efflux transporter MFP subunit  47.55 
 
 		 388 aa  357  2.9999999999999997e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2034  RND family efflux transporter MFP subunit  40.81 
 
 		 403 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2557  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.3 
 
 		 403 aa  293  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2816  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.69 
 
 		 403 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0305  RND family efflux transporter MFP subunit  41.05 
 
 		 378 aa  261  1e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2224  multidrug efflux pump, membrane fusion protein  43.56 
 
 		 388 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2269  RND family efflux transporter MFP subunit  43.62 
 
 		 390 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0264196  normal  0.209917 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0900  RND family efflux transporter MFP subunit  43.23 
 
 		 388 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  30.75 
 
 		 374 aa  171  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01700  RND family efflux system membrane fusion protein  32.69 
 
 		 328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2786  RND family efflux transporter MFP subunit  32.28 
 
 		 372 aa  154  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000125206  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  33.23 
 
 		 370 aa  155  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1150  RND family efflux transporter MFP subunit  33.23 
 
 		 373 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000335121  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3169  RND family efflux transporter MFP subunit  31.65 
 
 		 369 aa  153  5e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000222351  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  32.59 
 
 		 370 aa  152  7e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3313  RND family efflux transporter MFP subunit  31.33 
 
 		 369 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000984298  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3170  RND family efflux transporter MFP subunit  31.33 
 
 		 369 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3483  HlyD family secretion protein  32.28 
 
 		 369 aa  150  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1201  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.01 
 
 		 369 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000118856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004022  membrane-fusion protein  30.23 
 
 		 369 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000160707  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1658  RND family efflux transporter MFP subunit  34.41 
 
 		 360 aa  144  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000232607  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1881  HlyD family-like protein  34.41 
 
 		 360 aa  144  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  30.77 
 
 		 366 aa  143  4e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01736  HlyD family secretion protein  30.09 
 
 		 349 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1982  RND family efflux transporter MFP subunit  29.79 
 
 		 360 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000542821  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0266  RND family efflux transporter MFP subunit  31.21 
 
 		 375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.987776 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0438  hypothetical protein  29.43 
 
 		 352 aa  140  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000466929  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2338  RND family efflux transporter MFP subunit  33.6 
 
 		 360 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00136978  hitchhiker  0.0000141161 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2410  RND family efflux transporter MFP subunit  33.6 
 
 		 360 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000315716  hitchhiker  0.00636413 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2095  secretion protein HlyD  30.95 
 
 		 354 aa  139  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01444  hypothetical protein  29.97 
 
 		 350 aa  138  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2665  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 360 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000267288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2588  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 360 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000707575  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0472  secretion protein HlyD  28.62 
 
 		 359 aa  135  8e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000402153  normal  0.138011 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1851  RND family efflux transporter MFP subunit  28.88 
 
 		 361 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000181813  hitchhiker  0.00565244 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2428  RND family efflux transporter MFP subunit  27.27 
 
 		 361 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00201655  decreased coverage  0.00000151053 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1796  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.94 
 
 		 360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000436323  hitchhiker  0.00000011193 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2550  RND family efflux transporter MFP subunit  32.94 
 
 		 360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000229958  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4327  HlyD family secretion protein  29.08 
 
 		 372 aa  134  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  32.79 
 
 		 361 aa  134  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000249801  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0372  RND family efflux transporter MFP subunit  28.66 
 
 		 372 aa  134  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2132  HlyD family secretion protein  31.49 
 
 		 360 aa  133  5e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.732379  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1906  HlyD family-like protein  26.54 
 
 		 361 aa  133  6e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000977353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0703  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.26 
 
 		 355 aa  133  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2179  RND family efflux transporter MFP subunit  29.72 
 
 		 361 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000248395  normal  0.140593 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1737  secretion protein HlyD  33.62 
 
 		 360 aa  132  9e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000190652  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3889  RND family efflux transporter MFP subunit  28.09 
 
 		 364 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1963  putative secretion protein, HlyD family  25.63 
 
 		 390 aa  129  7.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000072673  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1030  RND family efflux transporter MFP subunit  26.06 
 
 		 365 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000101532  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3268  HlyD family secretion protein  26.21 
 
 		 372 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1156  RND family efflux transporter MFP subunit  28.16 
 
 		 370 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000311518  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  30.15 
 
 		 381 aa  127  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.421019  normal  0.31825 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4297  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.51 
 
 		 397 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.430357  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0358  RND family efflux transporter MFP subunit  28.12 
 
 		 372 aa  125  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4149  RND family efflux transporter MFP subunit  25.52 
 
 		 372 aa  125  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.815582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0466  RND family efflux transporter MFP subunit  25.77 
 
 		 372 aa  124  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.808341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1554  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.24 
 
 		 363 aa  124  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0484603  hitchhiker  0.00000015248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.24 
 
 		 363 aa  124  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.68 
 
 		 388 aa  122  8e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3927  RND family efflux transporter MFP subunit  26.87 
 
 		 392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4492  secretion protein HlyD  29.23 
 
 		 382 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226833 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1177  RND family efflux transporter MFP subunit  27.74 
 
 		 417 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01922  RND efflux membrane fusion protein  28.43 
 
 		 318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1146  RND family efflux transporter MFP subunit  26.6 
 
 		 351 aa  121  3e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56880  putative membrane fusion protein  28.77 
 
 		 376 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0768  acriflavin resistance periplasmic protein  29.37 
 
 		 348 aa  121  3e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.69171  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1266  RND family efflux transporter MFP subunit  28.43 
 
 		 371 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000032302  hitchhiker  0.00027333 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1194  acriflavin resistance periplasmic protein  27.12 
 
 		 380 aa  120  6e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0870  acriflavin resistance periplasmic protein  25.14 
 
 		 351 aa  119  7e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0930  RND family efflux transporter MFP subunit  27.42 
 
 		 366 aa  119  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  27.01 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3495  RND family efflux transporter MFP subunit  24.65 
 
 		 365 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2322  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.53 
 
 		 371 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0437768 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0527  RND family efflux transporter MFP subunit  28.01 
 
 		 376 aa  116  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4943  RND efflux membrane fusion protein precursor  29.11 
 
 		 375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1866  RND family efflux transporter MFP subunit  26.99 
 
 		 385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000232808  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0090  putative multidrug transporter, HlyD family  25.88 
 
 		 368 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1036  RND family efflux transporter MFP subunit  28.38 
 
 		 354 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1365  RND family efflux transporter MFP subunit  27.39 
 
 		 370 aa  114  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000256097  hitchhiker  0.000707959 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0907  RND efflux membrane fusion protein-related protein  25.25 
 
 		 406 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1809  secretion protein HlyD  28.85 
 
 		 397 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1057  RND family efflux transporter MFP subunit  28.67 
 
 		 373 aa  113  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3081  RND family efflux transporter MFP subunit  30.38 
 
 		 371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.153012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0975  RND family efflux transporter MFP subunit  28.48 
 
 		 382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0109715 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0946  RND family efflux transporter MFP subunit  25.98 
 
 		 382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3204  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.74 
 
 		 368 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1650  secretion protein HlyD  27.54 
 
 		 397 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0779  RND family efflux transporter MFP subunit  28.78 
 
 		 415 aa  110  6e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.521132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3650  secretion protein HlyD  27.56 
 
 		 397 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2846  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  26.27 
 
 		 396 aa  109  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1969  RND family efflux transporter MFP subunit  30.03 
 
 		 418 aa  108  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.728278 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1681  RND family efflux transporter MFP subunit  27.56 
 
 		 434 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0776882  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1089  hypothetical protein  27.42 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4661  secretion protein HlyD  26 
 
 		 386 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1440  secretion protein HlyD  27.9 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3803  RND family efflux transporter MFP subunit  28.92 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3475  secretion protein HlyD-like protein  28.52 
 
 		 373 aa  108  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.555415 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>