56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_02782 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012892  B21_02782  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  384  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000034032  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02832  hypothetical type II secretion protein GspJ  99.47 
 
 
187 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000053878  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3421  general secretion pathway protein J  98.93 
 
 
199 aa  377  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3406  general secretion pathway protein GspJ  98.4 
 
 
199 aa  374  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3132  general secretion pathway protein J  97.35 
 
 
201 aa  376  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3241  general secretion pathway protein GspJ  97.35 
 
 
201 aa  372  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.575634 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2918  general secretion pathway protein J  34.03 
 
 
215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0103  general secretion pathway protein J  35.48 
 
 
211 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1476  general secretion pathway protein J  34.22 
 
 
237 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2300  general secretion pathway protein J  36.65 
 
 
221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001886  general secretion pathway protein J  34.92 
 
 
225 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00607  general secretion pathway protein J  34.22 
 
 
250 aa  105  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2854  general secretion pathway protein J  33.15 
 
 
216 aa  103  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.400784  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4585  general secretion pathway protein J  32.98 
 
 
219 aa  102  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1418  general secretion pathway protein J  32.61 
 
 
216 aa  101  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1305  general secretion pathway protein J  34.76 
 
 
246 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0237  general secretion pathway protein J  32.12 
 
 
232 aa  93.6  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03962  general secretion pathway protein J  31.79 
 
 
208 aa  92.4  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2035  general secretion pathway protein J  31.66 
 
 
237 aa  92  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0009  general secretion pathway protein J  33.53 
 
 
199 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.264866 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24060  general secretion pathway protein J  32.16 
 
 
237 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4352  general secretion pathway protein J  33.33 
 
 
250 aa  90.9  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0150  general secretion pathway protein J  32.45 
 
 
241 aa  90.1  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0127  general secretion pathway protein J  32.97 
 
 
251 aa  90.1  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3613  general secretion pathway protein J  31.89 
 
 
259 aa  87.8  9e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0111  general secretion pathway protein J  31.89 
 
 
236 aa  86.7  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0175  general secretion pathway protein J  32.43 
 
 
259 aa  85.9  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.729564  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4245  general secretion pathway protein J  29.03 
 
 
197 aa  84.7  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0360831 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0159  general secretion pathway protein J  30.81 
 
 
259 aa  84.3  9e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0159  general secretion pathway protein J  30.81 
 
 
259 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0155  general secretion pathway protein J  30.81 
 
 
257 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4200  general secretion pathway protein J  30.81 
 
 
263 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0172  general secretion pathway protein J  30.81 
 
 
255 aa  81.3  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3561  general secretion pathway protein J  30.27 
 
 
252 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0157  general secretion pathway protein J  30.27 
 
 
255 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0157  general secretion pathway protein J  30.27 
 
 
253 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0162  general secretion pathway protein J  30.27 
 
 
253 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.933728 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2920  general secretion pathway protein J  29.65 
 
 
239 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.34948  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4728  general secretion pathway protein J  29.57 
 
 
264 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0958  general secretion pathway protein J  25.13 
 
 
198 aa  71.6  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.83965  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1010  general secretion pathway protein J  24.32 
 
 
198 aa  69.7  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1410  general secretion pathway protein J  28.5 
 
 
199 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0118952  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1354  general secretion pathway protein J  29.65 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2388  general secretion pathway protein J  32.35 
 
 
212 aa  64.3  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000292779 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0256  general secretion pathway protein J  29.1 
 
 
204 aa  62.4  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.745018  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1385  general secretion pathway protein J  31.28 
 
 
198 aa  62  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.44929  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0387  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  28.77 
 
 
220 aa  57  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.618821 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2375  general secretion pathway protein J  31.76 
 
 
223 aa  57  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.69272  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3574  general secretion pathway protein J  25.89 
 
 
212 aa  54.7  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.629666 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0321  general secretion pathway protein J  26.44 
 
 
203 aa  51.6  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3264  general secretion pathway protein J  26.09 
 
 
131 aa  49.3  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000089395  hitchhiker  0.00000000000000309054 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1310  type II secretory pathway protein LspJ  20.81 
 
 
205 aa  49.3  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1313  type II secretory pathway protein LspJ  20.81 
 
 
205 aa  48.5  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0147  general secretion pathway protein J  30.46 
 
 
253 aa  47  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1895  general secretion pathway protein J  25.25 
 
 
206 aa  45.4  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0234  general secretion pathway protein J  25.52 
 
 
193 aa  41.6  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>