221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_40000 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_40000  OprD family outer membrane porin  100 
 
 		 452 aa  910    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0644019  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43830  OprD family outer membrane porin  75.62 
 
 		 444 aa  694    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40060  OprD family outer membrane porin  70.11 
 
 		 454 aa  641    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2999  outer membrane porin  61.36 
 
 		 449 aa  528  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.489331  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2754  porin, putative  61.36 
 
 		 479 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0046  porin, putative  41.76 
 
 		 447 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000582651 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0063  outer membrane porin  41.76 
 
 		 447 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166078 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3618  outer membrane porin  41.37 
 
 		 441 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.088636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0060  outer membrane porin  41.76 
 
 		 447 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203485 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0060  outer membrane porin  41.76 
 
 		 447 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360119  hitchhiker  0.00983666 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1171  outer membrane porin  41.98 
 
 		 446 aa  320  3e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00378662  normal  0.540471 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4807  outer membrane porin  41.78 
 
 		 441 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0369  outer membrane porin, OprD family  41.56 
 
 		 441 aa  317  3e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2214  outer membrane porin  40.99 
 
 		 440 aa  317  3e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0154417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2286  outer membrane porin  42.25 
 
 		 447 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197845  normal  0.381133 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3290  outer membrane porin, OprD family  41.28 
 
 		 441 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609631  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2103  outer membrane porin  41.76 
 
 		 447 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262229  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3630  porin, putative  41.07 
 
 		 447 aa  299  5e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.563573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4550  basic amino acid/basic peptide/imipenem outer membrane porin OprD  38.75 
 
 		 441 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51880  basic amino acid, basic peptide and imipenem outer membrane porin OprD precursor  37.96 
 
 		 443 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.286241  normal  0.0103947 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32270  putative porin  38.86 
 
 		 448 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1097  outer membrane porin  36.84 
 
 		 446 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000158939  normal  0.0454814 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2734  putative porin  39.68 
 
 		 455 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34191  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2054  outer membrane porin  39.17 
 
 		 445 aa  269  8e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1925  outer membrane porin  38.89 
 
 		 445 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0782897 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4419  outer membrane porin  37.64 
 
 		 448 aa  261  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  37.22 
 
 		 429 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0242  porin  39.68 
 
 		 444 aa  259  7e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02020  putative outer membrane porin  37.72 
 
 		 444 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.485691 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  37.27 
 
 		 429 aa  256  8e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644568 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  36.81 
 
 		 429 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4302  outer membrane porin  37.04 
 
 		 429 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1400  outer membrane porin  36.22 
 
 		 447 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4394  outer membrane porin  35.98 
 
 		 444 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0224  outer membrane porin  37.1 
 
 		 420 aa  250  4e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.79572 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4665  outer membrane porin  36.05 
 
 		 438 aa  249  5e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109112  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48920  outer membrane porin  38.31 
 
 		 422 aa  249  9e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4356  outer membrane porin  34.95 
 
 		 421 aa  246  6e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38130  OprD family outer membrane porin  37.59 
 
 		 426 aa  246  6.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.764823  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54520  porin  37.44 
 
 		 427 aa  245  9e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0211699  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4212  outer membrane porin  37.05 
 
 		 427 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0833  outer membrane porin  35.32 
 
 		 444 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.78414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4009  outer membrane porin  37.47 
 
 		 422 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1458  outer membrane porin  37 
 
 		 421 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1367  outer membrane porin  35.36 
 
 		 468 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29220  putative porin  36.5 
 
 		 435 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.655739 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3977  putative porin  37.19 
 
 		 435 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0799  outer membrane porin  35.1 
 
 		 444 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.230822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0822  outer membrane porin  34.88 
 
 		 444 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43059  normal  0.142629 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4765  porin  36.98 
 
 		 427 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1206  outer membrane porin  37.27 
 
 		 421 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17140  outer membrane porin  35.91 
 
 		 405 aa  238  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.209334  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1235  outer membrane porin  37.05 
 
 		 421 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188174  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2708  outer membrane porin  35.57 
 
 		 431 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3168  benzoate-specific porin  37.19 
 
 		 416 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143323  normal  0.69398 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5250  porin, putative  35.73 
 
 		 420 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0268  putative porin  36.98 
 
 		 452 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7753  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3076  putative porin  37.33 
 
 		 416 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0309641  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2547  outer membrane porin  36.97 
 
 		 416 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.789024  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3987  porin D  34.26 
 
 		 448 aa  234  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286909  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49300  OprD family outer membrane porin  36.88 
 
 		 428 aa  234  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.32887  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36090  putative porin  37.56 
 
 		 416 aa  234  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000105785 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2681  outer membrane porin  37.19 
 
 		 416 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5160  outer membrane porin  36.21 
 
 		 420 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.264325 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1260  outer membrane porin  34.1 
 
 		 425 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000749415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2074  outer membrane porin  34.77 
 
 		 420 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.695569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26920  OprD family outer membrane porin  35.4 
 
 		 424 aa  230  5e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291151  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1277  outer membrane porin  35.07 
 
 		 419 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2632  outer membrane porin  34.56 
 
 		 433 aa  228  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31180  OprE-like outer membrane porin  35.21 
 
 		 439 aa  228  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2343  outer membrane porin, OprD family  34.59 
 
 		 418 aa  227  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22450  OprD family outer membrane porin  35.54 
 
 		 422 aa  227  4e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3656  aromatic compound-specific porin, putative  34.09 
 
 		 420 aa  226  9e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.755961  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1190  outer membrane porin  35.37 
 
 		 412 aa  226  9e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569611  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2139  outer membrane porin  33.56 
 
 		 433 aa  226  9e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0667606  hitchhiker  0.0000330448 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0324  putative porin  35.44 
 
 		 416 aa  226  9e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2127  outer membrane porin  35.85 
 
 		 418 aa  225  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265599  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  33.11 
 
 		 421 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18150  outer membrane porin  35.54 
 
 		 411 aa  225  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4239  outer membrane porin  36.05 
 
 		 412 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  33.11 
 
 		 421 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1383  BenF-like porin  35.87 
 
 		 418 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.435313 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4340  outer membrane porin  35.65 
 
 		 418 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00498222  normal  0.156563 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02370  putative porin  36.36 
 
 		 452 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000471352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38140  outer membrane porin, OprD family  33.71 
 
 		 420 aa  223  6e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35855  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1206  outer membrane porin  35.37 
 
 		 412 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4430  outer membrane porin  35.65 
 
 		 418 aa  223  7e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138033 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2701  outer membrane porin  35.86 
 
 		 416 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584042  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08660  benzoate-specific outer membrane porin  34 
 
 		 423 aa  221  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5281  outer membrane porin  32.37 
 
 		 413 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.746207 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2563  outer membrane porin  33.78 
 
 		 427 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0910723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10440  putative porin  35.56 
 
 		 418 aa  220  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1173  porin, putative  35.15 
 
 		 412 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121205  normal  0.068345 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3764  outer membrane porin  32.74 
 
 		 433 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.522082  normal  0.130801 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1272  outer membrane porin OprE  34.62 
 
 		 417 aa  219  6e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01240  OprE-like outer membrane porin  33.83 
 
 		 440 aa  219  7.999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.464345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58410  putative porin  34.35 
 
 		 484 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3451  outer membrane porin  34.83 
 
 		 395 aa  218  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2024  outer membrane porin  34.24 
 
 		 417 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1999  outer membrane porin  32.66 
 
 		 429 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175202 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>