More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0816 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0816  DNA polymerase III, beta subunit  100 
 
 		 366 aa  744    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.731986  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0953  DNA polymerase III, beta subunit  43.7 
 
 		 374 aa  311  9e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  38.98 
 
 		 372 aa  262  8e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000259068  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0002  DNA polymerase III, beta subunit  35.66 
 
 		 372 aa  248  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  37.87 
 
 		 375 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0002  DNA polymerase III, beta subunit  37.6 
 
 		 375 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0347  DNA polymerase III subunit beta  36.36 
 
 		 366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.229839  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0002  DNA polymerase III, beta subunit  37.33 
 
 		 375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0002  DNA polymerase III, beta subunit  38.56 
 
 		 376 aa  243  6e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.6 
 
 		 372 aa  236  4e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0618208  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.58 
 
 		 373 aa  236  4e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00126039  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.33 
 
 		 372 aa  235  7e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.95 
 
 		 372 aa  231  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000138199  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.05 
 
 		 373 aa  229  6e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.394263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0003  DNA polymerase III, beta subunit  34.14 
 
 		 369 aa  225  1e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000352181 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.6 
 
 		 365 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0001  DNA polymerase III, beta subunit  33.16 
 
 		 372 aa  223  6e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0872728  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0002  DNA polymerase III subunit beta  37.27 
 
 		 372 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.57 
 
 		 376 aa  218  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.6 
 
 		 369 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2795  DNA polymerase III subunit beta  37.74 
 
 		 370 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.924667  normal  0.594035 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1226  DNA polymerase III, beta subunit  34.88 
 
 		 366 aa  211  2e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.123805  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4329  DNA polymerase III subunit beta  36.19 
 
 		 372 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.75 
 
 		 378 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167002  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0351  DNA polymerase III subunit beta  35.48 
 
 		 412 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.79 
 
 		 365 aa  207  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2239  DNA polymerase III subunit beta  35.66 
 
 		 373 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0102545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  33.24 
 
 		 370 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  32.28 
 
 		 381 aa  207  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000341772  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0002  DNA polymerase III subunit beta  34.95 
 
 		 372 aa  207  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0730917  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.06 
 
 		 367 aa  207  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  32.28 
 
 		 381 aa  207  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4592  DNA polymerase III subunit beta  36.19 
 
 		 372 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0352599 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0002  DNA polymerase III subunit beta  37.1 
 
 		 372 aa  206  4e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000275643  normal  0.722211 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0002  DNA polymerase III subunit beta  34.14 
 
 		 372 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  31.17 
 
 		 366 aa  206  5e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0002  DNA polymerase III subunit beta  34.41 
 
 		 372 aa  205  8e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00020  DNA polymerase III, beta subunit  34.33 
 
 		 367 aa  205  9e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0708  DNA polymerase III subunit beta  35.85 
 
 		 371 aa  204  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.147601  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0002  DNA polymerase III subunit beta  34.93 
 
 		 373 aa  204  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0861969  hitchhiker  0.000000929484 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.02 
 
 		 381 aa  204  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0004  DNA polymerase III subunit beta  34.14 
 
 		 372 aa  203  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114385  unclonable  5.12755e-25 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0002  DNA polymerase III subunit beta  35.48 
 
 		 372 aa  203  3e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.142435  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.77 
 
 		 366 aa  203  4e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000466477  normal  0.315264 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.48 
 
 		 378 aa  202  6e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  32.45 
 
 		 379 aa  202  8e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0003  DNA polymerase III subunit beta  34.93 
 
 		 373 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.174848  normal  0.920378 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0002  DNA polymerase III subunit beta  34.58 
 
 		 373 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0823829  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0002  DNA polymerase III subunit beta  34.41 
 
 		 372 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.120269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3543  DNA polymerase III subunit beta  34.68 
 
 		 372 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.45 
 
 		 379 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173994  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0003  DNA polymerase III subunit beta  35.2 
 
 		 373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  0.512948 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0002  DNA polymerase III subunit beta  35.22 
 
 		 367 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.186277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.19 
 
 		 379 aa  200  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0002  DNA polymerase III subunit beta  34.58 
 
 		 373 aa  200  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.19 
 
 		 379 aa  200  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  32.45 
 
 		 379 aa  200  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0002  DNA polymerase III subunit beta  33.06 
 
 		 372 aa  200  3.9999999999999996e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.474691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.23 
 
 		 381 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0002  DNA polymerase III subunit beta  34.14 
 
 		 372 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.205747 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1429  DNA polymerase III subunit beta  36.7 
 
 		 375 aa  198  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0002  DNA polymerase III, beta subunit  35.5 
 
 		 367 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000146926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0002  DNA polymerase III subunit beta  33.96 
 
 		 373 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.125376 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0002  DNA polymerase III subunit beta  34.32 
 
 		 373 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0966551  normal  0.572668 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.5 
 
 		 367 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000485336  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3374  DNA polymerase III subunit beta  33.06 
 
 		 372 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0002  DNA polymerase III subunit beta  31.93 
 
 		 379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341639  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0002  DNA polymerase III subunit beta  35.7 
 
 		 397 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00789927  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.07 
 
 		 368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0185617  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.93 
 
 		 379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132884  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0002  DNA polymerase III subunit beta  35.7 
 
 		 397 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41342  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0014  DNA-directed DNA polymerase  33.33 
 
 		 366 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000733559  hitchhiker  0.000643873 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1278  DNA polymerase III subunit beta  35.01 
 
 		 373 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  unclonable  2.76035e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4118  DNA polymerase III, beta subunit  34.25 
 
 		 368 aa  196  6e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.000107371  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0004  DNA polymerase III subunit beta  35.43 
 
 		 385 aa  196  7e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.638398  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.89 
 
 		 368 aa  196  7e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0430732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0002  DNA polymerase III subunit beta  34.69 
 
 		 365 aa  195  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000590568  unclonable  0.00000000000512174 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.15 
 
 		 371 aa  195  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000194465  normal  0.0534413 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.43 
 
 		 366 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000637071  unclonable  0.00000000000326658 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.43 
 
 		 366 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000848773  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2506  DNA polymerase III subunit beta  30.89 
 
 		 366 aa  194  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000126636  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.43 
 
 		 366 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103765  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.43 
 
 		 366 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000634429  hitchhiker  0.000143129 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.06 
 
 		 369 aa  194  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1343  DNA polymerase III subunit beta  32.98 
 
 		 372 aa  193  4e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0012  DNA polymerase III subunit beta  32.98 
 
 		 372 aa  193  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.53 
 
 		 366 aa  193  4e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000472427  hitchhiker  0.00139326 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.1 
 
 		 366 aa  193  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000136085  unclonable  0.00000000917615 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.52 
 
 		 372 aa  193  4e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0010  DNA polymerase III subunit beta  31 
 
 		 369 aa  193  5e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000914164  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0009  DNA polymerase III, beta subunit  32.35 
 
 		 366 aa  192  5e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00443  DNA polymerase III subunit beta  30.35 
 
 		 366 aa  192  5e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.35 
 
 		 366 aa  193  5e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000577304  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0010  DNA polymerase III, beta subunit  32.35 
 
 		 366 aa  193  5e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000642144  hitchhiker  0.00000000134313 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3705  DNA polymerase III subunit beta  33.06 
 
 		 372 aa  192  6e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0432616 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2834  DNA polymerase III subunit beta  33.42 
 
 		 372 aa  192  6e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1437  DNA polymerase III subunit beta  34.13 
 
 		 374 aa  192  7e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.08 
 
 		 366 aa  192  8e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000490932  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0007  DNA-directed DNA polymerase  32.1 
 
 		 366 aa  191  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000118658  unclonable  0.000000000121971 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0003  DNA polymerase III subunit beta  33.33 
 
 		 372 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295963  hitchhiker  0.00000350231 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>