132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2501 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  100 
 
 		 205 aa  393  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  98.08 
 
 		 191 aa  308  2.9999999999999997e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  50 
 
 		 175 aa  145  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  44.74 
 
 		 153 aa  119  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  45.38 
 
 		 216 aa  118  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  40.4 
 
 		 157 aa  105  5e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  45.38 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  42.75 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  40.77 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  35.22 
 
 		 175 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  33.88 
 
 		 206 aa  97.8  9e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  38.06 
 
 		 227 aa  96.3  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4558  nuclease (SNase domain protein)  38.67 
 
 		 179 aa  94.7  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  38.26 
 
 		 244 aa  94  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  36.03 
 
 		 232 aa  91.3  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  38.27 
 
 		 175 aa  89  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  36.6 
 
 		 185 aa  88.6  5e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  32.5 
 
 		 169 aa  88.6  6e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  35.25 
 
 		 171 aa  87.8  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  29.23 
 
 		 192 aa  86.7  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  31.37 
 
 		 174 aa  87  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  36.69 
 
 		 169 aa  87  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  34.18 
 
 		 171 aa  85.9  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  39.46 
 
 		 196 aa  85.5  6e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  34.07 
 
 		 184 aa  84.7  8e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  36.91 
 
 		 153 aa  84.7  8e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  35.71 
 
 		 162 aa  84.7  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  36.05 
 
 		 153 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  36.94 
 
 		 166 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  38.64 
 
 		 150 aa  84  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  30.6 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  31.97 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  30.6 
 
 		 175 aa  80.9  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  31.25 
 
 		 199 aa  80.5  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  29.85 
 
 		 175 aa  81.3  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  27.15 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  35.81 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  34.04 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  31.87 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  35 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  37.91 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41180  nuclease  35.29 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  33.09 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  31.25 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  32.85 
 
 		 171 aa  74.7  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  35.97 
 
 		 161 aa  74.3  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  31.76 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2219  nuclease (SNase domain protein)  31.11 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19010  nuclease  33.33 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461402  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  29.01 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  32 
 
 		 183 aa  70.5  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  34.97 
 
 		 169 aa  70.9  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  32.85 
 
 		 161 aa  70.9  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  38 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  26.49 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3244  nuclease (SNase domain protein)  32.58 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  38.13 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  29.45 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  30.32 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  31.06 
 
 		 171 aa  64.3  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  37.6 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  34.93 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08950  nuclease  36.09 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870151  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  35.16 
 
 		 158 aa  62  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1080  putative nuclease  37.41 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  30.77 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3964  nuclease  39.32 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9251  predicted protein  26.71 
 
 		 164 aa  60.8  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  30.07 
 
 		 158 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  29.01 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  27.59 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  28.89 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2800  nuclease  31.58 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144279 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2029  nuclease (SNase-like)  37.63 
 
 		 161 aa  57  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  32.61 
 
 		 171 aa  57.4  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  28.48 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  30.34 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  26.9 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  32.37 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  26.9 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51840  nuclease  25.68 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  30.87 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  36.23 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4688  nuclease (SNase-like)  28.21 
 
 		 241 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  28 
 
 		 266 aa  53.5  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  35.51 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  28.67 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  28.67 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0211  thermonuclease family protein  27.59 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  32.56 
 
 		 172 aa  52.4  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  35.82 
 
 		 136 aa  51.6  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  29.22 
 
 		 187 aa  51.2  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  29.24 
 
 		 168 aa  51.2  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2052  succinoglycan biosynthesis protein  30.11 
 
 		 171 aa  50.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132309  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  30.16 
 
 		 388 aa  50.4  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0454  nuclease (SNase domain protein)  31.62 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1599  nuclease  32.82 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798842  normal  0.295978 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  32.65 
 
 		 534 aa  49.3  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2100  nuclease (SNase-like)  34.46 
 
 		 192 aa  48.9  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  29.29 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>