More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0099 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0099  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  100 
 
 
220 aa  441  1e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4149  hypothetical protein  41.12 
 
 
218 aa  191  5e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.247441  hitchhiker  1.17092e-06 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0454  secretion protein HlyD  38.68 
 
 
217 aa  175  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2323  secretion protein HlyD  37.8 
 
 
231 aa  144  8e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000671168  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2016  secretion protein HlyD family protein  35.19 
 
 
517 aa  142  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2423  hypothetical protein  33.97 
 
 
215 aa  129  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2377  hypothetical protein  33.97 
 
 
215 aa  129  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1945  drug transporter, putative  35.68 
 
 
215 aa  127  9e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2429  Multidrug resistance efflux pump-like protein  33.98 
 
 
214 aa  115  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.310054  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2447  hypothetical protein  31.25 
 
 
212 aa  108  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3255  multidrug resistance protein A  30.85 
 
 
217 aa  101  8e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1834  multidrug resistance protein A  28.71 
 
 
212 aa  99  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00170419  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0560  hypothetical protein  29.26 
 
 
217 aa  98.6  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  2.64688e-06  hitchhiker  1.67598e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4677  hypothetical protein  29.79 
 
 
217 aa  98.6  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000225895  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4813  hypothetical protein  29.26 
 
 
217 aa  97.4  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0590873  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4300  multidrug resistance protein A  29.26 
 
 
217 aa  97.4  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.6909e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4465  hypothetical protein  29.26 
 
 
217 aa  97.4  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.147837  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4700  hypothetical protein  29.79 
 
 
217 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000255246  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4693  hypothetical protein  29.26 
 
 
217 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  8.53008e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4311  multidrug resistance protein A  29.26 
 
 
217 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.276592  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4684  hypothetical protein  29.26 
 
 
217 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.12554e-48 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3253  secretion protein HlyD family protein  40.8 
 
 
373 aa  97.1  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2910  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  29.61 
 
 
228 aa  95.5  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  2.63786e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0850  secretion protein HlyD family protein  41.46 
 
 
379 aa  94.7  9e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  1.38704e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1013  secretion protein HlyD  38.46 
 
 
394 aa  94.4  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3361  secretion protein HlyD family protein  40.8 
 
 
373 aa  94.4  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  44.17 
 
 
372 aa  93.6  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1150  multidrug resistance protein A  35.56 
 
 
331 aa  92.8  4e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0558  secretion protein HlyD family protein  33.94 
 
 
375 aa  92.8  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  38.93 
 
 
334 aa  92  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0866  multidrug resistance protein A  34.81 
 
 
331 aa  91.3  9e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2982  secretion protein HlyD family protein  39.39 
 
 
400 aa  90.5  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6122  secretion protein HlyD family protein  40.57 
 
 
347 aa  89.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0561  secretion protein HlyD family protein  42.86 
 
 
348 aa  89.4  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0094  secretion protein HlyD family protein  35.77 
 
 
328 aa  89.4  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3489  putative secretion protein  39.47 
 
 
393 aa  88.2  9e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0544122 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1100  secretion protein HlyD family protein  37.23 
 
 
443 aa  88.2  9e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175972 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1379  secretion protein HlyD family protein  34.4 
 
 
374 aa  87  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1512  secretion protein HlyD family protein  39.53 
 
 
405 aa  87.4  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1774  secretion protein HlyD family protein  35.07 
 
 
355 aa  86.3  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0618  secretion protein HlyD family protein  35.76 
 
 
392 aa  86.3  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0069  secretion protein HlyD family protein  36.19 
 
 
331 aa  85.5  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  41.75 
 
 
374 aa  85.1  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2921  secretion protein HlyD family protein  36.43 
 
 
344 aa  84.7  9e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2795  secretion protein HlyD family protein  38.94 
 
 
402 aa  84.3  1e-15  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.758551 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5067  secretion protein HlyD family protein  36.76 
 
 
367 aa  83.6  2e-15  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.592232 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4053  secretion protein HlyD family protein  35.43 
 
 
349 aa  83.6  2e-15  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.861449 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4400  hypothetical protein  30.16 
 
 
217 aa  84  2e-15  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0106934  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0064  secretion protein HlyD family protein  34.86 
 
 
346 aa  83.6  2e-15  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0097  secretion protein HlyD family protein  44.09 
 
 
354 aa  84  2e-15  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0660  secretion protein HlyD family protein  36.36 
 
 
402 aa  83.2  3e-15  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2068  multidrug efflux MFS membrane fusion protein, putative  35.4 
 
 
425 aa  82  7e-15  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.851411 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1157  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  35.94 
 
 
344 aa  81.3  1e-14  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1354  secretion protein HlyD family protein  38.84 
 
 
349 aa  80.9  1e-14  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  40.74 
 
 
371 aa  80.9  1e-14  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2257  secretion protein HlyD family protein  34.62 
 
 
368 aa  81.3  1e-14  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.250908 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1467  secretion protein HlyD  40.95 
 
 
342 aa  80.5  2e-14  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0027674  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  28.57 
 
 
368 aa  80.5  2e-14  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6361  secretion protein HlyD family protein  40.95 
 
 
355 aa  80.5  2e-14  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  36.45 
 
 
375 aa  80.9  2e-14  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  35 
 
 
368 aa  80.5  2e-14  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  32.71 
 
 
411 aa  80.5  2e-14  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  28.81 
 
 
393 aa  80.9  2e-14  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  35.25 
 
 
366 aa  80.5  2e-14  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  37.69 
 
 
373 aa  80.9  2e-14  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0487  secretion protein HlyD  38.39 
 
 
387 aa  80.9  2e-14  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0299578  normal  0.132982 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5404  secretion protein HlyD family protein  35.25 
 
 
324 aa  79.7  3e-14  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.629231 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3675  secretion protein HlyD family protein  34.51 
 
 
381 aa  79.7  3e-14  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0055  multidrug resistance protein A  38.68 
 
 
332 aa  80.1  3e-14  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1920  secretion protein HlyD  32.03 
 
 
383 aa  79.7  3e-14  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00498247  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  37.38 
 
 
347 aa  79.7  3e-14  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  35.88 
 
 
351 aa  79.7  3e-14  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2691  secretion protein HlyD family protein  37.96 
 
 
369 aa  79.3  4e-14  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.955062  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7637  efflux pump protein  38.06 
 
 
385 aa  79.3  4e-14  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.969695 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4410  secretion protein HlyD family protein  33.1 
 
 
370 aa  79  5e-14  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  38.1 
 
 
366 aa  79  5e-14  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  39.5 
 
 
390 aa  79  5e-14  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2082  secretion protein HlyD  35.43 
 
 
371 aa  79  5e-14  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.565949 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  31.85 
 
 
422 aa  79  5e-14  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  38.32 
 
 
352 aa  79  6e-14  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  36.18 
 
 
383 aa  79  6e-14  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2180  secretion protein HlyD  30.3 
 
 
408 aa  79  6e-14  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06903  histidine kinase  34.38 
 
 
341 aa  79  6e-14  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  37.12 
 
 
349 aa  79  6e-14  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  35.24 
 
 
387 aa  78.6  6e-14  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  36.36 
 
 
354 aa  79  6e-14  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7028  secretion protein HlyD family protein  40 
 
 
342 aa  79  6e-14  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.146297  normal  0.512794 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  37.7 
 
 
366 aa  78.6  7e-14  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2377  secretion protein HlyD family protein  40.46 
 
 
348 aa  78.6  7e-14  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  35.24 
 
 
387 aa  78.6  7e-14  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3379  secretion protein HlyD family protein  33.08 
 
 
360 aa  78.6  8e-14  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.316914 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0257  secretion protein, HlyD family  34.13 
 
 
337 aa  78.2  9e-14  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.787376  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0434  secretion protein HlyD family protein  34.13 
 
 
337 aa  78.2  9e-14  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.532566  hitchhiker  1.08123e-08 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2289  secretion protein HlyD family protein  40.46 
 
 
348 aa  78.2  9e-14  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0702685  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  35.51 
 
 
375 aa  77.4  1e-13  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1203  secretion protein HlyD family protein  38.39 
 
 
325 aa  78.2  1e-13  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0133764  normal  0.454228 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0912  secretion protein HlyD family protein  33.86 
 
 
368 aa  77.8  1e-13  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.659301  normal  0.435651 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2237  membrane fusion protein (MFP) family protein  33.86 
 
 
368 aa  77.8  1e-13  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1574  secretion protein HlyD  39.39 
 
 
348 aa  77.8  1e-13  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3104  secretion protein HlyD family protein  32.82 
 
 
407 aa  77.8  1e-13  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599645  normal  0.0169498 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>