More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3463 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3463  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
123 aa  250  5.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000113736  hitchhiker  0.007671 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2659  transcriptional regulator, ArsR family  73.64 
 
 
110 aa  164  4e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1065  regulatory protein ArsR  77.45 
 
 
124 aa  164  5e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2754  transcriptional regulator, ArsR family  77 
 
 
110 aa  161  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1210  ArsR family transcriptional regulator  73.53 
 
 
109 aa  157  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  58.33 
 
 
105 aa  117  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5491  transcriptional regulator, ArsR family  53.06 
 
 
99 aa  108  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.030695  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7536  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.61 
 
 
193 aa  104  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.92847 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  52.63 
 
 
105 aa  102  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1002  transcriptional regulator, ArsR family  51.06 
 
 
103 aa  102  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2163  ArsR family transcriptional regulator  45.1 
 
 
141 aa  100  9e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159359  decreased coverage  0.0016254 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  43.36 
 
 
117 aa  99.8  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2048  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
129 aa  98.6  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1478  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 
132 aa  97.4  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276238  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2671  regulatory protein ArsR  45.83 
 
 
106 aa  97.1  8e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150345  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2886  transcriptional regulator, TrmB  40.95 
 
 
114 aa  95.5  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  43.56 
 
 
105 aa  92.8  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0967  ArsR family transcriptional regulator  45.1 
 
 
111 aa  92  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  45.05 
 
 
119 aa  91.3  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  42.71 
 
 
109 aa  90.9  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1063  transcriptional regulator, ArsR family  46.39 
 
 
102 aa  89.4  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4032  transcriptional regulator, ArsR family  41.82 
 
 
112 aa  88.2  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162446  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1115  transcriptional regulator, ArsR family  47.37 
 
 
97 aa  85.5  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13443  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4165  transcriptional regulator, ArsR family  41.75 
 
 
115 aa  85.5  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
105 aa  85.1  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1204  ArsR family transcriptional regulator  41.75 
 
 
113 aa  85.1  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.79404  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3234  regulatory protein, ArsR  40.21 
 
 
129 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
130 aa  84  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  44.94 
 
 
118 aa  83.6  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1174  transcriptional regulator, ArsR family  47.42 
 
 
109 aa  83.6  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  44.79 
 
 
111 aa  83.6  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  40.43 
 
 
104 aa  82.8  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2556  ArsR family transcriptional regulator  42.22 
 
 
115 aa  82  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 
121 aa  82  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  30.91 
 
 
120 aa  81.6  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0512  regulatory protein ArsR  40.95 
 
 
124 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.991267  normal  0.111828 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3941  transcriptional regulator, ArsR family  43.69 
 
 
113 aa  81.3  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393884  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  40.43 
 
 
115 aa  80.9  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3232  transcriptional regulator, ArsR family  41.84 
 
 
113 aa  80.5  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  40.62 
 
 
112 aa  80.1  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  41.57 
 
 
121 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
122 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2838  transcriptional regulator, ArsR family  38.78 
 
 
113 aa  79  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.221862 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  37.86 
 
 
117 aa  78.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2681  regulatory protein, ArsR  39.81 
 
 
113 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  0.0738216 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  37.11 
 
 
104 aa  77.8  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5412  transcriptional regulator, ArsR family  34.69 
 
 
110 aa  77.8  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  34.17 
 
 
185 aa  76.6  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
123 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  44.21 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  35.2 
 
 
137 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  36.73 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6352  transcriptional regulator, ArsR family  42.27 
 
 
120 aa  75.9  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  40.43 
 
 
133 aa  75.5  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  40.86 
 
 
169 aa  74.7  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
117 aa  75.1  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  39.33 
 
 
106 aa  75.5  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3344  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
197 aa  74.7  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1812  transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 
106 aa  74.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  36.46 
 
 
110 aa  74.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
124 aa  73.6  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
107 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
110 aa  73.2  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.61 
 
 
128 aa  72.8  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 
121 aa  73.2  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3142  transcriptional regulator, ArsR family  42.5 
 
 
230 aa  72  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.258629 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
107 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
107 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
107 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
107 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
107 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  34.07 
 
 
107 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  34.07 
 
 
107 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  39.36 
 
 
118 aa  72.4  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  34.07 
 
 
107 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  34.07 
 
 
107 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1953  transcriptional regulator, ArsR family  44.05 
 
 
126 aa  72.4  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  31.63 
 
 
106 aa  72  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  37 
 
 
104 aa  71.6  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  33.66 
 
 
113 aa  71.2  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1071  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
111 aa  71.2  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
115 aa  71.2  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  39.18 
 
 
105 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  37 
 
 
115 aa  70.5  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  31.96 
 
 
113 aa  70.1  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  33.01 
 
 
106 aa  70.1  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  41.11 
 
 
114 aa  69.7  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  30.21 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1608  transcriptional regulator, ArsR family  33.08 
 
 
131 aa  69.3  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.942634 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2507  regulatory protein ArsR  35.87 
 
 
120 aa  68.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0238206 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2109  ArsR family transcriptional regulator  40.22 
 
 
131 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0530099  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
118 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1718  regulatory protein ArsR  30.93 
 
 
110 aa  68.6  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0000189472  hitchhiker  0.000160719 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  32.63 
 
 
108 aa  68.2  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  41.25 
 
 
99 aa  68.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  34 
 
 
104 aa  68.2  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1646  ArsR family transcriptional regulator  37.11 
 
 
114 aa  67.8  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0656064 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 
115 aa  68.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  34 
 
 
111 aa  68.2  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5809  transcriptional regulator, ArsR family  36.17 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.522753  normal  0.488777 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>