100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2882 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2882  putative signal transduction protein  100 
 
 		 397 aa  808    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0347  diguanylate phosphodiesterase  28.07 
 
 		 400 aa  184  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.145586  normal  0.218991 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03533  EAL domain protein  26.38 
 
 		 408 aa  171  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1442  hypothetical protein  27.54 
 
 		 404 aa  169  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000750338  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002124  predicted signal transduction protein  25.56 
 
 		 407 aa  161  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1937  putative signaling protein  26.13 
 
 		 400 aa  162  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2098  diguanylate phosphodiesterase  26.55 
 
 		 405 aa  158  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3947  diguanylate phosphodiesterase  25.69 
 
 		 413 aa  157  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103414  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00298  signal transduction protein  25.44 
 
 		 407 aa  156  6e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3464  EAL domain-containing protein  24.02 
 
 		 406 aa  152  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126352  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3594  diguanylate phosphodiesterase  26.15 
 
 		 402 aa  146  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00249356  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2174  diguanylate phosphodiesterase  26.05 
 
 		 408 aa  145  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120475  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003840  predicted signal transduction protein  24 
 
 		 404 aa  144  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000123266  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2930  putative signaling protein  22.52 
 
 		 406 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1814  diguanylate phosphodiesterase  25.81 
 
 		 405 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.877922  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0339  signal transduction protein  23.86 
 
 		 409 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0012225  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2383  hypothetical protein  25.99 
 
 		 408 aa  137  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3130  diguanylate phosphodiesterase  28.07 
 
 		 413 aa  136  5e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03534  diguanylate phosphodiesterase  22.28 
 
 		 411 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0852439  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1720  diguanylate phosphodiesterase  27.48 
 
 		 412 aa  133  5e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3129  diguanylate phosphodiesterase  25.56 
 
 		 415 aa  132  9e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0413  diguanylate phosphodiesterase  22.97 
 
 		 397 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029399  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1938  diguanylate phosphodiesterase  28.29 
 
 		 422 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0322  putative signal transduction protein  27.47 
 
 		 403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2780  diguanylate phosphodiesterase  25.24 
 
 		 411 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.948032  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1652  diguanylate phosphodiesterase  23 
 
 		 406 aa  126  7e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2417  diguanylate phosphodiesterase  25.25 
 
 		 411 aa  123  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000004717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2981  diguanylate phosphodiesterase  25.25 
 
 		 412 aa  123  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0150403  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3084  putative signal transduction protein  25.06 
 
 		 419 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0828  diguanylate phosphodiesterase  29.87 
 
 		 413 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.81779  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0122  diguanylate phosphodiesterase  24.93 
 
 		 400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000715595  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0920  diguanylate phosphodiesterase  27.29 
 
 		 416 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.135015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5115  diguanylate phosphodiesterase  25.74 
 
 		 429 aa  118  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0127  hypothetical protein  26.53 
 
 		 402 aa  117  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1316  diguanylate phosphodiesterase  25.76 
 
 		 419 aa  116  6e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1268  diguanylate phosphodiesterase  25.45 
 
 		 407 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15473  normal  0.0747469 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0991  diguanylate phosphodiesterase  26.59 
 
 		 423 aa  116  8.999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0906  diguanylate phosphodiesterase  26.59 
 
 		 423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3977  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1729  diguanylate phosphodiesterase  25.67 
 
 		 419 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1965  diguanylate phosphodiesterase  23.57 
 
 		 413 aa  110  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.616321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1612  diguanylate phosphodiesterase  23.53 
 
 		 410 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0416985  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2312  diguanylate phosphodiesterase  29.03 
 
 		 423 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1073  diguanylate phosphodiesterase  24.2 
 
 		 428 aa  110  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2343  diguanylate phosphodiesterase  25.93 
 
 		 431 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00856181  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1149  EAL domain-containing protein  25.86 
 
 		 411 aa  107  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0573  hypothetical protein  24.41 
 
 		 379 aa  106  6e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0905  diguanylate phosphodiesterase  24.81 
 
 		 431 aa  106  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0592  hypothetical protein  24.66 
 
 		 379 aa  106  9e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1998  diguanylate phosphodiesterase  26.7 
 
 		 404 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1332  diguanylate phosphodiesterase  23.84 
 
 		 424 aa  105  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0990  diguanylate phosphodiesterase  24.81 
 
 		 431 aa  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1352  hypothetical protein  22.07 
 
 		 411 aa  103  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1315  diguanylate phosphodiesterase  25.62 
 
 		 449 aa  103  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5114  diguanylate phosphodiesterase  25.25 
 
 		 464 aa  102  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2451  diguanylate phosphodiesterase  24.94 
 
 		 423 aa  102  9e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.694346  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1719  diguanylate phosphodiesterase  23.76 
 
 		 448 aa  102  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3234  diguanylate phosphodiesterase  24 
 
 		 408 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.114779 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1888  diguanylate phosphodiesterase  22.42 
 
 		 400 aa  100  5e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.61283  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1384  putative signal transduction protein  30.71 
 
 		 463 aa  99.8  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0010  diguanylate phosphodiesterase  24.59 
 
 		 487 aa  98.6  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0508854 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1462  diguanylate phosphodiesterase  23.91 
 
 		 405 aa  98.2  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2159  signal transduction protein  27.61 
 
 		 480 aa  98.2  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140137  normal  0.149553 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3300  EAL  25.99 
 
 		 417 aa  95.5  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0860  diguanylate phosphodiesterase  23.24 
 
 		 397 aa  94  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2615  diguanylate phosphodiesterase  24.58 
 
 		 411 aa  94  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1497  putative signal transduction protein  23.39 
 
 		 414 aa  93.2  7e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1990  diguanylate phosphodiesterase  24.94 
 
 		 414 aa  92.4  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.973618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1598  diguanylate phosphodiesterase  24.21 
 
 		 411 aa  92.4  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2937  diguanylate phosphodiesterase  24.75 
 
 		 411 aa  91.7  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.64133  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1779  diguanylate phosphodiesterase  27.48 
 
 		 450 aa  90.5  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2912  diguanylate phosphodiesterase  28.34 
 
 		 447 aa  90.1  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2915  diguanylate phosphodiesterase  27.67 
 
 		 458 aa  89.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.555808 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1476  putative signal transduction protein  20.75 
 
 		 403 aa  88.6  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542008  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1693  EAL domain protein  22.91 
 
 		 410 aa  88.2  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3785  diguanylate phosphodiesterase  31.75 
 
 		 444 aa  88.2  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2840  diguanylate phosphodiesterase  26.58 
 
 		 403 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4155  putative signal transduction protein  25.6 
 
 		 438 aa  85.9  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1568  diguanylate phosphodiesterase  25.54 
 
 		 460 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1776  diguanylate phosphodiesterase  26.5 
 
 		 448 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.265098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1852  diguanylate phosphodiesterase  22.17 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12834  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0842  signal transduction protein  30.22 
 
 		 389 aa  79.7  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0117523 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1571  diguanylate phosphodiesterase  28.23 
 
 		 445 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3736  diguanylate phosphodiesterase  22.25 
 
 		 406 aa  79.3  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000203381 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2907  signal transduction protein  23.38 
 
 		 439 aa  77.8  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386149  normal  0.411691 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3062  signal transduction protein  29.89 
 
 		 403 aa  76.6  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0202013  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0056  signal transduction protein  26.81 
 
 		 444 aa  76.3  0.0000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.680301  normal  0.542378 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2723  putative signal transduction protein  29.68 
 
 		 399 aa  75.5  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000022717 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3725  putative signal transduction protein  29.74 
 
 		 378 aa  75.1  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4244  diguanylate phosphodiesterase  25.08 
 
 		 428 aa  72.4  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2212  putative signal transduction protein  28.48 
 
 		 394 aa  67.8  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.566783 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4213  EAL  26.02 
 
 		 402 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1201  putative signal transduction protein  23.71 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31360  predicted signal transduction protein containing EAL and modified HD-GYP domains  23.05 
 
 		 418 aa  63.9  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.041924 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3112  putative signal transduction protein  30.61 
 
 		 413 aa  53.1  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2044  putative signal transduction protein  24.9 
 
 		 398 aa  53.1  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3839  putative signal transduction protein  30.61 
 
 		 403 aa  52.8  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4432  putative signal transduction protein  27.89 
 
 		 409 aa  48.9  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0714  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  28.06 
 
 		 524 aa  46.6  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0622  putative signal transduction protein  28.67 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  34.25 
 
 		 397 aa  43.5  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>