153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1545 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1105 aa  2246    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  38.29 
 
 		 1075 aa  604  1.0000000000000001e-171  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0315  hypothetical protein  33.11 
 
 		 1125 aa  551  1e-155  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269975  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1501  TonB-dependent receptor  30.41 
 
 		 1123 aa  378  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.175276  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 1123 aa  358  2.9999999999999997e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  29.91 
 
 		 1069 aa  355  2.9999999999999997e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3909  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 		 1153 aa  345  2.9999999999999997e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000652763  hitchhiker  0.00581227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0918  Cna B-type protein  29.1 
 
 		 1203 aa  311  5e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.133902  normal  0.024731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1549  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 1065 aa  310  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0532  hypothetical protein  29.16 
 
 		 1161 aa  309  2.0000000000000002e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.909749  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3831  hypothetical protein  29.32 
 
 		 1141 aa  300  1e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885568  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2136  TonB-dependent receptor  29.86 
 
 		 1124 aa  297  7e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0917219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 1149 aa  288  4e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 1232 aa  286  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0417  TonB-dependent receptor  28.56 
 
 		 1167 aa  286  2.0000000000000002e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2674  hypothetical protein  26.81 
 
 		 1132 aa  282  3e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0423  hypothetical protein  28.46 
 
 		 1162 aa  274  5.000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000804756  normal  0.0470711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 1114 aa  271  5e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  27.02 
 
 		 1195 aa  267  8e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0910  Cna B-type protein  26.13 
 
 		 1210 aa  244  6e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0761407  normal  0.0249052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0428  hypothetical protein  29.26 
 
 		 1196 aa  241  5e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.211152  normal  0.0171632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 1105 aa  239  3e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2388  Cna B-type protein  26.02 
 
 		 1162 aa  228  5.0000000000000005e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.315243  normal  0.974277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3840  hypothetical protein  25.21 
 
 		 1122 aa  221  6e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0663  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 1176 aa  218  4e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00550591  normal  0.789281 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0395  hypothetical protein  25.85 
 
 		 1257 aa  212  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4154  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 1206 aa  208  4e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0933  Cna B-type protein  27.95 
 
 		 1194 aa  206  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000219871  decreased coverage  0.000250734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  38.85 
 
 		 1075 aa  192  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0445  hypothetical protein  28.81 
 
 		 1173 aa  191  5e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0367904 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2573  Cna B-type protein  36.42 
 
 		 511 aa  179  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  36.14 
 
 		 1041 aa  179  4e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0900  hypothetical protein  24.7 
 
 		 1194 aa  174  5.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1678  hypothetical protein  32.66 
 
 		 986 aa  167  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0625  Cna B-type protein  34.29 
 
 		 1298 aa  166  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  27.01 
 
 		 1074 aa  138  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0691  hypothetical protein  30.86 
 
 		 979 aa  131  6e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3450  hypothetical protein  24.02 
 
 		 1068 aa  131  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0554556 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0637  hypothetical protein  33.88 
 
 		 1066 aa  131  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0627569 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  31.28 
 
 		 1071 aa  127  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  30.48 
 
 		 1052 aa  122  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2675  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 1188 aa  122  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  30.59 
 
 		 1120 aa  121  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  30.65 
 
 		 1126 aa  120  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  31.1 
 
 		 1109 aa  120  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  30.59 
 
 		 1122 aa  121  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0330  TonB-dependent outer membrane receptor precursor  24.35 
 
 		 1041 aa  120  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000673436  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5935  TonB-dependent receptor plug  24.82 
 
 		 1097 aa  119  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  30.4 
 
 		 1067 aa  119  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0348  hypothetical protein  29.89 
 
 		 1008 aa  112  5e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  32.42 
 
 		 992 aa  109  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2698  TonB-dependent receptor  32.21 
 
 		 1010 aa  108  5e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0313  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 		 1008 aa  108  5e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  30.54 
 
 		 1054 aa  108  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0594  hypothetical protein  30.09 
 
 		 1053 aa  107  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03612  TonB-dependent outer membrane receptor  30.97 
 
 		 1010 aa  106  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0970  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 991 aa  103  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5072  OmpA-related protein  29.11 
 
 		 1125 aa  102  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.813038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1015  TonB-dependent receptor  29.87 
 
 		 1016 aa  99.8  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.501659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0143  Oar protein  27.54 
 
 		 1068 aa  99.8  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1306  TonB-dependent receptor plug  22.24 
 
 		 1100 aa  99.8  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634411 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1376  TonB-dependent outer membrane receptor  24.95 
 
 		 1081 aa  98.2  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00784128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3525  Cna B-type protein  28.61 
 
 		 966 aa  97.4  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  28.05 
 
 		 1074 aa  97.8  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0171  hypothetical protein  29.67 
 
 		 1077 aa  96.3  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0342  TonB-dependent receptor plug  27.33 
 
 		 1007 aa  95.1  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 993 aa  93.6  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00733  putative Outer membrane protein with a TonB box  24.93 
 
 		 1057 aa  93.2  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250529  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1319  TonB-dependent receptor plug  29.32 
 
 		 1066 aa  92  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01318  TonB-dependent outer membrane Receptor/Oar-like protein  28.57 
 
 		 1056 aa  91.3  9e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.529934  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02276  TonB-dependent outer membrane Receptor  30.95 
 
 		 1050 aa  89.7  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3010  hypothetical protein  22.38 
 
 		 1129 aa  89.7  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1116  TonB-dependent receptor, plug  27.21 
 
 		 1116 aa  87.8  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.880967  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3841  hypothetical protein  28.03 
 
 		 1105 aa  87  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1968  putative OmpA family protein  23.64 
 
 		 1051 aa  86.3  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2744  putative outer membrane protein with a TonB box  29.62 
 
 		 1061 aa  86.7  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.111846 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2685  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 1026 aa  85.1  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2574  hypothetical protein  28.67 
 
 		 710 aa  82  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3920  hypothetical protein  28 
 
 		 1071 aa  80.9  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818859  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2876  TonB-dependent receptor  31.18 
 
 		 1007 aa  80.9  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  24.31 
 
 		 972 aa  80.5  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4161  hypothetical protein  26.56 
 
 		 1008 aa  79  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000881228  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0168  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 1066 aa  77  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01883  TonB-dependent Receptor/Oar-like protein  27.3 
 
 		 1037 aa  77  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144968  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0368  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  25.17 
 
 		 1066 aa  75.5  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1415  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 		 871 aa  73.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810305  normal  0.0488884 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03611  TonB-dependent outer membrane receptor  28.21 
 
 		 1012 aa  73.6  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0536  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  25.61 
 
 		 1008 aa  70.5  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3213  putative oar protein  25.87 
 
 		 1001 aa  69.7  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000600939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 897 aa  68.6  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1991  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 749 aa  68.6  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4107  putative oar protein  25.32 
 
 		 994 aa  68.6  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000254754  hitchhiker  0.000800061 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4791  putative oar protein  24.43 
 
 		 997 aa  65.9  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 888 aa  65.1  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  30.54 
 
 		 787 aa  65.1  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1148  TonB-dependent receptor, plug  21.66 
 
 		 1007 aa  64.7  0.000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2516  TonB-dependent receptor plug  28.72 
 
 		 772 aa  64.7  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 1087 aa  63.2  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  31.55 
 
 		 833 aa  62.4  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  24.03 
 
 		 788 aa  60.8  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>