More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0002 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0002  DNA polymerase III, beta subunit  100 
 
 		 371 aa  760    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000194465  normal  0.0534413 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  35.98 
 
 		 375 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0002  DNA polymerase III, beta subunit  35.98 
 
 		 375 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0002  DNA polymerase III, beta subunit  35.98 
 
 		 375 aa  246  4e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0002  DNA polymerase III, beta subunit  36.62 
 
 		 376 aa  245  8e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.78 
 
 		 373 aa  231  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.394263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.22 
 
 		 372 aa  225  8e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.22 
 
 		 365 aa  222  9e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3374  DNA polymerase III subunit beta  35.19 
 
 		 372 aa  220  3e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0002  DNA polymerase III subunit beta  35.36 
 
 		 372 aa  219  7e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.142435  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0001  DNA polymerase III, beta subunit  33.69 
 
 		 372 aa  218  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0872728  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0002  DNA polymerase III subunit beta  33.77 
 
 		 372 aa  217  2e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000275643  normal  0.722211 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0708  DNA polymerase III subunit beta  35.09 
 
 		 371 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.147601  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.95 
 
 		 372 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0618208  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0004  DNA polymerase III subunit beta  34.92 
 
 		 385 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.638398  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.42 
 
 		 372 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0002  DNA polymerase III subunit beta  35.88 
 
 		 397 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00789927  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0002  DNA polymerase III subunit beta  35.62 
 
 		 397 aa  213  3.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41342  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.98 
 
 		 372 aa  213  5.999999999999999e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000259068  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4329  DNA polymerase III subunit beta  34.47 
 
 		 372 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0002  DNA polymerase III subunit beta  33.33 
 
 		 373 aa  211  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0861969  hitchhiker  0.000000929484 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.65 
 
 		 372 aa  211  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000138199  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4592  DNA polymerase III subunit beta  34.21 
 
 		 372 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0352599 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1278  DNA polymerase III subunit beta  32.8 
 
 		 373 aa  210  3e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  unclonable  2.76035e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0004  DNA polymerase III subunit beta  34.38 
 
 		 372 aa  210  3e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114385  unclonable  5.12755e-25 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2834  DNA polymerase III subunit beta  34.56 
 
 		 372 aa  209  4e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3047  DNA polymerase III subunit beta  34.3 
 
 		 371 aa  208  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.579013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2239  DNA polymerase III subunit beta  34.92 
 
 		 373 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0102545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1343  DNA polymerase III subunit beta  34.38 
 
 		 372 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0012  DNA polymerase III subunit beta  34.38 
 
 		 372 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.24 
 
 		 366 aa  207  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000466477  normal  0.315264 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0014  DNA-directed DNA polymerase  34.49 
 
 		 366 aa  206  4e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000733559  hitchhiker  0.000643873 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0816  DNA polymerase III, beta subunit  33.15 
 
 		 366 aa  206  5e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.731986  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0002  DNA polymerase III subunit beta  34.12 
 
 		 372 aa  206  7e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2795  DNA polymerase III subunit beta  33.69 
 
 		 370 aa  206  7e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.924667  normal  0.594035 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3705  DNA polymerase III subunit beta  34.75 
 
 		 372 aa  204  1e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0432616 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0003  DNA polymerase III subunit beta  33.86 
 
 		 372 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295963  hitchhiker  0.00000350231 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3543  DNA polymerase III subunit beta  33.68 
 
 		 372 aa  205  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0002  DNA polymerase III subunit beta  36.22 
 
 		 372 aa  205  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0002  DNA polymerase III subunit beta  33.86 
 
 		 372 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.120269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.07 
 
 		 376 aa  204  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0002  DNA-directed DNA polymerase  31.99 
 
 		 367 aa  204  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0002  DNA polymerase III subunit beta  33.6 
 
 		 365 aa  204  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000590568  unclonable  0.00000000000512174 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0003  DNA polymerase III subunit beta  34.39 
 
 		 373 aa  204  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  0.512948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0002  DNA polymerase III subunit beta  34.39 
 
 		 373 aa  204  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0002  DNA polymerase III subunit beta  33.16 
 
 		 367 aa  203  4e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.186277  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0002  DNA polymerase III subunit beta  34.03 
 
 		 372 aa  203  4e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0730917  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0002  DNA polymerase III subunit beta  33.51 
 
 		 372 aa  202  6e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.205747 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1226  DNA polymerase III, beta subunit  34.85 
 
 		 366 aa  202  6e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.123805  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0616  DNA polymerase III, beta subunit  34.08 
 
 		 372 aa  202  7e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3235  DNA polymerase III, beta subunit  32.44 
 
 		 374 aa  202  9e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0867918 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00443  DNA polymerase III subunit beta  31.83 
 
 		 366 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1429  DNA polymerase III subunit beta  34.29 
 
 		 375 aa  202  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002008  DNA polymerase III beta subunit  31.83 
 
 		 366 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000997729  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0002  DNA polymerase III subunit beta  33.42 
 
 		 372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.474691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0003  DNA polymerase III subunit beta  33.6 
 
 		 373 aa  200  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.174848  normal  0.920378 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2506  DNA polymerase III subunit beta  31.64 
 
 		 366 aa  200  3e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000126636  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0002  DNA polymerase III subunit beta  33.94 
 
 		 372 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0002  DNA polymerase III subunit beta  33.42 
 
 		 366 aa  199  3.9999999999999996e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.366013 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.63 
 
 		 366 aa  199  5e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103765  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.63 
 
 		 366 aa  199  5e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000634429  hitchhiker  0.000143129 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.8 
 
 		 373 aa  199  5e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00126039  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.63 
 
 		 366 aa  199  5e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000637071  unclonable  0.00000000000326658 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0953  DNA polymerase III, beta subunit  31.25 
 
 		 374 aa  199  5e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.63 
 
 		 366 aa  199  5e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000848773  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.62 
 
 		 366 aa  199  6e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000200886  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03482  DNA polymerase III subunit beta  32.53 
 
 		 366 aa  199  7e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0351  DNA polymerase III subunit beta  32.89 
 
 		 412 aa  199  7e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0002  DNA polymerase III subunit beta  33.77 
 
 		 372 aa  199  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.18 
 
 		 366 aa  199  7e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000472427  hitchhiker  0.00139326 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.18 
 
 		 366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000490932  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0002  DNA polymerase III subunit beta  35.26 
 
 		 373 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0966551  normal  0.572668 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.91 
 
 		 366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000577304  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0010  DNA polymerase III, beta subunit  31.91 
 
 		 366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000642144  hitchhiker  0.00000000134313 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.71 
 
 		 366 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.161415  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.18 
 
 		 367 aa  196  4.0000000000000005e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000905958  normal  0.127223 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.89 
 
 		 366 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000136085  unclonable  0.00000000917615 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0002  DNA polymerase III subunit beta  34.58 
 
 		 367 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.71 
 
 		 366 aa  196  6e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00825161  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.3 
 
 		 379 aa  196  7e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0009  DNA polymerase III, beta subunit  32.63 
 
 		 366 aa  195  9e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0162  DNA polymerase III subunit beta  32.98 
 
 		 372 aa  194  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281652  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.72 
 
 		 373 aa  195  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.125376 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2554  DNA polymerase III subunit beta  32.61 
 
 		 368 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376427  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.61 
 
 		 368 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.481367  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.61 
 
 		 368 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0846842  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.63 
 
 		 373 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0823829  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.61 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0232451  hitchhiker  0.0000583688 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0007  DNA-directed DNA polymerase  32.89 
 
 		 366 aa  194  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000118658  unclonable  0.000000000121971 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0102  DNA polymerase III subunit beta  32.97 
 
 		 367 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3183  DNA polymerase III subunit beta  32.34 
 
 		 368 aa  193  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00267181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.34 
 
 		 368 aa  193  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.011531  normal  0.38726 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.34 
 
 		 368 aa  193  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0645593  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.9 
 
 		 366 aa  192  9e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00514307  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.47 
 
 		 367 aa  192  9e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000348538  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0002  DNA polymerase III subunit beta  32.7 
 
 		 367 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.18752  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0300  DNA polymerase III subunit beta  32.7 
 
 		 367 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0088  DNA polymerase III subunit beta  32.7 
 
 		 367 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2236  DNA polymerase III subunit beta  32.7 
 
 		 367 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2849  DNA polymerase III subunit beta  32.7 
 
 		 367 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>