More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1014 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1014  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  478  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0169209 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1411  alanine racemase domain-containing protein  58.9 
 
 		 249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2922  alanine racemase domain protein  61.44 
 
 		 244 aa  229  3e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00447103  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1115  hypothetical protein  58.3 
 
 		 240 aa  226  3e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.69677  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3058  alanine racemase domain-containing protein  53.85 
 
 		 234 aa  221  8e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0278131  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6102  alanine racemase domain protein  52.08 
 
 		 247 aa  217  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349196  normal  0.131737 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0902  alanine racemase domain protein  56.54 
 
 		 242 aa  215  5e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2875  alanine racemase domain protein  55.84 
 
 		 234 aa  211  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99771  normal  0.581883 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3435  alanine racemase domain-containing protein  51.41 
 
 		 248 aa  204  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3209  alanine racemase domain-containing protein  54.98 
 
 		 248 aa  198  7e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5758  alanine racemase domain protein  49.78 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1575  hypothetical protein  50.43 
 
 		 242 aa  191  8e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.18502  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27350  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  51.24 
 
 		 244 aa  191  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3194  alanine racemase domain protein  55.08 
 
 		 238 aa  189  5e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052402  normal  0.0388223 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16520  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  49.6 
 
 		 254 aa  182  6e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.129744  normal  0.0429628 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1420  hypothetical protein  46.61 
 
 		 346 aa  180  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0186857  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1576  alanine racemase domain protein  50.41 
 
 		 245 aa  177  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2641  alanine racemase domain protein  49.79 
 
 		 236 aa  177  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4007  alanine racemase domain-containing protein  50.83 
 
 		 249 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0551475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5092  PLP-binding domain-containing protein  40.2 
 
 		 319 aa  162  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.340872  hitchhiker  0.00296969 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3257  alanine racemase domain protein  49.51 
 
 		 246 aa  155  6e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228038  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  40.34 
 
 		 229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12178  hypothetical protein  43.09 
 
 		 258 aa  152  4e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0576218  normal  0.69915 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  46.41 
 
 		 228 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3518  alanine racemase domain-containing protein  43.98 
 
 		 275 aa  150  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0114479  normal  0.0724046 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2415  alanine racemase domain protein  44.83 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  40.69 
 
 		 271 aa  150  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2993  alanine racemase domain-containing protein  42.68 
 
 		 279 aa  148  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.482567  normal  0.0186437 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  43.7 
 
 		 244 aa  148  7e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  44.49 
 
 		 234 aa  148  9e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  44.4 
 
 		 228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  44.64 
 
 		 235 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3012  alanine racemase domain protein  45.99 
 
 		 259 aa  145  7.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3262  alanine racemase domain-containing protein  44.31 
 
 		 254 aa  144  9e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0192455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3251  hypothetical protein  44.31 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.563213  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0138  hypothetical protein  40 
 
 		 242 aa  144  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0131746 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3313  alanine racemase domain-containing protein  44.31 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.147788 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0832  alanine racemase domain-containing protein  40 
 
 		 232 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.399806  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  42.86 
 
 		 232 aa  142  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  44.83 
 
 		 228 aa  142  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3347  alanine racemase family  39.83 
 
 		 234 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.335784  normal  0.144225 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3274  alanine racemase family  39.83 
 
 		 234 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0475278 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3443  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  39.83 
 
 		 234 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0820315 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3339  alanine racemase family protein  39.83 
 
 		 234 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.519694 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0830  hypothetical protein  40 
 
 		 232 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3263  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  39.83 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  45.73 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03578  hypothetical protein  36.96 
 
 		 236 aa  139  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  41.42 
 
 		 228 aa  140  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13550  conserved hypothetical protein TIGR00044  48.62 
 
 		 262 aa  139  3e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32989  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  35.24 
 
 		 235 aa  139  4.999999999999999e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  42.31 
 
 		 234 aa  139  6e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  44.77 
 
 		 228 aa  138  7e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  44.49 
 
 		 228 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02781  predicted enzyme  40.85 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.121558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0744  alanine racemase domain protein  40.85 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002457  hypothetical protein  36.96 
 
 		 233 aa  137  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3093  alanine racemase  40.85 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310002 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3295  alanine racemase  40.85 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02744  hypothetical protein  40.85 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108166  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3111  alanine racemase  40.85 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0543  membrane protein, related to K+ transport  36.52 
 
 		 255 aa  138  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4254  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  40.85 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.499723  normal  0.581588 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05160  hypothetical protein  44.02 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.181322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3383  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  40.85 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0763  alanine racemase domain-containing protein  40.85 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.265197  hitchhiker  0.00045087 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0042  alanine racemase domain protein  44.04 
 
 		 218 aa  135  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000221923 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1237  hypothetical protein  36.32 
 
 		 261 aa  135  4e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0494  hypothetical protein  44.44 
 
 		 230 aa  135  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1784  alanine racemase domain-containing protein  40.25 
 
 		 241 aa  135  4e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3208  hypothetical protein  38.86 
 
 		 225 aa  135  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491657  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  39.06 
 
 		 230 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  44.68 
 
 		 228 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  38.63 
 
 		 230 aa  135  8e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1145  alanine racemase domain-containing protein  35.9 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  43.9 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2683  hypothetical protein  43.4 
 
 		 240 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.175356 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0013  hypothetical protein  38.53 
 
 		 236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3040  alanine racemase domain-containing protein  38.7 
 
 		 232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000913695  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  42.13 
 
 		 241 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1338  alanine racemase domain protein  38.7 
 
 		 239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300901  hitchhiker  0.000000312862 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  38.79 
 
 		 262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  32.19 
 
 		 235 aa  133  3e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0498  alanine racemase domain-containing protein  40.89 
 
 		 235 aa  133  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.812973  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  37.8 
 
 		 276 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  40.08 
 
 		 237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  40.34 
 
 		 229 aa  132  5e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  36.96 
 
 		 233 aa  132  5e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3663  hypothetical protein  34.75 
 
 		 239 aa  132  6e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.152819  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  32.63 
 
 		 233 aa  132  6e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1288  hypothetical protein  44.73 
 
 		 232 aa  132  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3183  alanine racemase domain-containing protein  38.7 
 
 		 232 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000633261  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  37.29 
 
 		 271 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3357  alanine racemase domain-containing protein  40.09 
 
 		 233 aa  131  7.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00164594 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  41.63 
 
 		 229 aa  131  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3025  alanine racemase domain-containing protein  37.83 
 
 		 232 aa  131  9e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116618  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  43.1 
 
 		 229 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2919  alanine racemase domain protein  42.31 
 
 		 238 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1215  hypothetical protein  34.33 
 
 		 231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.157009  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0278  alanine racemase domain-containing protein  39.3 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.334709  normal  0.0228737 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>