More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4619 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1108  hypothetical protein  57.19 
 
 		 593 aa  687    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4005  hypothetical protein  64.95 
 
 		 610 aa  805    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.467683  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4619  hypothetical protein  100 
 
 		 615 aa  1255    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.502486 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3974  hypothetical protein  67.6 
 
 		 607 aa  824    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335001 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3682  NERD domain-containing protein  66.01 
 
 		 601 aa  844    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.023391  normal  0.021571 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1772  DNA helicase II  50.08 
 
 		 619 aa  618  1e-176  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02993  hypothetical protein  50.49 
 
 		 612 aa  601  1e-170  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000145899  normal  0.116581 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5380  DNA helicase II  48.71 
 
 		 619 aa  557  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0076  DNA helicase II  46.5 
 
 		 632 aa  540  9.999999999999999e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0807  hypothetical protein  40.42 
 
 		 616 aa  483  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2959  NERD domain-containing protein  43.65 
 
 		 625 aa  475  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4939  DNA helicase II  39.42 
 
 		 613 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.891198  normal  0.619317 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4891  hypothetical protein  36.69 
 
 		 616 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.412698  normal  0.98473 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39740  DNA helicase  38.58 
 
 		 615 aa  369  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0820371  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4277  DNA helicase II  44.4 
 
 		 314 aa  226  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.260274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2302  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  27.93 
 
 		 607 aa  177  7e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1299  NERD domain protein  27.42 
 
 		 593 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1094  hypothetical protein  24.96 
 
 		 588 aa  151  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0809  LexA repressor  29.15 
 
 		 815 aa  124  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642499  hitchhiker  0.0000861607 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2326  putative DNA helicase  32.44 
 
 		 711 aa  105  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35190  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.83 
 
 		 737 aa  103  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2259  UvrD/REP helicase  33.6 
 
 		 710 aa  100  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0960519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4174  UvrD/REP helicase  29.97 
 
 		 716 aa  97.1  9e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1680  NERD domain-containing protein  22.15 
 
 		 568 aa  95.9  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0022  LexA repressor  26.71 
 
 		 819 aa  95.5  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000018035  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4063  UvrD/REP helicase  32.94 
 
 		 697 aa  94  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21557  normal  0.035765 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0064  putative DNA helicase  33.33 
 
 		 696 aa  93.6  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3757  UvrD/REP helicase  32.95 
 
 		 695 aa  89.4  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000385426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3085  UvrD/Rep helicase  29.84 
 
 		 717 aa  88.6  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.173371  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2728  UvrD/REP helicase  29.41 
 
 		 699 aa  88.2  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0355  UvrD/REP helicase  29.02 
 
 		 714 aa  88.2  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3740  UvrD/REP helicase  30.92 
 
 		 752 aa  85.9  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2943  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  26.13 
 
 		 696 aa  85.1  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2139  hypothetical protein  25.35 
 
 		 617 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1406  UvrD/REP helicase  28.29 
 
 		 708 aa  84.7  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.450912  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001515  hypothetical protein  24.25 
 
 		 634 aa  84.7  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.431863  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0743  plasmid stabilization system  33.85 
 
 		 712 aa  84.3  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3988  hypothetical protein  64.91 
 
 		 57 aa  83.6  0.000000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00319492  normal  0.306977 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0589  UvrD/REP helicase  31.6 
 
 		 663 aa  83.2  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3882  UvrD/REP helicase  28.57 
 
 		 704 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.229228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5811  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  28.57 
 
 		 704 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.859027 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4831  ATP-dependent DNA helicase UvrD  28.57 
 
 		 704 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1419  UvrD/REP helicase  28.79 
 
 		 706 aa  80.9  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3349  hypothetical protein  28.37 
 
 		 673 aa  80.1  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.038988  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3368  NERD domain protein  29.77 
 
 		 734 aa  79.7  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355781 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2859  UvrD/REP helicase  29.89 
 
 		 690 aa  79  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1352  UvrD/REP helicase  26.62 
 
 		 712 aa  79  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.541991 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4897  UvrD/REP helicase  28.46 
 
 		 705 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0729  hypothetical protein  24.81 
 
 		 574 aa  78.6  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1246  UvrD/REP helicase  28.83 
 
 		 662 aa  78.6  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.176029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0055  UvrD/REP helicase  27.11 
 
 		 671 aa  77.8  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0545819  normal  0.378623 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0351  hypothetical protein  24.75 
 
 		 388 aa  77.8  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0328547  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0810  UvrD/REP helicase  29.92 
 
 		 703 aa  77.8  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0826  UvrD/REP helicase  29.92 
 
 		 703 aa  77.8  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0239  NERD domain-containing protein  25.12 
 
 		 579 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0422  hypothetical protein  24.4 
 
 		 554 aa  76.6  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1990  UvrD/REP helicase  26.67 
 
 		 780 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.486278  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1771  UvrD/REP helicase  30.83 
 
 		 508 aa  74.3  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.734897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2325  hypothetical protein  28.92 
 
 		 759 aa  72  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0788129  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6025  UvrD/REP helicase  28.19 
 
 		 737 aa  71.2  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3516  hypothetical protein  25.93 
 
 		 768 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0738  hypothetical protein  27.72 
 
 		 631 aa  70.1  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5351  UvrD/REP helicase  27.82 
 
 		 695 aa  69.7  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.149775 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3032  UvrD/REP family ATP-dependent DNA helicase  27.91 
 
 		 687 aa  69.7  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.722257  normal  0.242361 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0895  superfamily I DNA helicase  26.81 
 
 		 755 aa  68.6  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.531504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4504  UvrD/REP helicase  31.58 
 
 		 809 aa  68.9  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1715  UvrD/REP helicase  30.33 
 
 		 462 aa  68.9  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000356586  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1110  hypothetical protein  28.52 
 
 		 702 aa  68.2  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924141 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1080  AAA ATPase  27.23 
 
 		 1136 aa  67.8  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0110  putative DNA helicase  29.6 
 
 		 659 aa  67.8  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.609607 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5423  UvrD/REP helicase  26.28 
 
 		 821 aa  67.8  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0106532  normal  0.207547 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5264  hypothetical protein  25.42 
 
 		 617 aa  67.4  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1438  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  31.75 
 
 		 767 aa  67.4  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0481652  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4061  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  26.42 
 
 		 1107 aa  67.4  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2733  UvrD/REP helicase  28.17 
 
 		 705 aa  67  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4227  helicase, UvrD/Rep family  24.07 
 
 		 778 aa  67  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00019989  hitchhiker  0.000557099 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1135  hypothetical protein  25 
 
 		 269 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0285416  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0110  superfamily I DNA and RNA helicase  29.62 
 
 		 401 aa  65.9  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.285644  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0359  hypothetical protein  18.72 
 
 		 827 aa  64.7  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000526889  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1281  hypothetical protein  26.78 
 
 		 554 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0983409  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1359  hypothetical protein  26.78 
 
 		 554 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1463  hypothetical protein  26.45 
 
 		 626 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0515  hypothetical protein  27.69 
 
 		 558 aa  64.3  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0189041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0961  ATP-dependent DNA helicase replicase  24.17 
 
 		 776 aa  63.9  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2536  hypothetical protein  26.78 
 
 		 554 aa  63.9  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1020  hypothetical protein  26.78 
 
 		 554 aa  63.9  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.44837  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0275  hypothetical protein  26.78 
 
 		 554 aa  63.9  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0985894  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0546  hypothetical protein  26.78 
 
 		 554 aa  63.9  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.946495  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09430  DNA/RNA helicase, superfamily I  28 
 
 		 705 aa  63.5  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.260549 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1296  hypothetical protein  26.65 
 
 		 669 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0263973  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8440  UvrD/REP helicase  29.46 
 
 		 685 aa  63.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1939  NERD domain-containing protein  28.47 
 
 		 700 aa  63.5  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00843241 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0445  UvrD/REP helicase  28.57 
 
 		 515 aa  62.4  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00058157 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0467  UvrD/REP helicase  26.77 
 
 		 603 aa  63.2  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.82885  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0956  UvrD/REP helicase  25.31 
 
 		 778 aa  62.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161891  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  25.68 
 
 		 689 aa  62.4  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000433537  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3351  NERD domain-containing protein  26.85 
 
 		 557 aa  62  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164276  hitchhiker  0.000169391 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1774  hypothetical protein  26.83 
 
 		 573 aa  62  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245885  hitchhiker  0.0000023235 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2539  UvrD/Rep helicase family protein  25.68 
 
 		 689 aa  61.6  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000078955  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  25.68 
 
 		 689 aa  61.6  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000183326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>