More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05873 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05873  nitric oxide reductase regulator  100 
 
 
542 aa  1118    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000451  transcriptional regulator  94.11 
 
 
543 aa  1060    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.219758  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1287  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.25 
 
 
452 aa  294  3e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.541874  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5424  sigma-54 dependent transcriptional regulator  36.52 
 
 
505 aa  294  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0098  Fis family transcriptional regulator  36.62 
 
 
510 aa  291  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2245  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.13 
 
 
460 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5583  Fis family transcriptional regulator  41.16 
 
 
508 aa  287  4e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.468143  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1577  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.05 
 
 
458 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42970  putative transcriptional regulator  35.97 
 
 
503 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.076623  normal  0.105875 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3903  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.74 
 
 
455 aa  281  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000574971 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5108  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  39.29 
 
 
684 aa  280  3e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0495  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.08 
 
 
456 aa  280  4e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3158  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.47 
 
 
462 aa  280  7e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3609  putative transcriptional regulator  35.12 
 
 
503 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.480135  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1960  response regulator transcription factor  43.06 
 
 
471 aa  276  5e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0268  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.6 
 
 
456 aa  276  7e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540037 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1016  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  44.58 
 
 
455 aa  276  7e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.963955  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2658  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.05 
 
 
458 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1347  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  42.01 
 
 
1082 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4307  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  44.94 
 
 
635 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.056389 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2521  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.98 
 
 
457 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3351  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  44.13 
 
 
465 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3819  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.88 
 
 
455 aa  274  3e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.785821  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1657  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.85 
 
 
456 aa  274  3e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0365007  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1129  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  41.74 
 
 
453 aa  274  4.0000000000000004e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1698  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.78 
 
 
457 aa  274  4.0000000000000004e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000740904 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2678  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.95 
 
 
457 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0173  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.62 
 
 
463 aa  273  5.000000000000001e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.127235  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1397  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.5 
 
 
458 aa  273  8.000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0555  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.08 
 
 
457 aa  272  9e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4327  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  40.28 
 
 
875 aa  271  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0812  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.9 
 
 
453 aa  271  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0257022  hitchhiker  0.00000328811 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1739  Sigma 54 interacting domain protein  43.46 
 
 
479 aa  271  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0283  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.34 
 
 
456 aa  271  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2915  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  38.31 
 
 
457 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2914  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.27 
 
 
459 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4192  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.53 
 
 
454 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00227342  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0079  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  47.49 
 
 
433 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.819278  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2345  two component signal transduction response regulator  43.43 
 
 
455 aa  270  4e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00459366  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3407  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.39 
 
 
458 aa  270  4e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1624  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  42.52 
 
 
561 aa  270  5e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.714408  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1826  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.67 
 
 
455 aa  270  7e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.048867  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0372  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  42.98 
 
 
461 aa  269  8e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02780  vanadium nitrogenase sigma54-dependent transcriptional activator, VnfA  42.54 
 
 
522 aa  269  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274487  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0050  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.43 
 
 
515 aa  268  1e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0532507 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0970  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.43 
 
 
459 aa  269  1e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000694494  normal  0.524712 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3723  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  37.14 
 
 
521 aa  269  1e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.946977  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2718  two component signal transduction response regulator  40.26 
 
 
467 aa  268  2e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0344  two component Fis family transcriptional regulator  41.93 
 
 
452 aa  268  2e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0882822  normal  0.355114 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2772  NifA subfamily transcriptional regulator  36.51 
 
 
516 aa  267  2.9999999999999995e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229167  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0570  NifA subfamily transcriptional regulator  34.94 
 
 
508 aa  267  4e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.106051  normal  0.50757 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3095  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  35.55 
 
 
575 aa  267  4e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.458911 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0302  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  43.8 
 
 
353 aa  266  5e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3356  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.61 
 
 
484 aa  266  5.999999999999999e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2145  two component signal transduction response regulator  37.45 
 
 
492 aa  266  8e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1320  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  36.57 
 
 
460 aa  265  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2013  C4-dicarboxylate transport transcriptional regulatory protein  37.47 
 
 
453 aa  265  1e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.618445  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49020  sigma54-dependent transcriptional activator for the iron only nitrogenase, AnfA  43.06 
 
 
537 aa  265  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4907  putative response regulator in two-component reguatory system, sigma54 dependent transcriptional regulator  45.07 
 
 
452 aa  265  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.412473 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6059  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  44.86 
 
 
458 aa  264  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0839917 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1625  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  39.29 
 
 
544 aa  265  2e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0165781  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0085  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  46.28 
 
 
435 aa  265  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3226  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  43.16 
 
 
335 aa  265  2e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2310  sigma-54 dependent response regulator  40 
 
 
478 aa  264  2e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1956  sigma-54 dependent transcriptional regulator/response regulator FleR  44.35 
 
 
471 aa  264  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.75595  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1364  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.08 
 
 
447 aa  264  3e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.885668  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1655  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.54 
 
 
462 aa  264  3e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000025661  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2591  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.98 
 
 
457 aa  264  4e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313706  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1807  two component Fis family transcriptional regulator  40 
 
 
440 aa  263  4e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4540  Fis family transcriptional regulator  52 
 
 
607 aa  263  4e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0903  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  40.29 
 
 
693 aa  263  4.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.10284 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2519  putative sigma54 specific transcriptional regulator  38.21 
 
 
517 aa  263  6e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.431147  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0884  NifA subfamily transcriptional regulator  43.06 
 
 
539 aa  263  6e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.871675 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0018  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.26 
 
 
461 aa  263  6.999999999999999e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.709029  normal  0.924426 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2510  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.43 
 
 
472 aa  263  8e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0791346  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3217  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  38.42 
 
 
501 aa  262  8.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1635  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.27 
 
 
457 aa  263  8.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3475  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.1 
 
 
453 aa  262  8.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0804749 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5444  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  43.39 
 
 
515 aa  262  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.408228 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1258  two component Fis family transcriptional regulator  44.97 
 
 
486 aa  262  1e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5460  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  42.01 
 
 
650 aa  262  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.665291  normal  0.225769 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1013  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.55 
 
 
456 aa  262  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0616674 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4854  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  41.13 
 
 
541 aa  262  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.246176  normal  0.0147757 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1472  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  44.62 
 
 
451 aa  262  1e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1495  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  35.9 
 
 
458 aa  261  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.301103  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4389  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.51 
 
 
495 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.205713  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1228  Fis family transcriptional regulator  42.81 
 
 
549 aa  261  2e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5187  two-component response regulator PilR  40.46 
 
 
445 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2330  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.99 
 
 
466 aa  261  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3413  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.82 
 
 
453 aa  261  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1319  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.48 
 
 
452 aa  261  2e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2453  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.81 
 
 
461 aa  261  3e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000196128  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60260  two-component response regulator PilR  39.88 
 
 
445 aa  261  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000831057 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2057  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.99 
 
 
448 aa  260  4e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2845  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  44.38 
 
 
454 aa  260  4e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1696  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.08 
 
 
481 aa  260  4e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.481364  normal  0.940549 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3091  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.04 
 
 
457 aa  260  5.0000000000000005e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3335  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  47.1 
 
 
458 aa  260  5.0000000000000005e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1748  transcriptional regulator, NifA, Fis Family  41.77 
 
 
542 aa  259  6e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6322  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.21 
 
 
458 aa  260  6e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.385665 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>